Сэндвичи с цинком

форум для специалистов в области органической химии
organic chemistry issues discussion for professional scientists
Ответить
giges
Сообщения: 50
Зарегистрирован: Пт сен 09, 2011 2:18 pm

Сэндвичи с цинком

Сообщение giges » Пн сен 22, 2014 8:35 pm

Здравствуйте, коллеги органики!

Недавно исследовал взаимодействие цинка с одним амилоидом, который обладает, понятное дело, амидными, фенольными, тиольными и карбокисльными группами. Взаимодействие наблюдал на ИЦР МС с разрешением 400 000 и ионизацией элеткрораспылением. И заметил, что при нагреве появляются очень интенсивные серии ZnH(-2). То есть к массе прибавляется один цинк и уходят два водорода. И в итоге у меня ушло 22 протона. Однако в молекуле нет столько полдвижных протонов. И я подумал о взаимодействии цинка с ароматическим кольцом. Ведь в газовой фазе Zn2+ должеен быть нелпохим электрофилом? И если это разумно, то цинк взаимодействует с одним кольцом или образцет типа цинкоцены (сэндвичевые соединения). Подскажите!

Спасибо!

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Сэндвичи с цинком

Сообщение Гесс » Пн сен 22, 2014 9:30 pm

Да, цинкоцен существует.
Я не особо знаком с что такое амилоид, но вот такую фигню вы учитываете? http://en.wikipedia.org/wiki/Zinc_finger

Cherep
Сообщения: 23489
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: Сэндвичи с цинком

Сообщение Cherep » Вт сен 23, 2014 5:55 pm

"Сэндвичи с цинком", когда там в качестве лигандов ароматика, не дудут потерю протонов.

Другое дело, если к примеру ушли два кислых протона (OH фенольные или спиртовые, NH амидные, не говоря уж про карбоксилаты типа глютаминовойили аспарагиновой) и на их место встал один цинк.

Но чтобы один цинк вышиб 22 протона -- это ахтунг.

giges
Сообщения: 50
Зарегистрирован: Пт сен 09, 2011 2:18 pm

Re: Сэндвичи с цинком

Сообщение giges » Вт сен 23, 2014 9:03 pm

Спасибо! Я имел ввиду, что 11 цинков выбивают 22 протона

[ Post made via iPhone ] Изображение

Cherep
Сообщения: 23489
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: Сэндвичи с цинком

Сообщение Cherep » Ср сен 24, 2014 11:54 am

Фигассе.
Я надеюсь, 11 цинков на один большой белок, а не на маленький пептид.
ПМСМ, это какие-то искусственные условия.
Был на прошлой неделе в ИБХ, там один чел докладывал про комплексообразование с амилоидным пептидом. С 40-членным штоле, не помню. Но у него в докладе один атом цинка присутствовал.

giges
Сообщения: 50
Зарегистрирован: Пт сен 09, 2011 2:18 pm

Re: Сэндвичи с цинком

Сообщение giges » Ср сен 24, 2014 11:57 am

Спасибо!!

Да, условия искуственные - 400 градусов, газовая фаза. Это все в масс-спектрометре

Аватара пользователя
ChemNavigator
Сообщения: 2143
Зарегистрирован: Пт янв 28, 2005 3:02 am

Re: Сэндвичи с цинком

Сообщение ChemNavigator » Ср сен 24, 2014 7:19 pm

giges писал(а):И в итоге у меня ушло 22 протона. Однако в молекуле нет столько полдвижных протонов.
А сколько подвижных протонов там есть?

giges
Сообщения: 50
Зарегистрирован: Пт сен 09, 2011 2:18 pm

Re: Сэндвичи с цинком

Сообщение giges » Пт сен 26, 2014 1:20 pm

18

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Сэндвичи с цинком

Сообщение Гесс » Пт сен 26, 2014 3:53 pm

А можно как то конкретнее сколько протонов какого типа?
А то какое то гадание на кофейной гуще.
Карбоксилы?
Спирты?
Альфакетонные протоны?
Протоны у двойных связей?
Арилы и гетарилы?
просто метиленовые группы безо всяких заморочек рядом?

Аватара пользователя
ChemNavigator
Сообщения: 2143
Зарегистрирован: Пт янв 28, 2005 3:02 am

Re: Сэндвичи с цинком

Сообщение ChemNavigator » Пт сен 26, 2014 8:15 pm

При 400 С могло произойти обычное дегидрирование связей C-C, C-N, C-O до соотв. двойных с потерей протонов.

Аватара пользователя
avor
Сообщения: 12650
Зарегистрирован: Пн янв 24, 2005 1:13 pm

Re: Сэндвичи с цинком

Сообщение avor » Вт сен 30, 2014 3:05 pm

Дайте ссылку на последовательность полипептида или просто впастите ее сюда. Народу будет пища для ума, а так одно гадание на кофейной гуще.

Ответить

Вернуться в «органическая химия / organic chemistry»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 6 гостей