IR-спектры орг. соединений и механизмы реакций
-
Феофилакт Косичкин
- Сообщения: 121
- Зарегистрирован: Ср ноя 01, 2006 1:04 am
IR-спектры орг. соединений и механизмы реакций
Возник такой вопрос: хочу найти в интернете базу IR-спектров орг. соединений. В частности, нужно для сравнения спектра 1,3-дибром-2-бутанона...на http://www.sigmaaldrich.com не нашел вещество вообще, в SciFinder оно есть, но IR в ссылках не увидел...есть ли еще общедоступные базы данных большого размера? Очень хотел бы также найти подобную базу для механизмов орг. реакций, в данный момент не могу найти механизм радикальной димеризации нафтола в присутствии трихлорида железа, хотя надо...Спасибо всем, кто может помочь.
16000 IR, http://webbook.nist.gov/, но похоже вашего там нет
Re: IR-спектры орг. соединений и механизмы реакций
Феофилакт Косичкин писал(а):в данный момент не могу найти механизм радикальной димеризации нафтола в присутствии трихлорида железа, хотя надо...Спасибо всем, кто может помочь.
Так почему именно нафтола? Ето общая реакция для фенолов смотри здесь
Код: Выделить всё
Musso H. Angew. Chem., 75, 965 (1963);
Taylor W. 1., Battersby A. R.Oxidative Coupling of Phenols,
Marcel Dekker, Inc., New York, 1967
Evans D. A. Pure Appl. Chem., 51, 1285 1979. Ибо написано: живу Я, говорит Господь, предо Мною преклонится всякое колено, и всякий язык будет исповедывать Бога. Рим 14:11
-
Феофилакт Косичкин
- Сообщения: 121
- Зарегистрирован: Ср ноя 01, 2006 1:04 am
К сожалению да. Нет ли других вариантов?helicase писал(а):16000 IR, http://webbook.nist.gov/, но похоже вашего там нет
полезная ссылка
http://riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cg ... me_top.cgi
но его там тоже нет. а в чем задача? зачем сравнивать?
http://riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cg ... me_top.cgi
но его там тоже нет. а в чем задача? зачем сравнивать?
Plus ça change, plus c'est la même chose
-
Феофилакт Косичкин
- Сообщения: 121
- Зарегистрирован: Ср ноя 01, 2006 1:04 am
Эту ссылочку знаю, спасибо...Задача собственно в идентификации вещества, после перегонки температура кипения фракции, в которой оно должно быть, плавающая (к тому же пришлось интерполировать, так как в литературе нашлись данные кипения только при 13 мм.рт.ст., а перегонка проводилась при 50), так что есть сомнения...Schlenk писал(а):полезная ссылка
http://riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cg ... me_top.cgi
но его там тоже нет. а в чем задача? зачем сравнивать?
-
eukar
А спектр-то есть, с которым собираетесь сравнивать? Если да - покажите. В принципе не обязательно напрямую сравнивать, можно из общих соображений посмотреть похож - не похож.
Хотя ИК для идентификации соединения - это топорно как-то. Встречался со спектрами одного и того же вещества, снятыми в разных условиях или просто разными людьми (а формально все условия - те же). Так вот, различались эти спектры... чтобы не ругаться на ночь глядя, скажу просто "существенно".
Хотя ИК для идентификации соединения - это топорно как-то. Встречался со спектрами одного и того же вещества, снятыми в разных условиях или просто разными людьми (а формально все условия - те же). Так вот, различались эти спектры... чтобы не ругаться на ночь глядя, скажу просто "существенно".
-
Феофилакт Косичкин
- Сообщения: 121
- Зарегистрирован: Ср ноя 01, 2006 1:04 am
Этот совет я ждалSchlenk писал(а):если просто проверить, тогда ЯМР - и никаких проблем. ИК? как уже было сказано, ИК плохо приспособлен для таких задач.
-
Феофилакт Косичкин
- Сообщения: 121
- Зарегистрирован: Ср ноя 01, 2006 1:04 am
Спектр был, но из-за крайне низкого выхода все равно буду переделывать опыт. Насчет топорности - пока собственного опыта практически никакого, полагаюсь на немецкое оборудование...пишу из Германии. Сравнить из общих соображений была идея, нашел похожий спектр, глянул С=O группу - не подходит...но вопрос был даже больше общий, поскольку понадобится еще не раз...слышал, что есть программы, рассчитывающие ИК - никто не сталкивался? Помогло бы в подобных случаях, если вещества нет в базе.eukar писал(а):А спектр-то есть, с которым собираетесь сравнивать? Если да - покажите. В принципе не обязательно напрямую сравнивать, можно из общих соображений посмотреть похож - не похож.
Хотя ИК для идентификации соединения - это топорно как-то. Встречался со спектрами одного и того же вещества, снятыми в разных условиях или просто разными людьми (а формально все условия - те же). Так вот, различались эти спектры... чтобы не ругаться на ночь глядя, скажу просто "существенно".
-
eukar
Точность расчета не превышает 50-100 см-1, этого совершенно не достаточно для идентификации. Повторюсь - ИК позволяет в удачных случаях идентифицировать соединение с точностью до класса (функциональной группы).Феофилакт Косичкин писал(а):Спектр был, но из-за крайне низкого выхода все равно буду переделывать опыт. Насчет топорности - пока собственного опыта практически никакого, полагаюсь на немецкое оборудование...пишу из Германии. Сравнить из общих соображений была идея, нашел похожий спектр, глянул С=O группу - не подходит...но вопрос был даже больше общий, поскольку понадобится еще не раз...слышал, что есть программы, рассчитывающие ИК - никто не сталкивался? Помогло бы в подобных случаях, если вещества нет в базе.eukar писал(а):А спектр-то есть, с которым собираетесь сравнивать? Если да - покажите. В принципе не обязательно напрямую сравнивать, можно из общих соображений посмотреть похож - не похож.
