Ацилирование спиртов пентафторфениловыми эфирами
Ацилирование спиртов пентафторфениловыми эфирами
Коллеги, если взять в растворителе алифатический спирт, пентафторфениловый эфир (немного в избытке) и добавить DMAP, то минут за 5-10 спирт полностью проацилируется, что легко проверить по по ТСХ.
Вопрос, собственно, следующий: не подскажет ли кто, на какую толковую статью можно сослаться при описании такого превращения? В реаксисе примеров много, и я, конечно, там копаюсь, но вот не помнит ли кто-нибудь навскидку подходящей методической статьи?
Вопрос, собственно, следующий: не подскажет ли кто, на какую толковую статью можно сослаться при описании такого превращения? В реаксисе примеров много, и я, конечно, там копаюсь, но вот не помнит ли кто-нибудь навскидку подходящей методической статьи?
Re: Ацилирование спиртов пентафторфениловыми эфирами
Обычно Pfp-эфиры N-защищенных аминокислот используют в пептидном синтезе благодаря тому, что они кристалличны(почти все), хорошо хранятся, быстро реагируют и слабо рацемизуются. А для образования сложноэфирной связи у них нет никаких преимуществ перед другими методами и, следовательно, методическую статью на эту тему Вы вряд ли найдете. Тот факт, что активированный эфир в присутствии DMAP и спирта дает сложный эфир, ИМХО не обязательно подтверждать ссылкой на литературу.
Re: Ацилирование спиртов пентафторфениловыми эфирами
Научные работники часто пекут публикации ради публикаций, не задумываясь о реальных преимуществах методов. На это и надежда.Nickolas писал(а):для образования сложноэфирной связи у <пентафторфениловых эфиров> нет никаких преимуществ перед другими методами и, следовательно, методическую статью на эту тему Вы вряд ли найдете.
Но будет ли это хорошим тоном?Nickolas писал(а):Тот факт, что активированный эфир в присутствии DMAP и спирта дает сложный эфир, ИМХО не обязательно подтверждать ссылкой на литературу.
Re: Ацилирование спиртов пентафторфениловыми эфирами
Nickolas полностью прав, известны эти эфиры довольно давно (ссылку, где их применили впервые, у меня не спрашивайте, я пептидами не занимаюсьгаер* писал(а):будет ли это хорошим тоном?
Когда начинает изменять память, практики заводят записную книжку, а романтики садятся писать мемуары.
Re: Ацилирование спиртов пентафторфениловыми эфирами
Ок, представьте теперь, что Вы - автор паршивенькой (в каком-нибудь Synth. Commun.) методической статьи по этой теме. И тут кто-то публикует нечто (пусть и биологическое), где такая реакция - ключевая стадия, и без ссылки. Обидно, нет? И в этом случае под давлением методистов дело со 100-ной вероятностью доводится до печати corrections.Ahha писал(а): реакция их <пентафторфениловых эфиров> со спиртами выглядит <...> совершенно естественной и предсказуемой. Так что, мне кажется, если вы не станете напирать на то, что вы - первооткрыватель такой реакции, никто ничего не заметит, и никаких претензий к вам не будет.
Слава богу, до статьи пока далеко и есть время изучить литературу.
Re: Ацилирование спиртов пентафторфениловыми эфирами
Встречал переэтерификацию п-нитрофениловых эфиров с использованием имидазола, по-моему в пептидном практикуме Bodanszky, может там и про ДМАП чего будет.
Ищите и обрящите.
Re: Ацилирование спиртов пентафторфениловыми эфирами
По смыслу это та же реакция Ямагучи, только в профиль, и не того препаративного уровня: http://www.organic-chemistry.org/namedr ... ation.shtm .
Да, как уходящая группа такой фенолят - не фонтан по сравнению с трихлоробензоатом, но это не проблема, ну разве что греть немного прийдётся.
Да, как уходящая группа такой фенолят - не фонтан по сравнению с трихлоробензоатом, но это не проблема, ну разве что греть немного прийдётся.
