По основам Unix/Linux?

[amge]

Отдельно планируется допилить два слова про vi

Не, я с огромным уважением отношусь к людям, пытающимся освоить vi, но можно же и не "на гамаке и стоя", есть большое количество более легких в освоении консольных редакторов (да хоть тот же mcedit из midnight commander).

[Гесс]

Если вы заинтересованы только в OS то
grep " OS " *

А если OS в начале/конце строки?

Никогда не задумывался

Не, я с огромным уважением отношусь к людям, пытающимся освоить vi, но можно же и не "на гамаке и стоя", есть большое количество более легких в освоении консольных редакторов (да хоть тот же mcedit из midnight commander).

А я ни в чем другом не умею. Синдром утенка однако.
midnight commander - это звучит по линуксовски
Ок, уговорили, не буду писать про программу с высоким барьером выхода.

[uchebnik fiziki]

А то честно говоря иногда хочется вены вскрыть когда чтоб забрать файлики с кластера приходится помногу раз вводить что-нибудь типа scp *.* username@xxx.xxx.xxx:

Сначала сархивировать на кластере, потом скачать, потом разархивировать у себя. Заодно и трафик экономится.

[amge]

midnight commander - это звучит по линуксовски

Не, за эту программу фанатики true unix way заклеймят позором (а за vi, наоборот, похвалят ).

[surius]

Сначала сархивировать на кластере, потом скачать, потом разархивировать у себя. Заодно и трафик экономится.

хотел сначала возмутиться, что мол много там *.chk (основной трафико делатель) с архивируешь? А потом попробовал и действительно чек с 60 mb до 25 ужимается легко. В общем спасибо за свежую мысль, правда не уверен что нужно сильно о трафике беспокоиться

[surius]

У меня это реализовано в виде скриптика, названного scp_nusc (nusc - название кластера)

Код: Выделить всё

#!/usr/bin/perl -w 
  
s/^:/username\@xxx.xxx.xxx:/ foreach @ARGV;   
print ("scp -i $ENV{HOME}/.ssh/nusc @ARGV\n");
system ('scp', '-i', "$ENV{HOME}/.ssh/nusc", @ARGV); 

Пользоваться (из текущей директории загрузить инпуты на кластер в папку Raschet и затем выгузить оттуда ауты):
scp_nusc *.inp :Raschet
scp_nusc :Raschet/*.out .
(т.е. перед именами файлов/директорий на кластере ставить двоеточие, и все)
Авторизация у меня организована по ключу ($HOME/.ssh/nusc), но без пароля, поэтому скрипт пароль не спрашивает - очень удобно.

Скрипт нужно поместить в папку из $PATH и сделать исполняемым.

а такой простите глупый вопрос, ваш скрипт на перле, так ведь? И стало быть перл должен на кластере крутиться? А если его там нема? или скажеим так как чекнуть есть он там или нет?

[Гесс]

а такой простите глупый вопрос, ваш скрипт на перле, так ведь? И стало быть перл должен на кластере крутиться? А если его там нема? или скажеим так как чекнуть есть он там или нет?

Код: Выделить всё

which perl

[uchebnik fiziki]

хотел сначала возмутиться, что мол много там *.chk (основной трафико делатель) с архивируешь? А потом попробовал и действительно чек с 60 mb до 25 ужимается легко. В общем спасибо за свежую мысль, правда не уверен что нужно сильно о трафике беспокоиться

Ну можно не архивировать, а просто таром склеивать в один файл, это почти мгновенно делается. Меньше трафика -- меньше вероятность ошибок при копировании, особенно когда нужно несколько гигабайт качать.

Есть ещё двухпанельные файловые менеджеры, умеющие работать с удалёнными серверами. mc уже назвали, есть в кедах Krusader ещё.

[Shorku]

WinSCP еще под окна.

[Гесс]

Filezilla, но кажется только если можно законнектиться напрямую.

[amge]

а такой простите глупый вопрос, ваш скрипт на перле, так ведь? И стало быть перл должен на кластере крутиться? А если его там нема? или скажеим так как чекнуть есть он там или нет?

Суть скрипта элементарна: в аргументах заменить ":" на "user@xxx.xxx.xxx:". Проще всего и безопаснее мне это было сделать на перле, но можно и с помощью других программ (sed, awk). Почти наверняка перл на кластере есть. Как в этом убедиться, подсказал Гесс.

[surius]

Есть ещё двухпанельные файловые менеджеры, умеющие работать с удалёнными серверами. mc уже назвали, есть в кедах Krusader ещё.

Да, про такое счастье мне известно. Строго говоря, я постоянно использую FAR, он тоже с прикрученным плагином может по ssh цепляться к удаленному терминалу. С надобность копирования по средствам scp возникает из-за того что на тот кластер на котором крутиться G09 (строго говоря еще много чего) можно зайти только с другого кластера, который, в свою очередь имеет выход наружу. (internet---> терминалXXX--->кластерYYY(расчетный))

[Гесс]

Есть ещё двухпанельные файловые менеджеры, умеющие работать с удалёнными серверами. mc уже назвали, есть в кедах Krusader ещё.

Да, про такое счастье мне известно. Строго говоря, я постоянно использую FAR, он тоже с прикрученным плагином может по ssh цепляться к удаленному терминалу. С надобность копирования по средствам scp возникает из-за того что на тот кластер на котором крутиться G09 (строго говоря еще много чего) можно зайти только с другого кластера, который, в свою очередь имеет выход наружу. (internet---> терминалXXX--->кластерYYY(расчетный))

Ага, имею ту же ситуацию.

[Yu/2]

кластер на котором крутиться G09 (строго говоря еще много чего) можно зайти только с другого кластера, который, в свою очередь имеет выход наружу. (internet---> терминалXXX--->кластерYYY(расчетный))

Ага, имею ту же ситуацию.

В таких случаях, чтобы иметь "прямой" доступ на кластер, можно попытаться использовать туннелирование ssh. Но часто это не разрешено. И тогда спасает ProxyCommand http://en.wikibooks.org/wiki/OpenSSH/Co ... Jump_Hosts

[alien308]

А я монтирую по ssh директорию на кластере у себя на компютере. Естественно на Linux. В винде программы для этого разве нет?

[EvgeniX]

midnight commander - это звучит по линуксовски

Не, за эту программу фанатики true unix way заклеймят позором (а за vi, наоборот, похвалят ).

Всегда считал себя любителем UNIX (больше нравится FreeBSD, чем Linux). Но вот к vi так и не привык, вполне можно обойтись без запоминания всех сочетаний команд, а использовать стандартные сочетания кнопок в более простых редакторах. Конечно, при большом желании можно использовать vi, но это не есть обязательное требование для успешного использования *nix.

[МARS]

Есть у кого-нибудь опыт настройки FireFly в OpenMPI на кластерах (Linux x64 (Gentoo)?

В моем случаи проблема в том, что каждый нод пишет свой out файл, никак не выходит распаралелить процесс. При этом GAMESS-US R3 запустился без капризов.

[Гесс]

Каждый проц или каждая нода? Я когда то давно ставил хоть никогда и не пользовал. Посмотрю в понедельник что я там наставил.

[МARS]

Да, верно, каждый процессор, 12 нодов, 48 процессоров и 48 аутов в одном файле.

[Гесс]

Посмотрел. Я его поставил, но заморочиться с распараллеиванием не успел - меня ушли на молкас.