ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

форум для специалистов в области органической химии
organic chemistry issues discussion for professional scientists
Cherep
Сообщения: 23489
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: ЯМР 1H, интегрирование

Сообщение Cherep » Чт июн 27, 2013 7:36 pm

amge писал(а): (см. слайд 20 по ссылке).
Acrobat PDFMaker 7.0 для PowerPoint
:down:


:wink:

Cherep
Сообщения: 23489
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение Cherep » Чт июн 27, 2013 8:21 pm

Слушайте, слайд № 11 не полный. Не смущайте народ, а то у них ужасные мысли возникают.

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2050
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение amge » Пт июн 28, 2013 5:44 am

Cherep писал(а):слайд № 11 не полный.
Лекция, на которую я дал ссылку - трехлетней давности. Поэтому да, информация о наличии приборов в России применительно к сегодняшнему дню неполная.

Аватара пользователя
Vanya Ivanov
Сообщения: 1796
Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение Vanya Ivanov » Пт июн 28, 2013 8:08 am

А ва-а-ще о чем спор то? Хранить/нехранить фиды? Хранить однозначно!
Это ваша обязанность как сотрудника ресерчь отдела... ну типо .... по правилам GLP.
Хотя если быть совсем точным, то обязанность хранить первичную научную информацию возлагается на того, кто подписывает первичный научный отчет.
Если зав лаб собирает отчеты по научн. сотрудникам, то эта их гемор собирать и хранить всю первичку, а не подсовывать "поверпоинтные" или "пи-ды-эф-ные" варианты.
Я вот почти год гемороился с E\Z изомерными сигналами оксимов. Молекула антибиотика была больная и та часть сигналов ядер, которые ближе к оксимному центру или тому , что прилеплено, через оксим - раз-два-яицца. Причем это все еще зависело от сольватационных эффектов, то так, то эдак. А остальные сигналы красивые и одинокие. Другие методы: ESI-MS и вэжх давали однозначные результаты - чисто!
А спектроскописты ямр с матерным, университетским, высокомерием выдавали - "ПОМОЙКА". Тут бы ямрщикам и поковыряться в структурной химии, освежить инфу. Ан нет! Заизвесткованные сосуды, прокуренного головного мозга старых мудХХов не давали достаточно кислорода и питательных веществ для более - менее приличной работы остатков мозга.
Для меня всегда ямрщик был непререкаемым авторитетом в структурной химии и вот те на, облом!

Cherep
Сообщения: 23489
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение Cherep » Пт июн 28, 2013 10:40 am

Химик должен сидеть за прибором, а не физик.

Аватара пользователя
Biginelli
Сообщения: 6011
Зарегистрирован: Сб окт 29, 2005 11:15 pm

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение Biginelli » Пт июн 28, 2013 1:17 pm

как только появилась возможность распечатывать с ЯМРного компа
бумага, фу; прям как самописцы напомнило. Не распечатываю спектры лет 8 уже.
Tyrans descendez au cercueil!!!

maks
Сообщения: 15213
Зарегистрирован: Вс апр 19, 2009 3:32 pm

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение maks » Пт июн 28, 2013 3:52 pm

а я люблю , ну дело вкуса
кроме того иногда требовали чтобы справа видно было что Брюкер, мол число такое то
он химик, он ботаник-князь Федор , мой племянник

Cherep
Сообщения: 23489
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение Cherep » Пт июн 28, 2013 3:55 pm

Проблема чтоли параметры в картинку вывести?

Ptizza

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение Ptizza » Пт июн 28, 2013 5:57 pm

Biginelli писал(а):
как только появилась возможность распечатывать с ЯМРного компа
бумага, фу; прям как самописцы напомнило. Не распечатываю спектры лет 8 уже.
В аспирантские годы местрек был битый и немного кривоватый и мне он не пошел. Была пользователем Спинворкса. Когда переехала - оказывается надо распечатывать с ямр-ного компа, как говорили старожилы. Отказалась от спинворкса в пользу сохранения фида как бэкапа и распечаткой (в папке с фидами такая свалка, что лишний раз туда суваться не хочется). Сейчас универ купил последнюю версию местрека и все на него подсели. Пора и мне, наверное.

Аватара пользователя
Biginelli
Сообщения: 6011
Зарегистрирован: Сб окт 29, 2005 11:15 pm

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение Biginelli » Пт июн 28, 2013 7:04 pm

мол число такое то
файл в папке фида: /FID#/pdata/1/procs
##TITLE= Parameter file, XWIN-NMR Version 2.0
##JCAMPDX= 5.0
##DATATYPE= Parameter Values
##ORIGIN= UXNMR, Bruker Analytische Messtechnik GmbH
##OWNER= root
$$ Fri Nov 28 20:03:31 2003 MSK (UT+3h)
а также далее все-все параметры записи
Tyrans descendez au cercueil!!!

Аватара пользователя
Biginelli
Сообщения: 6011
Зарегистрирован: Сб окт 29, 2005 11:15 pm

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение Biginelli » Пт июн 28, 2013 7:08 pm

Сейчас универ купил последнюю версию местрека и все на него подсели. Пора и мне, наверное.
У ACD/labs есть смотрелка. Теперь freeware for academic and non-commercial use.

