Виртуальный скрининг

вопросы современной биологической химии, молекулярной биологии, химической энзимологии и смежных наук
biochem, molbio, chemical enzymology and related discussions for professionals
Marxist

Re: Виртуальный скрининг

Сообщение Marxist » Ср янв 06, 2010 8:08 pm

А по данным in vivo вообще очень мало моделей. Да и результаты испытаний, сделанных по разным методикам, плохо сравнивать. Вот только задача виртуального скрининга -- в первую очередь качественное предсказание, а не количественное.

Аватара пользователя
Vanya Ivanov
Сообщения: 1767
Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm

Re: Виртуальный скрининг

Сообщение Vanya Ivanov » Чт янв 07, 2010 12:19 am

Я согласен с Marxist-ом, ситуация когда " прочитали "без словоря" биологическая методика не воспроизводится, а прочитали "со словорем" - все нормально" к виртуальному скринингу отношения не имеет.
Однако стоит уточнить, виртуальный скрининг дает не только качественные предсказания, типа "активны - не активны". Мы четко можем предсказать относительную активность типа "больше - меньше". Например: А1 будет активней А2, но менее активней чем А3. Это не колличественные характеристики (типа А1 - 0,02 мкМ, А2 - 0,01мкМ и пт.), но методы то вычислительные, и внутри данной модели и в пределах статистических отклонений все работает нормально.

Marxist

Re: Виртуальный скрининг

Сообщение Marxist » Чт янв 07, 2010 12:23 am

Vanya Ivanov писал(а):Однако стоит уточнить, виртуальный скрининг дает не только качественные предсказания, типа "активны - не активны". Мы четко можем предсказать относительную активность типа "больше - меньше".
Это не всегда так и сильно зависит от метода. Но основная задача любого метода ВС -- обогащение базы.

Аватара пользователя
suprachemister
Сообщения: 4884
Зарегистрирован: Пн май 18, 2009 5:34 pm

Re: Виртуальный скрининг

Сообщение suprachemister » Чт янв 07, 2010 7:53 pm

nikkochem писал(а): Стали сравнивать методы введение - они оказались абсолютно разные. После повторных испытаний с указаным способом введения - все образцы прошли!
Вопрос дилетанта: а что такое "методы введение" ? :very_shuffle:

Аватара пользователя
avor
Сообщения: 12650
Зарегистрирован: Пн янв 24, 2005 1:13 pm

Re: Виртуальный скрининг

Сообщение avor » Пт янв 08, 2010 11:46 am

suprachemister писал(а): Вопрос дилетанта: а что такое "методы введение" ? :very_shuffle:
Ну, это там, например: ингаляция паров или внутривенное введение, или суппозитории, или внутримышечно или таблетки в рот, растворы на слизистую и тд.

Ответить

Вернуться в «биохимия и молекулярная биология / biochemistry and molecular biology»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 17 гостей