Оценка pKa

[chemistryandron]

Здравствуйте!
Столкнулся со следующей проблемой. Нужно оценить значения pKa для нескольких соединений (водные и спиртовые растворы ). С помощью каких программ это можно сделать (желательно, чтобы доступными были)? Или может есть специализированные базы данных?
Заранее благодарен за помощь.

[avor]

Какие исходные данные для расчета вы будете использовать? Если никакие, кроме структурной формулы, то вы не там задали вопрос. Это вам сюда.
viewforum.php?f=71

[chemistryandron]

Какие исходные данные для расчета вы будете использовать? Если никакие, кроме структурной формулы, то вы не там задали вопрос. Это вам сюда.
viewforum.php?f=71

Спасибо за ответ. Правда не думал, что оценка pKa связана с квантовой химией. ACDLabs, к сожалению, мне не помогла и, я решил, что может быть есть что-нибудь подобное. Но, если нет, то нет.

[avor]

Я ведь тоже задал вопрос, но вы от него ушли......

[АлександрI]

Про квантово-химические методы определения рК - забудьте (они вам нужны будут, если это серьёзная работа для идентификации образующихся ионов).
Для растворов слабых электролитов (для которых, собственно, имеет смысл говорить о рК) существуют, в частности,
спектрофотометрические методы определения рК диссоциации, достаточно подробно описанные в литературе. Я в своё время определял последовательные рК для многих, кстати, органических аналитических реагентов, представляющих собой сопряжённые полиоксисоединения и содержащих до восьми гидроксильных групп. Эти материалы, в частности, присутствуют в статьях моего блога
http://alexandrfedin.blogspot.com/

[Upstream]

В помощь:
My pKa collection- download
Software and info on calculating pKas

Код: Выделить всё

http://www.compudrug.com/pkalc.html  
http://www.chemweb.com/databases
http://www.codata.org/resources/databases/index.html
http://tigger.uic.edu/~mansoori/Thermodynamic.Data.and.Property_html
http://www.radiometer-analytical.com/all_resource_centre.asp?code=126

Washburn, E. W., ed. International Critical Tables of Numerical Data: Physics, Chemistry and Technology. McGraw-Hill: New York; v. VI, p. 259-304
Washburn, E.W. (1926 - 1930;2003). International Critical Tables of Numerical Data, Physics, Chemistry and Technology (1st Electronic Edition). Knovel.
Online version available at: http://www.knovel.com/web/portal/browse ... rticalID=0
Index to Physical, Chemical and Other Property Data - Arranged by property. Indexes print and online sources (Arizona State University): http://www.asu.edu/lib/noble/chem/property.htm
Material Properties Locator Database - Produced at the University of Buffalo: libweb.lib.buffalo.edu/sel/searchSelMaterials.html
Thermodex: An Index of Selected Thermodynamic Data Handbooks - Search by title or compound. Provides list of print and online sources that contain data (University of Texas-Austin): http://www.lib.utexas.edu/thermodex/
V. Palm. Tables of Rate and Equilibrium Constants of Heterolytic Organic Reactions. Moscow-Tartu, 1975-1985
tera.chem.ut.ee/~manna/pkadata.xls
A large collection can be found in commercial DBs (ACDLabs, MDL MDDR,CMC3D) and others.
A large freely available pKa database can be found from the EPA EPIsuite's Physprop distribution. It requires to manually enter SMILES or CAS numbers. * PHYSPROP DB (frei, its not only logP but pka)

Код: Выделить всё

http:\\esc.syrres.com/interkow/physdemo.htm 
http:\\www.epa.gov/opptintr/exposure/docs/episuite.htm

The largest publicly available dataset is the freely available ChEMBL DB by EMBL-EBI DB. It is a database of ca. 500000 bioactive compounds and ADMET values. It is availabe online, with a query tool, but also offline as SDF, MYSQL and Oracle dataset.
The free DB contains around 4600 pKa values with full annotation, curated, solvents, SMILES and SDF structure codes and literature data. You can download it from ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/chembl/ or export the pKa values only to an EXCEL file. [/color]

Izutsu, K. Electrochemistry in Nonaqueous Solutions; Wiley: Weinheim, 2002; Chapter 3.
Izutsu, K. Acid-Base Dissociation Constants in Dipolar Aprotic Solvents. IUPAC Chemical Data Series No. 35, Blackwell Science, Oxford 1990.
Albert A. and Serjeant E.P. The Determination of Ionization Constants. A Laboratory Manual. 3rd ed. Chapman and Hall, London. 1984, 217 pp.
Perrin,D.D. Ionisation Constants of Inorganic Acids and Bases in Aqueous Solution. Pergamon: Oxford, NY. 1982. (IUPAC Chemical Data Series no. 29).
G. Kortum, W. Vogel, and K. Andrussow. Dissociation Constants of Organic Acids in Aqueous Solution, Butterworth, London, 1982 (1st edn - Plenium, New York, 1961); initially published in Pure Appl. Chem., 1960, v.1, n.2-3, 187-536; dx.doi.org/10.1351/pac196001020187
Perrin,D.D., Dempsey, B. & Serjeant, E.P. pKa Prediction for Organic Acids and Bases. Chapman and Hall London, 1981.
Serjeant,E.P. & Dempsey, B. Ionisation Constants of Organic Acids in Aqueous Solution, Pergamon Press, London, 2nd edn, 1979. IUPAC Chemical Data Series no. 23.
W.P. Jencks and J. Regenstein, Ionisation Constants of Acids and Bases, in The Handbook of Biochemistry/ H.A. Sober, (ed.), Chemical Rubber Publishing Co., Cleveland, OH, 1970, 2nd edition, Section i-187.
Perrin,D.D. Dissociation Constants of Organic Bases in Aqueous Solution. Butterworths: London 1965 & 1972 Supplement.
Stability Constants /Sillen L.G. & Martell, A.E.(Eds.), Special Publications No. 17 & 25, RCS London, 1964 & 1971
Albert, A., Serjeant, E.P. Ionization Constants of Acids and Bases. 1962.

[АлександрI]

В помощь:

Это методическая ошибка. Не с этого надо начинать. ИМХО: я думаю, что пока топикстартер изучит эту информацию,
необходимость ему выполнять названную им работу уже отпадёт.

Нужно оценить значения pKa для нескольких соединений (водные и спиртовые растворы )

Если не секрет, что это за соединения?

[chemistryandron]

В помощь:

Спасибо за помощь. Попробую почитать!

Нужно оценить значения pKa для нескольких соединений (водные и спиртовые растворы )

Если не секрет, что это за соединения?

Нет, не секрет. Ивините,что раньше не сообщил. Соединения относятся к следующим классам БАВ: кумаринам (производным бензо-α-пирона), флавоноидам и антраценпроизводным (по крайней мере так хотелось бы, а скорее всего на практике получиться использовать и, соответственно, значения pKa оценить нужно, только для флавоноидов).