расчет кинетики по спектрам ЯМР

[Cherep]

а в случае кривой - можно же разбивать на участки?

Атцы-физхимики подсказали бы.
На бесконечно малые, ЕМНИП
На этом даже какие-то ЧМы основаны для нахождения производных, штоле.
Я уже всё забылъ

[Osmate Kate]

в архиве все спектры и графики по ним... это комплексы с ДМСО (2,77-3,67 м.д.) в хлороформе,
нормированные относительно р-ля 7,26 м.д. (2,61-2,62 м.д. - свободный дмсо)
расчеты велись относительно пика 0,07 м.д. (считаем смазка и не менялась во времени)

[Osmate Kate]

по форме сигналов (дублеты, триплеты, и тп) они разные или одинаковые?

там синглеты, вроде одинаковые...

[Cherep]

может они разной степени "уширенности"?

[Osmate Kate]

как это посчитать/проверить/использовать?

[chaus]

как это посчитать/проверить/использовать?

Можно, наверное, классически поделить мультиплеты, как делим сигналы в ЭСХА, используя профиль гаусс+лоренц.

[Osmate Kate]

попробовала... правда у меня есть пока только specman (ACD labs) для работы со спектрами... если там не менять стандартную ширину пиков (применяя Гаусс+Лоренц), то суть картинки изменения приведенной интегральной и пиковой интенсивностей одинакова. немного отличаются начальные значения... Это имеет принципиальное значение?

[chaus]

Ну этой программы я не знаю, мы обычно пользуемся своим ПО, но суть должна быть одна. Конечно, если не менять ширину пиков, то интеграл будет пропорционален высоте. Но суть деления спектра в том и заключается, что, поскольку в реальном спектре пики имеют разную ширину и разный профиль, то каждый пик приближают, подгоняя ширину и соотношение гаусс+лоренц так, чтобы получить минимум невязки с экспериментальным спектром. Тогда интегралы пиков дают более адекватное приближение содержания ингредиентов в системе.

[Osmate Kate]

а критерий правильность? "на глаз" определять?

[chaus]

Обычно программами, такими, как Коза (casaXPS) и т.п. используется алгоритм приближения спектра, при котором задаётся количество и приблизительное положение максимумов компонент, а программа приближает спектр суммой компонент по критерию минимума невязки (например, интегральной квадратичной). Выглядит это примерно как на скрине.

Коза фиттит спектр.png

[Osmate Kate]

т.е. надо знать количество наложившихся пиков? и их приблизительные мах?

[chaus]

Количество пиков надо знать, но это известно, т.к. известно сколько соединений, неэквивалентных атомов и мультиплетность их. Положение максимумов по разному бывает. Коза находит их сама, так сказать, по наибольшей правдоподобности. Но за это её и не любят, т.к. спектроскописты, знающие, что они анализируют, предпочитают сами задавать положение пиков.

[Osmate Kate]

я понимаю, хорошо, когда знаешь, что анализируешь) но не все известно пока...
прогу скачала, но открыть файлы не могу... расширение не подходит...

[chaus]

А там есть кнопочка или опция "convert", через неё засасывается файл в формате dat с двумя колонками -- первая энергия, вторая интенсивность. Но вообще-то Коза, как я сказал -- далеко не лучшая программа. У нас на ней только студентов учат из-за наглядности. А для дела свои мастеровые сделали программы под DOS, наверное и ещё что-то есть в этом духе. Когда я в дипломе ИК-спектры делил -- сам писал прогу на PL/1 под ЕС-1060.

[Osmate Kate]

К сожалению, я не настолько продвинутый юзер, чтоб писать проги самой... увы...
Буду искать, как открыть. Наглядность - это пока как раз то, что мне нужно))) для начала)

[Ирина Дубровская]

http://glotaran.org/
Glotaran is a free software program developed for global and target analysis of time-resolved spectroscopy and microscopy data. It serves as a graphical user interface (GUI) to the R-package TIMP. It works with any operating system that supports Java 6 and higher. The current version of Glotaran is 1.3; updates are automatically acquired by the program..

мне шеф показывал только сегодня ее

[Osmate Kate]

Спасибо) попробуем эту)

[C10H16]

Есть методы абстрактного (AFA or simply FA) и эволюционного (EFA) факторного анализа. Для пакета matlab был неплохо реализованный MCR-ALS алгоритм. Попробуйте, там правда свои косяки есть, и для электронной спектроскопии они идут, а вот для ЯМР ручаться не могу.

[C10H16]

Кстати, найдите книгу Е.Колдина "Быстрые реакции в растворах", там очень хорошо разбираются некоторые нюансы кинетических исследований методом ЯМР.

[Osmate Kate]

Спасибо за совет) поищу