Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический секрет

вопросы современной биологической химии, молекулярной биологии, химической энзимологии и смежных наук
biochem, molbio, chemical enzymology and related discussions for professionals
dmitryturin
Сообщения: 13
Зарегистрирован: Вт июл 22, 2014 3:38 pm

Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический секрет

Сообщение dmitryturin » Вт июл 22, 2014 3:45 pm

Подскажите, пожалуйста, среди каких групп (веществ) искать пару, удовлетворяющее следующим условиям:

1) Высвобождение энергии из макроэргической молекулы (никакой принадлежности к избитым классам веществ не требуется) возможно по нескольким путям (т.е. их два и больше)
2) Все пути, кроме одного, дают ядовитые продукты – единственных неядовитый путь требует фермента
3) Фермент крайне трудно подобрать или расчитать (в программе Розетта), т.е он составляет технологический секрет [как вариант его формула может быть угадываема-рассчитываема, но его самого крайне трудно получить, т.е. загадка переносится на исходные соединения, из которых и с помощью которых его получают]

Возможно имеет смысл последовательными приближениями искать или расчитывать сразу пару (веществ), а не фермент для уже выбранного макроэргика.
Чем эта пара может быть?

Аватара пользователя
uchebnik fiziki
Сообщения: 4265
Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение uchebnik fiziki » Вт июл 22, 2014 4:04 pm

неядовитых продуктов не существует
Свобода, равенство, братство.

Или смерть.

Аватара пользователя
avor
Сообщения: 12650
Зарегистрирован: Пн янв 24, 2005 1:13 pm

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение avor » Вт июл 22, 2014 4:35 pm

Не надо ничего рассчитывать. Надо сначала составить базу данных всех известных макроэргических веществ. Потом в этой базе найти подмножество веществ распадающееся несколькими путями. Потом найти среди полученного подмножества вещества распадающееся только на яды. Потом найти фермент который один из ядов будет инактивировать. Обязательно отпишитесь сюда, что у вас получилось.

dmitryturin
Сообщения: 13
Зарегистрирован: Вт июл 22, 2014 3:38 pm

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение dmitryturin » Вт июл 22, 2014 5:39 pm

>сначала составить базу данных
>найти подмножество
>Потом найти среди полученного подмножества

яды макроэргические кто-н может предложить?

dmitryturin
Сообщения: 13
Зарегистрирован: Вт июл 22, 2014 3:38 pm

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение dmitryturin » Вт июл 22, 2014 5:40 pm

>один из ядов будет инактивировать

разлагать?

можем ли мы избежать его получения?

Аватара пользователя
avor
Сообщения: 12650
Зарегистрирован: Пн янв 24, 2005 1:13 pm

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение avor » Вт июл 22, 2014 7:13 pm

можете можете, а может и не можете.

Например можно заингибировать один из путей превращения в яды. А можно найти еще один дополнительный путь превращения в не ядовитый продукт и катализировать его.

dmitryturin
Сообщения: 13
Зарегистрирован: Вт июл 22, 2014 3:38 pm

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение dmitryturin » Вт июл 22, 2014 7:47 pm

группы веществ назвать можете?

Аватара пользователя
avor
Сообщения: 12650
Зарегистрирован: Пн янв 24, 2005 1:13 pm

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение avor » Вт июл 22, 2014 11:10 pm

dmitryturin писал(а):группы веществ назвать можете?
Не могу, я не база данных, а заниматься поиском нет желания и мотивов.

dmitryturin
Сообщения: 13
Зарегистрирован: Вт июл 22, 2014 3:38 pm

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение dmitryturin » Ср июл 23, 2014 4:52 pm

понятно, лишь бы свистнуть (банальное)

dmitryturin
Сообщения: 13
Зарегистрирован: Вт июл 22, 2014 3:38 pm

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение dmitryturin » Ср июл 30, 2014 3:56 pm

как насчет содержащих высокоэнергетические группировки -ONO2, -NO2, -N-NO2, -N3, -NF2, триазольные, фуразановые, фуроксановые, полиазотистые и др?
какая критика или позитивные соображения приходят в голову?

Аватара пользователя
chemist
Сообщения: 10369
Зарегистрирован: Пн июл 26, 2004 2:14 am

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение chemist » Ср июл 30, 2014 6:24 pm

А зачем?
I D E A = A u

Аватара пользователя
avor
Сообщения: 12650
Зарегистрирован: Пн янв 24, 2005 1:13 pm

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение avor » Ср июл 30, 2014 6:42 pm

Вы что не поняли?! Это же хим оружие! Макроэргик - бах! И все вокруг ядовитое. И только один умник-разработчик знает, как от яда избавится специфичным веществом Х. Или такой запиральник, который при любых попытках вскрыть дверь - бах! И все вокруг ядовитое, и только один умник-разработчик знает ключ от запиральника - вещество Х, которое одно может перевести запиральное вещество в безопасное соединение.

Короче "мутант 59" и всякая другая фантастика. В курилку это надо в "антихимию" или в "лицом к лицу".

