ПРограмма

[fee-lee]

Подскажите, пожалуйста.
Нет ли такой программы, что бы дать ей определенное количество разных многоугольников, а она построит из всего этого объемную фигуру?
Заранее благодарен.

[Marxist]

Ну сразу хочется спросить: А ЗАЧЕМ?
Сформулируйте задачу и требуемый результат почётче, может, кто что знает.

[slavert]

наверное всякие программы по архитектурному дизайну это могут, только они стоят $$$

[Marxist]

Кстати, что-то типа автокада, возможно.

[fee-lee]

Многоугольники, образованые молекулами, образуют многогранник. Мне нужно узнать как построить этот многогранник, чтобы потом его сунуть в HyperChem и обсчитывать далее.

[eukar]

Очень неопределенно все же. Если каждую из N молекул разместить на грани M-гранника, где M>=N, то получится вполне себе один из искомых многогранников. Разве нет?

[ИСН]

Какие многогранники? Фуллерены, что ли?

[eukar]

Какие многогранники? Фуллерены, что ли?

Многоугольники, образованые молекулами, образуют многогранник.

Я об этих...

[ИСН]

Это я понял. Теперь понять бы, что именно автор темы назвал "Многоугольники, образованые молекулами".

[fee-lee]

Нет. Речь идет о воде и многоугольники разные есть пяти- и шестиугольники.

[eukar]

Так... Речь, оказывается, идет о воде.
Еще что0нибудь расскажете? Например, что это за пяти- и шестиугольники, и что вы в итоге хотите получить?

[ИСН]

Вах! Водяной фуллерен.

[Marxist]

Вообще для расчётов воды существует туча программ, поэтому надо конкретнее.

[barsergey]

Я так думаю, что челу надо нарисовать и побаловаться с фулеренами, нанотрубкам, нанодырками, наноковрикам и прочей дребеденью.

Как бы поступил я:
1. Читаю журнал "Химия и жизнь" за этот и прошлый год.
2. Нахожу кучу статей по фулеренам, нанотрубкам, наноковрикам и прочей дребедени.
3. Нахожу Ф.И.О. аффтороф и места их работы, а также зачастую и мыло.
4. Списываюсь с ними и получаю вразумительный ответ на свой вопрос.

[fee-lee]

Надо в HyperChem'е построить модели клатратной воды. Молекулы соединяются в какую-то объемную фигуру. Количество молекул 28 или 32. Мне нужно найти как построить из молекул воды, посредством водородных связей, эту самую объемную фигуру. Грани - это пятиугольники и шестиугольники.

[Marxist]

Так может, стоит просто молекулярную динамику погонять? с какой-нибудь хорошей водой (обзор по моделям воды могу кинуть в exchange), в чём-нибудь типа GROMACS или AMBER? Если всё действительно происходит, то молдинамика должна всё показать по идее.

[fee-lee]

За обзор по моделям воды буду премного благодарен. А если есть еще ч.л. по электромагнитным воздействиям, то это будет еще лучше.
А что касаемо названных программ, то я с ними не сталкивался: можно поподробнее про них?

[Marxist]

За обзор по моделям воды буду премного благодарен. А если есть еще ч.л. по электромагнитным воздействиям, то это будет еще лучше.
А что касаемо названных программ, то я с ними не сталкивался: можно поподробнее про них?

Обзор в exchange. UPD. Что-то сегодня не закачивается, могу выслать или завтра закачать.
Это общедоступные пакеты для молекулярной динамики. Они позволяют моделировать поведение молекулярной системы во времени без использования квантовых методов или в смешанной квантово-классической системе. За более подробной информацией отсылаю на официальные сайты... их адрес знает гугл.
Но! Я посмотрел повнимательнее Ваши предыдущие слова насчёт ГиперКема. Насколько я понимаю, у Вас есть некий жёсткий каркас, в полостях которого расположены молекулы воды. И Вам надо просто изменить ориентацию этих молекул так, чтобы они оказались связаны водородными связями. Наверно, молдинамика в силах Вам помочь, хотя о возможностях гиперкема я в полной мере не осведомлён.

[fee-lee]

Нет, жесткого каркаса нет, а есть только эти молекулы и больше ничего. Чтобы не перебирать соединение молекул вручную можно задать в этих пакетах автоматическую постройку клатрата?
А про пакеты: в английском я не особо силен и у меня скачалось что-то с названием gromacs-3.3.1-1.i386.rpm что комп не понимает.
Может скажете место где он точно есть или что должно скачиваться.

[Turpentine]

А про пакеты: в английском я не особо силен и у меня скачалось что-то с названием gromacs-3.3.1-1.i386.rpm что комп не понимает.
Может скажете место где он точно есть или что должно скачиваться.

Если под виндой сидеть, то ясен пень такой файл система не поймёт, - это-ж RPM-пакет для линукса.