IR-спектры орг. соединений и механизмы реакций

Вопросы, связанные с химией вообще. Вы можете задать здесь свой вопрос, и мы постараемся на него ответить.
General chemical questions go here
Феофилакт Косичкин
Сообщения: 121
Зарегистрирован: Ср ноя 01, 2006 1:04 am

IR-спектры орг. соединений и механизмы реакций

Сообщение Феофилакт Косичкин » Вс окт 21, 2007 1:08 am

Возник такой вопрос: хочу найти в интернете базу IR-спектров орг. соединений. В частности, нужно для сравнения спектра 1,3-дибром-2-бутанона...на http://www.sigmaaldrich.com не нашел вещество вообще, в SciFinder оно есть, но IR в ссылках не увидел...есть ли еще общедоступные базы данных большого размера? Очень хотел бы также найти подобную базу для механизмов орг. реакций, в данный момент не могу найти механизм радикальной димеризации нафтола в присутствии трихлорида железа, хотя надо...Спасибо всем, кто может помочь.

helicase
Сообщения: 472
Зарегистрирован: Чт окт 11, 2007 7:43 am

Сообщение helicase » Вс окт 21, 2007 8:33 am

16000 IR, http://webbook.nist.gov/, но похоже вашего там нет

Аватара пользователя
cynnamoyl
Сообщения: 793
Зарегистрирован: Вс дек 17, 2006 3:03 pm

Re: IR-спектры орг. соединений и механизмы реакций

Сообщение cynnamoyl » Вс окт 21, 2007 5:50 pm

Феофилакт Косичкин писал(а):в данный момент не могу найти механизм радикальной димеризации нафтола в присутствии трихлорида железа, хотя надо...Спасибо всем, кто может помочь.

Так почему именно нафтола? Ето общая реакция для фенолов смотри здесь

Код: Выделить всё

Musso H. Angew. Chem., 75, 965 (1963); 

Taylor W. 1., Battersby A. R.Oxidative Coupling of Phenols, 
Marcel Dekker, Inc., New York, 1967 

Evans D. A. Pure Appl. Chem., 51, 1285 1979. 
Ибо написано: живу Я, говорит Господь, предо Мною преклонится всякое колено, и всякий язык будет исповедывать Бога. Рим 14:11

Феофилакт Косичкин
Сообщения: 121
Зарегистрирован: Ср ноя 01, 2006 1:04 am

Сообщение Феофилакт Косичкин » Вс окт 21, 2007 8:42 pm

helicase писал(а):16000 IR, http://webbook.nist.gov/, но похоже вашего там нет
К сожалению да. Нет ли других вариантов?

Schlenk
Сообщения: 295
Зарегистрирован: Чт дек 08, 2005 9:18 pm

Сообщение Schlenk » Пн окт 22, 2007 1:49 am

полезная ссылка

http://riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cg ... me_top.cgi

но его там тоже нет. а в чем задача? зачем сравнивать?
Plus ça change, plus c'est la même chose

Феофилакт Косичкин
Сообщения: 121
Зарегистрирован: Ср ноя 01, 2006 1:04 am

Сообщение Феофилакт Косичкин » Пн окт 22, 2007 7:28 pm

Schlenk писал(а):полезная ссылка

http://riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cg ... me_top.cgi

но его там тоже нет. а в чем задача? зачем сравнивать?
Эту ссылочку знаю, спасибо...Задача собственно в идентификации вещества, после перегонки температура кипения фракции, в которой оно должно быть, плавающая (к тому же пришлось интерполировать, так как в литературе нашлись данные кипения только при 13 мм.рт.ст., а перегонка проводилась при 50), так что есть сомнения...

eukar

Сообщение eukar » Пн окт 22, 2007 11:14 pm

А спектр-то есть, с которым собираетесь сравнивать? Если да - покажите. В принципе не обязательно напрямую сравнивать, можно из общих соображений посмотреть похож - не похож.
Хотя ИК для идентификации соединения - это топорно как-то. Встречался со спектрами одного и того же вещества, снятыми в разных условиях или просто разными людьми (а формально все условия - те же). Так вот, различались эти спектры... чтобы не ругаться на ночь глядя, скажу просто "существенно".

Schlenk
Сообщения: 295
Зарегистрирован: Чт дек 08, 2005 9:18 pm

Сообщение Schlenk » Вт окт 23, 2007 2:06 am

если просто проверить, тогда ЯМР - и никаких проблем. ИК? как уже было сказано, ИК плохо приспособлен для таких задач.
Plus ça change, plus c'est la même chose

Феофилакт Косичкин
Сообщения: 121
Зарегистрирован: Ср ноя 01, 2006 1:04 am

Сообщение Феофилакт Косичкин » Вт окт 23, 2007 8:49 pm

Schlenk писал(а):если просто проверить, тогда ЯМР - и никаких проблем. ИК? как уже было сказано, ИК плохо приспособлен для таких задач.
Этот совет я ждал :-) Просто в данном случае речь идет не о научном исследовании, а о лабораторной работе с ограниченными методами определения веществ...NMR был в прошлый раз, теперь должена быть ИК или тонкослойная хроматография:-) ИК лабораторно существенно проще.