Re: Ацилирование спиртов пентафторфениловыми эфирами
Ну ангидриды видимо по-активнее все же чем активированные эфиры. Ведь синтез активированных эфиров из смешанных ангидридов широко известен, хотя бы наш соотечественник В.Ф. Позднев с его о-нитрофениловыми эфирами из бок-дикарбоната. А вот синтеза ангидридов из активированных эфиров не встречал, но может он и есть..хз..
Ищите и обрящите.
Re: Ацилирование спиртов пентафторфениловыми эфирами
Хотя любимая пептидная база Lit-Q ничего не выдала на пересечении DMAP & pentafluorophenyl, memory still works
see p.847:
Atherton, E., Cameron, L. R., & Sheppard, R. C. (1988). Peptide synthesis: Part 10. Use of pentafluorophenyl esters of fluorenylmethoxycarbonylamino acids in solid phase peptide synthesis. Tetrahedron, 44(3), 843-857.
Присовокупил результаты поиска - для комплетистов.
-=Upstream=-
(в самый неподходящий момент рухнула ХР вместе с форумным паролем паролем)
Atherton, E., Cameron, L. R., & Sheppard, R. C. (1988). Peptide synthesis: Part 10. Use of pentafluorophenyl esters of fluorenylmethoxycarbonylamino acids in solid phase peptide synthesis. Tetrahedron, 44(3), 843-857.
Присовокупил результаты поиска - для комплетистов.
-=Upstream=-
(в самый неподходящий момент рухнула ХР вместе с форумным паролем паролем)
Re: Ацилирование спиртов пентафторфениловыми эфирами
Upstream ! !
Старик Шеппард борозды не портит! А что выход не количественный, так мне нужно вчитаться внимательнее, в чём тут может быть дело. DMAP ведь может подваливать Fmoc, если всё не совсем безводно. К счастью, у нас никакого Fmoc'а нет! Прикольно, что в 1988 году я как раз выписывал Tetrahedron...
Старик Шеппард борозды не портит! А что выход не количественный, так мне нужно вчитаться внимательнее, в чём тут может быть дело. DMAP ведь может подваливать Fmoc, если всё не совсем безводно. К счастью, у нас никакого Fmoc'а нет! Прикольно, что в 1988 году я как раз выписывал Tetrahedron...
Re: Ацилирование спиртов пентафторфениловыми эфирами
<offtopic on>
DMAP -- это фигня. Вот пролин, которого ацилируют Fmoc-аминокислотой -- это адъ, а про это мало кто знает, хотя описано в 1979-м.
<offtopic off>
DMAP -- это фигня. Вот пролин, которого ацилируют Fmoc-аминокислотой -- это адъ, а про это мало кто знает, хотя описано в 1979-м.
<offtopic off>
Re: Ацилирование спиртов пентафторфениловыми эфирами
>Старик Шеппард борозды не портит!
Конечно, он на порядок грамотнее и честнее нынешних самопровозглашённых "классиков" моего поколения, но на совести его много неозвученных и не прокачанных проблем Fmoc-химии на полиамидах. В своём меморандуме середины 70-х он - apriori(!) - позиционировал свой подход как более прогрессивный во всех отношениях по сравнению с Вос-полистирольным вариантом. Перед уходом на отдых он уже так не считал, так как его ожидания, мягко говоря, не оправдались. В устной форме он признавал, что его подход оказался не лучше Boc-PS (сам слышал в 1993), но опубликовать эти выводы в явном виде духу у него не хватило. Ожидать честного признания status quo от нынешних ранне-успешных также не приходится: все они в той или иной степени внесли свой вклад в "развитие" именно Fmoc-химии, поэтому в обзорах регулярно всплывают те самые гипотетические позитивные тезисы Шеппарда, но уже как известные факты, подтверждённые экспериментально.
>А что выход не количественный, так мне нужно вчитаться внимательнее, в чём тут может быть дело. DMAP ведь может подваливать Fmoc, если всё не совсем безводно.