Хотя ИК для идентификации соединения - это топорно как-то. Встречался со спектрами одного и того же вещества, снятыми в разных условиях или просто разными людьми (а формально все условия - те же). Так вот, различались эти спектры... чтобы не ругаться на ночь глядя, скажу просто "существенно".
Так оно и есть... но если мы говорим не об исследовании абстрактного вещества, а об подтверждении структуры ожидаемого вещества, то ИК-фурье, в лаб. условиях представляется весьма дешевым и экспресным методом, не требующим особых затрат.Повторюсь - ИК позволяет в удачных случаях идентифицировать соединение с точностью до класса
Да и если по большему счету, то вообще ИК не является абсолютным методом определения структуры-т.е. не имея каких либо входных данных об исследуемом веществе не представляется возможным однозначно определить его структуру... И ровно таким же образом дело обстоит и с ЯМР- хотя, конечно об более информативен, но на больших молекулах также не однозначен
Cкорее, больших и малосимметричных. А теоретический расчет не такая уж глупая затея. Для согласования расчетных и экспериментльных данных часто используют масштабирование силовых полей (корректирующие множители для частот) Можно попробовать найти, кто считал родственные структуры и попробовать посчитать самому. Все зависит от плотности колебательных состояний. Грубо говоря, при высокой плотности нужен точный расчет, а если не очень, то и 30 см-1 сойдет.surius писал(а):хотя, конечно об более информативен, но на больших молекулах также не однозначен
Затея далеко не глупая, но на практике натыкается на ряд трудностей... По факту оказывается проще (дешевле, быстрее) снять реальный спектр соединения, нежели синтетику провести его общет самостоятельно. Тому море проблем...helicase писал(а): ...А теоретический расчет не такая уж глупая затея...
А еще зачастую ИК'ают не для определения всей структуры, а для подтверждения наличия тех или иных (появившихся или ушедших) функциональных групп, т.е. весь диапазон не анализируется, анализируются только отдельные области....
А лучше и то, и другое. И можно без хлеба. Тем более, если у синтетика есть сомнения в чистоте вещества. Встречаются работы, где полный спектр использовался для подтверждения мол. структуры среди набора возможных изомеров. Разумеется, это расчеты высокого уровня точности. Им предшествует, как правило, большая предварительная методическая работа.surius писал(а): По факту оказывается проще (дешевле, быстрее) снять реальный спектр соединения, нежели синтетику провести его общет самостоятельно. Тому море проблем...
А еще зачастую ИК'ают не для определения всей структуры, а для подтверждения наличия тех или иных (появившихся или ушедших) функциональных групп, т.е. весь диапазон не анализируется, анализируются только отдельные области....
helicase- вы представте такую работу выполнить не на высокопроизводительной системе на обычной домашней "помойке" (и это еще хорошо если это будет П4), а если П3
Когда мне дома вдумывается что либо считать то выглядит это примерно так:
Включаю WINAMP, FAR... запускаю расчет... и комп превращается в mp3 плеер.
PS FAR только для того чтоб промежуточные результаты просматривать (.LOG)
Когда мне дома вдумывается что либо считать то выглядит это примерно так:
Включаю WINAMP, FAR... запускаю расчет... и комп превращается в mp3 плеер.
PS FAR только для того чтоб промежуточные результаты просматривать (.LOG)
-
eukar
Вот именно! Имхо, чтобы поставить работу по расчету спектра и определению, какой из изомеров получился, человек должен перестать быть органиком, а стать матерым расчетчиком. Если бы средний (да пусть даже хороший) органик мог запустить расчет спектра для подтверждения структуры своего изомера, то хороший физхимик уже написал бы программу для расчета ИК спектра любого соединения.helicase писал(а):А лучше и то, и другое. И можно без хлеба. Тем более, если у синтетика есть сомнения в чистоте вещества. Встречаются работы, где полный спектр использовался для подтверждения мол. структуры среди набора возможных изомеров. Разумеется, это расчеты высокого уровня точности. Им предшествует, как правило, большая предварительная методическая работа.surius писал(а): По факту оказывается проще (дешевле, быстрее) снять реальный спектр соединения, нежели синтетику провести его общет самостоятельно. Тому море проблем...
А еще зачастую ИК'ают не для определения всей структуры, а для подтверждения наличия тех или иных (появившихся или ушедших) функциональных групп, т.е. весь диапазон не анализируется, анализируются только отдельные области....
Или я не прав - уже написал, и у меня просто устаревшая информация?
ЗЫ действительно интересно, какая ситуация сейчас с этим.
Ну, Вы не далеки от истины. Такие программы написаны и позволяют решать прямые колебательные задачи в гармоническом приближении. Да тот же гамесс, гауссиан, природа. Да, обычно считает не тот, кто синтезировалeukar писал(а): Вот именно! Имхо, чтобы поставить работу по расчету спектра и определению, какой из изомеров получился, человек должен перестать быть органиком, а стать матерым расчетчиком. Если бы средний (да пусть даже хороший) органик мог запустить расчет спектра для подтверждения структуры своего изомера, то хороший физхимик уже написал бы программу для расчета ИК спектра любого соединения.
Или я не прав - уже написал, и у меня просто устаревшая информация?
ЗЫ действительно интересно, какая ситуация сейчас с этим.
Последний раз редактировалось helicase Ср окт 24, 2007 12:43 pm, всего редактировалось 1 раз.
-
eukar
-
Marxist
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 2 гостя