Феофилакт Косичкин
Сообщения: 121
Зарегистрирован: Ср ноя 01, 2006 1:04 am

Сообщение Феофилакт Косичкин » Вт окт 23, 2007 9:01 pm

eukar писал(а):А спектр-то есть, с которым собираетесь сравнивать? Если да - покажите. В принципе не обязательно напрямую сравнивать, можно из общих соображений посмотреть похож - не похож.
Хотя ИК для идентификации соединения - это топорно как-то. Встречался со спектрами одного и того же вещества, снятыми в разных условиях или просто разными людьми (а формально все условия - те же). Так вот, различались эти спектры... чтобы не ругаться на ночь глядя, скажу просто "существенно".
Спектр был, но из-за крайне низкого выхода все равно буду переделывать опыт. Насчет топорности - пока собственного опыта практически никакого, полагаюсь на немецкое оборудование...пишу из Германии. Сравнить из общих соображений была идея, нашел похожий спектр, глянул С=O группу - не подходит...но вопрос был даже больше общий, поскольку понадобится еще не раз...слышал, что есть программы, рассчитывающие ИК - никто не сталкивался? Помогло бы в подобных случаях, если вещества нет в базе.

eukar

Сообщение eukar » Вт окт 23, 2007 9:54 pm

Феофилакт Косичкин писал(а):
eukar писал(а):А спектр-то есть, с которым собираетесь сравнивать? Если да - покажите. В принципе не обязательно напрямую сравнивать, можно из общих соображений посмотреть похож - не похож.
Хотя ИК для идентификации соединения - это топорно как-то. Встречался со спектрами одного и того же вещества, снятыми в разных условиях или просто разными людьми (а формально все условия - те же). Так вот, различались эти спектры... чтобы не ругаться на ночь глядя, скажу просто "существенно".
Спектр был, но из-за крайне низкого выхода все равно буду переделывать опыт. Насчет топорности - пока собственного опыта практически никакого, полагаюсь на немецкое оборудование...пишу из Германии. Сравнить из общих соображений была идея, нашел похожий спектр, глянул С=O группу - не подходит...но вопрос был даже больше общий, поскольку понадобится еще не раз...слышал, что есть программы, рассчитывающие ИК - никто не сталкивался? Помогло бы в подобных случаях, если вещества нет в базе.
Точность расчета не превышает 50-100 см-1, этого совершенно не достаточно для идентификации. Повторюсь - ИК позволяет в удачных случаях идентифицировать соединение с точностью до класса (функциональной группы).

Аватара пользователя
surius
Сообщения: 1489
Зарегистрирован: Пт сен 21, 2007 11:20 am

Сообщение surius » Ср окт 24, 2007 7:38 am

Повторюсь - ИК позволяет в удачных случаях идентифицировать соединение с точностью до класса
Так оно и есть... но если мы говорим не об исследовании абстрактного вещества, а об подтверждении структуры ожидаемого вещества, то ИК-фурье, в лаб. условиях представляется весьма дешевым и экспресным методом, не требующим особых затрат.
Да и если по большему счету, то вообще ИК не является абсолютным методом определения структуры-т.е. не имея каких либо входных данных об исследуемом веществе не представляется возможным однозначно определить его структуру... И ровно таким же образом дело обстоит и с ЯМР- хотя, конечно об более информативен, но на больших молекулах также не однозначен

helicase
Сообщения: 472
Зарегистрирован: Чт окт 11, 2007 7:43 am

Сообщение helicase » Ср окт 24, 2007 11:24 am

surius писал(а):хотя, конечно об более информативен, но на больших молекулах также не однозначен
Cкорее, больших и малосимметричных. А теоретический расчет не такая уж глупая затея. Для согласования расчетных и экспериментльных данных часто используют масштабирование силовых полей (корректирующие множители для частот) Можно попробовать найти, кто считал родственные структуры и попробовать посчитать самому. Все зависит от плотности колебательных состояний. Грубо говоря, при высокой плотности нужен точный расчет, а если не очень, то и 30 см-1 сойдет.