Аватара пользователя
chemist
Сообщения: 10369
Зарегистрирован: Пн июл 26, 2004 2:14 am

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение chemist » Ср июл 30, 2014 11:09 pm

Ужос-то какой! :shock: :shock: :shock:
Наверняка заказчик какой-нибудь такой: https://www.youtube.com/watch?v=UV0BlS158Dw
:mrgreen: :mrgreen: :mrgreen:
I D E A = A u

dmitryturin
Сообщения: 13
Зарегистрирован: Вт июл 22, 2014 3:38 pm

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение dmitryturin » Пт авг 01, 2014 3:44 am

эта ветка - мозговой штурм. т.е. исследовательская работа.


в голову приходит закрыть ядовитую группу еще одним белком геометрически, присоединив его к ядовитой молекуле.
соответственно либо некоторый выступ фермента должен быть настолько тонок (и длинен), чтобы пройти в некую геометрическую дырку в таком комплексе - при условии, что повреждаемые молекулы цитозоля (это все молекулы в нем или не все?) в дырку не пройдут.
либо присоединяясь, производить конформационное изменение этого комплекса таким образов, чтобы окрылся доступ к группе высоко-энергетической и ядовитой.
если в этот момент повреждаемые молекулы тоже получают доступ к ядовитой составляющей, два "либо" можно комбинировать: делать дырку искривленной, проход по которой требует конформационного (возможно не одного) изменения.
какие есть еще соображения?

4) высокоэнергетик должен быть не выделяем из клетки средствами неорганической химии (несепарируем от других?), либо после выделения при снятии энергии (сжигании в топке?) повреждать обслуживающий персонал на промышленном предприятии.


с другой стороны, на время забудем про высокоэнергетик, и обратимся к ферменту - который должен быть не подбираем специалистами (ни лабораторным путем, ни средствами вычислительной математики) при известном им высокоэнергетике.
т.е. при условии, что неизвестна ни 1ая, ни 2ая, ни 3ая структуры.
вопрос: какие классы ферментов удовлетворяют такому условию?
вопрос+: среди всех веществ вообще, не только ферментов, какие классы удовлетворяют этому условию?

dmitryturin
Сообщения: 13
Зарегистрирован: Вт июл 22, 2014 3:38 pm

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение dmitryturin » Пт авг 01, 2014 3:48 am

avor писал(а):Вы что не поняли?! Это же хим оружие! Макроэргик - бах! И все вокруг ядовитое. И только один умник-разработчик знает, как от яда избавится специфичным веществом Х. Или такой запиральник, который при любых попытках вскрыть дверь - бах! И все вокруг ядовитое, и только один умник-разработчик знает ключ от запиральника - вещество Х, которое одно может перевести запиральное вещество в безопасное соединение.

Короче "мутант 59" и всякая другая фантастика. В курилку это надо в "антихимию" или в "лицом к лицу".
макроэнергетик должен быть безвредным для клетки (до процесса снятия с него энергии).


зы.
чувак, который мыслит такими категориями, как "бах", не ходи, пожалуйста, на эту ветку.

dmitryturin
Сообщения: 13
Зарегистрирован: Вт июл 22, 2014 3:38 pm

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение dmitryturin » Пт авг 01, 2014 4:11 am

исходное (макроэнергетик) и конечные вещества (осколки, как получить которые знает умник-разработчик) должны быть безвредны.

а бинарных "оружий", которыми ты бредишь - полно. там ничего разрабатывать не надо.

Аватара пользователя
avor
Сообщения: 12650
Зарегистрирован: Пн янв 24, 2005 1:13 pm

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение avor » Пт авг 01, 2014 8:19 am

На вопрос: зачем такая хрень? клиент не отвечает. Хорошо ответте на вопрос: зачем макроэргику ядовитые продукты, если он не направлен на нанесение какого-либо вреда. И не надо мне рассказывать про бинарное хим. оружие, которым я не брежу, и пытаться увести тему в сторону. Ваша схема не как не ложится в схему классической бинарки и я это прекрасно понимаю.
Отвечайте почему в распаде должны быть ядовитые продукты, кроме одного малодоступного и не очевидного варианта известного мало кому.

Аватара пользователя
avor
Сообщения: 12650
Зарегистрирован: Пн янв 24, 2005 1:13 pm

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение avor » Пт авг 01, 2014 8:24 am

dmitryturin писал(а):чувак, который мыслит такими категориями, как "бах", не ходи, пожалуйста, на эту ветку.
А вот кто здесь чувак и кому сюда ходить предоставим решать модераторам

Cherep
Сообщения: 23433
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение Cherep » Пт авг 01, 2014 1:44 pm

если топикстартер хамит -- нажмите красную кнопку

Аватара пользователя
avor
Сообщения: 12650
Зарегистрирован: Пн янв 24, 2005 1:13 pm

Re: Макро-эргическое + фермент: разрешите технологический се

Сообщение avor » Пт авг 01, 2014 2:12 pm

Я пока терпелив. :)

Ответить

Вернуться в «биохимия и молекулярная биология / biochemistry and molecular biology»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 21 гость