Вода для этого не важна; когда в системе нет амина, способного присоединяться к дибензфульвену, последний полимеризуется с образованием нерастворимого полимера. Период полурасщепления Fmoc-Val-OH в 10% DMAP-DMF - 85 мин. Шеппард должен был прикинуть заранее и определить экспериментально ожидаемый выход побочного продукта с удвоением первого остатка, тем более, что уретаны в этих условиях ацилируются исчерпывающе - до имидов, с теми же последствиями в виде удвоения С-концевого остатка. Увы! ЕНИП, этот аспект остаётся не прояснённым и по сей день. (Расстраиваться не хотят, что ли?). Вот предельно честный Меррифильд такой вопрос не оставил бы без ответа! Он и менее вероятные осложнения (например, вероятность удвоения остатков за счёт изомеризации симметричного ангидрида в дипептид) прокачивал по полной программе, причем ещё до эпохи HPLC - на аминокислотном анализаторе.
Я это к тому, что закадровая проблема у Шеппарда была не в достижении количественного выхода, а в том, чтобы не набраться дипептиду.
В этой статье, кстати, досадная опечатка: кепирование гидроксилов уксусным ангидридом прописано ПОСЛЕ деблокирования Fmoc! Что и доблестно осуществила одна выпускница биофака недрожащей рукой, после чего синтез шёл на редкость успешно: ни одного положительного нингидринового теста!
Конечно, он на порядок грамотнее и честнее нынешних самопровозглашённых "классиков" моего поколения, но на совести его много неозвученных и не прокачанных проблем Fmoc-химии на полиамидах. В своём меморандуме середины 70-х он - apriori(!) - позиционировал свой подход как более прогрессивный во всех отношениях по сравнению с Вос-полистирольным вариантом. Перед уходом на отдых он уже так не считал, так как его ожидания, мягко говоря, не оправдались. В устной форме он признавал, что его подход оказался не лучше Boc-PS (сам слышал в 1993), но опубликовать эти выводы в явном виде духу у него не хватило. Ожидать честного признания status quo от нынешних ранне-успешных также не приходится: все они в той или иной степени внесли свой вклад в "развитие" именно Fmoc-химии, поэтому в обзорах регулярно всплывают те самые гипотетические позитивные тезисы Шеппарда, но уже как известные факты, подтверждённые экспериментально.
>А что выход не количественный, так мне нужно вчитаться внимательнее, в чём тут может быть дело. DMAP ведь может подваливать Fmoc, если всё не совсем безводно.
Вода для этого не важна; когда в системе нет амина, способного присоединяться к дибензфульвену, последний полимеризуется с образованием нерастворимого полимера. Период полурасщепления Fmoc-Val-OH в 10% DMAP-DMF - 85 мин. Шеппард должен был прикинуть заранее и определить экспериментально ожидаемый выход побочного продукта с удвоением первого остатка, тем более, что уретаны в этих условиях ацилируются исчерпывающе - до имидов, с теми же последствиями в виде удвоения С-концевого остатка. Увы! ЕНИП, этот аспект остаётся не прояснённым и по сей день. (Расстраиваться не хотят, что ли?). Вот предельно честный Меррифильд такой вопрос не оставил бы без ответа! Он и менее вероятные осложнения (например, вероятность удвоения остатков за счёт изомеризации симметричного ангидрида в дипептид) прокачивал по полной программе, причем ещё до эпохи HPLC - на аминокислотном анализаторе.
Я это к тому, что закадровая проблема у Шеппарда была не в достижении количественного выхода, а в том, чтобы не набраться дипептиду.
В этой статье, кстати, досадная опечатка: кепирование гидроксилов уксусным ангидридом прописано ПОСЛЕ деблокирования Fmoc! Что и доблестно осуществила одна выпускница биофака недрожащей рукой, после чего синтез шёл на редкость успешно: ни одного положительного нингидринового теста!
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 9 гостей