Аватара пользователя
surius
Сообщения: 1489
Зарегистрирован: Пт сен 21, 2007 11:20 am

Сообщение surius » Ср окт 24, 2007 11:35 am

helicase писал(а): ...А теоретический расчет не такая уж глупая затея...
Затея далеко не глупая, но на практике натыкается на ряд трудностей... По факту оказывается проще (дешевле, быстрее) снять реальный спектр соединения, нежели синтетику провести его общет самостоятельно. Тому море проблем...
А еще зачастую ИК'ают не для определения всей структуры, а для подтверждения наличия тех или иных (появившихся или ушедших) функциональных групп, т.е. весь диапазон не анализируется, анализируются только отдельные области....

helicase
Сообщения: 472
Зарегистрирован: Чт окт 11, 2007 7:43 am

Сообщение helicase » Ср окт 24, 2007 12:00 pm

surius писал(а): По факту оказывается проще (дешевле, быстрее) снять реальный спектр соединения, нежели синтетику провести его общет самостоятельно. Тому море проблем...
А еще зачастую ИК'ают не для определения всей структуры, а для подтверждения наличия тех или иных (появившихся или ушедших) функциональных групп, т.е. весь диапазон не анализируется, анализируются только отдельные области....
А лучше и то, и другое. И можно без хлеба. Тем более, если у синтетика есть сомнения в чистоте вещества. Встречаются работы, где полный спектр использовался для подтверждения мол. структуры среди набора возможных изомеров. Разумеется, это расчеты высокого уровня точности. Им предшествует, как правило, большая предварительная методическая работа.

Аватара пользователя
surius
Сообщения: 1489
Зарегистрирован: Пт сен 21, 2007 11:20 am

Сообщение surius » Ср окт 24, 2007 12:16 pm

helicase- вы представте такую работу выполнить не на высокопроизводительной системе на обычной домашней "помойке" (и это еще хорошо если это будет П4), а если П3 :!: :?:
Когда мне дома вдумывается что либо считать то выглядит это примерно так:
Включаю WINAMP, FAR... запускаю расчет... и комп превращается в mp3 плеер.

PS FAR только для того чтоб промежуточные результаты просматривать (.LOG)

eukar

Сообщение eukar » Ср окт 24, 2007 12:20 pm

helicase писал(а):
surius писал(а): По факту оказывается проще (дешевле, быстрее) снять реальный спектр соединения, нежели синтетику провести его общет самостоятельно. Тому море проблем...
А еще зачастую ИК'ают не для определения всей структуры, а для подтверждения наличия тех или иных (появившихся или ушедших) функциональных групп, т.е. весь диапазон не анализируется, анализируются только отдельные области....
А лучше и то, и другое. И можно без хлеба. Тем более, если у синтетика есть сомнения в чистоте вещества. Встречаются работы, где полный спектр использовался для подтверждения мол. структуры среди набора возможных изомеров. Разумеется, это расчеты высокого уровня точности. Им предшествует, как правило, большая предварительная методическая работа.
Вот именно! Имхо, чтобы поставить работу по расчету спектра и определению, какой из изомеров получился, человек должен перестать быть органиком, а стать матерым расчетчиком. Если бы средний (да пусть даже хороший) органик мог запустить расчет спектра для подтверждения структуры своего изомера, то хороший физхимик уже написал бы программу для расчета ИК спектра любого соединения.
Или я не прав - уже написал, и у меня просто устаревшая информация?
ЗЫ действительно интересно, какая ситуация сейчас с этим.

helicase
Сообщения: 472
Зарегистрирован: Чт окт 11, 2007 7:43 am

Сообщение helicase » Ср окт 24, 2007 12:39 pm

eukar писал(а): Вот именно! Имхо, чтобы поставить работу по расчету спектра и определению, какой из изомеров получился, человек должен перестать быть органиком, а стать матерым расчетчиком. Если бы средний (да пусть даже хороший) органик мог запустить расчет спектра для подтверждения структуры своего изомера, то хороший физхимик уже написал бы программу для расчета ИК спектра любого соединения.
Или я не прав - уже написал, и у меня просто устаревшая информация?
ЗЫ действительно интересно, какая ситуация сейчас с этим.
Ну, Вы не далеки от истины. Такие программы написаны и позволяют решать прямые колебательные задачи в гармоническом приближении. Да тот же гамесс, гауссиан, природа. Да, обычно считает не тот, кто синтезировал
Последний раз редактировалось helicase Ср окт 24, 2007 12:43 pm, всего редактировалось 1 раз.

eukar

Сообщение eukar » Ср окт 24, 2007 12:42 pm

И как точность? То, что выше написано - про такие системы?
Просто что писал я - про 50-100 см-1 - это поиск по базам и всевозможное хемометрическое комбинирование.

Marxist

Сообщение Marxist » Ср окт 24, 2007 12:42 pm

По ИК смесюги можно её состав неплохо определять с помощью анализа главных компонент.

Ответить

Вернуться в «общехимические вопросы / general chemical issues»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 4 гостя