В MestReNovе, правда, двумерные смотрятся лучше.

Spinworks, этот продукт университета Манитобы, бесплатен: но кривоват, на мой взгляд.
Tyrans descendez au cercueil!!!

anatoliy
Сообщения: 3911
Зарегистрирован: Сб окт 04, 2008 12:46 am

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение anatoliy » Пт июн 28, 2013 7:50 pm

Если говорить об ACD, то ACD SpecManager могу посоветовать. Прикольно следить за прохождением реакции, например. Несколько спектров в столбик - очень наглядно получается. Анализировал работу студента, много положительных эмоций получил.
Особо студентам рекомендую для обучения. Мультиплеты можно распознавать. :shuffle: С точки зрения обучения очень мне понравилось.

Ptizza

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение Ptizza » Пт июн 28, 2013 8:15 pm

anatoliy писал(а): Мультиплеты можно распознавать. :shuffle:
Меня не особо задевает отсутствие расщепления или когда фенил вылазит широким синглетом. Довелось видеть шикарнейше настроенный аппарат с великолепными сигналами, но обычные ЯМР машины настроены и на 1Н и на 13С и на другие ядра. Есть сигналы и хорошо. Только если нужен двумерный како-нить спектр для хитрой дискуссии, но моя химия предсказуема, потому и местрек не скачала до сих пор, наверное.

anatoliy
Сообщения: 3911
Зарегистрирован: Сб окт 04, 2008 12:46 am

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение anatoliy » Пт июн 28, 2013 8:28 pm

Ptizza писал(а):
anatoliy писал(а): Мультиплеты можно распознавать. :shuffle:
Меня не особо задевает отсутствие расщепления или когда фенил вылазит широким синглетом. .
Я о том, что можно научиться правильно "обозвать" мультиплет. Подсчитать J и прочее... То бишь научиться работать со спектрами. Особо для студентов.
Зы: Вспоминая недавние времена, когда только после методик со спектрами деньги получал - процесс значительно ускоряет получение ДС. :lol:

Аватара пользователя
Helлен
Сообщения: 3710
Зарегистрирован: Пт ноя 20, 2009 6:14 pm

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение Helлен » Пт июн 28, 2013 9:13 pm

В MestReNovе, правда, двумерные смотрятся лучше.
Соглашусь.
На работе в основном Адвасп и АСД. Вполне устраивает.
Предпочитаю хранить фиды ибо бумажные варианты напрягают. Распечатываю их редко: зачастую, когда возникает необходимость.
Из фида можно больше извлечь, ИМХО
+ накладывать иногда спектр на спектр удобней в электронной версии, нежели высчитывать по бумажкам

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение Гесс » Пт июн 28, 2013 9:27 pm

Адвасп не ранится на 64битной машине, во всяком случае у мну. :( Пришлось уйти в спинворкс, но тут мне еще как минимум две ЯМР проги предлагали.
Адвасп имхо приятнее спиноворкса, но так как я смотрю счас ямры раз в полгода - приходится терпеть неудобства.

Аватара пользователя
Helлен
Сообщения: 3710
Зарегистрирован: Пт ноя 20, 2009 6:14 pm

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение Helлен » Пт июн 28, 2013 9:30 pm

офф-топ:
ну у нас на работе исторически сложился Адвасп на компах, а вот выпускники МГУ предпочитают АСД. Я у себя в лабе это наблюдаю.
2 чел. АСД, 1 - Местренова, я все три юзаю

Serty
Сообщения: 8177
Зарегистрирован: Пт июл 06, 2007 12:17 pm

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение Serty » Пт июн 28, 2013 9:52 pm

Я наверное сымый замшелый - как пользовался древней брукеровской прогой, так и продолжаю :D Остальные проги, если спектры чужие. Вот на днях для anatoly пришлось напрягаться, запускать ACD. Впрочем это не принципиально в чем смотреть, но сырые данные на мой взгляд намного предпочтительнее, чем готовая картинка.

Аватара пользователя
Helлен
Сообщения: 3710
Зарегистрирован: Пт ноя 20, 2009 6:14 pm

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение Helлен » Пт июн 28, 2013 9:59 pm

Впрочем это не принципиально в чем смотреть, но сырые данные на мой взгляд намного предпочтительнее, чем готовая картинка
Т.к. готовая картинка может быть обрезана "как надо" автору, а самые вкусные ненужные пики не показаны.
Знаю просто любителей причесывать спектры.. Поэтому всегда прошу фид, если не доверяю...
+ самой проще проинтегрировать

Serty
Сообщения: 8177
Зарегистрирован: Пт июл 06, 2007 12:17 pm

Re: ЯМР в орг. химии. Сводный трёп.

Сообщение Serty » Пт июн 28, 2013 10:05 pm

Helлен писал(а):...+ самой проще проинтегрировать
Не только проще, но и за 1(или 100 как я привык) можно в смеси брать разщные пики - это ускоряет разборку спектра смеси. :wink:

Ответить

Вернуться в «органическая химия / organic chemistry»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 12 гостей