+++Поиск в Reaxys mishka Спасибо!!!

Поиск в химических базах данных (Beilstein, SciFinder и др.)
Ответить
Аватара пользователя
filin1987
Сообщения: 61
Зарегистрирован: Вс апр 03, 2011 4:47 pm

+++Поиск в Reaxys mishka Спасибо!!!

Сообщение filin1987 » Ср фев 19, 2014 10:51 am

Здравствуйте, уважаемые коллеги.
Интересует синтез и реакции следующего класса соединений: O=C(C([R1])=C([R2])N1[R3])C1=O, ( моноциклические пирролдионы)
где R1, R2,R3 - любые заместители, кроме аннелированных циклов.
Проведите, пожалуйста, поиск с мая 2012 года по сегодняшний день.
Пожалуйста, сделайте один файл включая автора - Масливец А.Н. ( Maslivets A. N.), другой без него.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Последний раз редактировалось filin1987 Вт фев 25, 2014 8:42 am, всего редактировалось 1 раз.

mishka
Сообщения: 6022
Зарегистрирован: Вт окт 16, 2007 4:59 pm

Re: Поиск в Reaxys и SciFinder

Сообщение mishka » Пт фев 21, 2014 3:09 pm

вводите смайлсами если конкретные соединения или формируйте rdf файл для субструктурного поиска по реакции (со всякими исключениями и включениями...)

по субструктуре
O=C(C([R1])=C([R2])N1[R3])C1=O без правок в реаксисе как продукт (без ввода исходных)
8009 reactions out of 1237 citations

Аватара пользователя
filin1987
Сообщения: 61
Зарегистрирован: Вс апр 03, 2011 4:47 pm

Re: Поиск в Reaxys и SciFinder

Сообщение filin1987 » Вс фев 23, 2014 6:43 pm

Конкретных соединений нет.
Нужно знать область исследования (background).
Сделал .rdf файлы, однако, не знаю как вставляются исключения (http://www.chemaxon.com/marvin/sketch/index.jsp).
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

mishka
Сообщения: 6022
Зарегистрирован: Вт окт 16, 2007 4:59 pm

Re: Поиск в Reaxys и SciFinder

Сообщение mishka » Пн фев 24, 2014 4:21 pm

подразумевается, что в rdf Вы все что Вам надо сами и введете, расшифруете свои R1 R2 и прочее. В марвине вроде есть правила как и что вводить:

Код: Выделить всё

http://www.chemaxon.com/marvin/help/sketch/sketch-index.html
http://www.chemaxon.com/marvin/help/sketch/sketch-basic.html#howto-draw.rgroups
Если это можно сделать в другом формате доступном для марвина - делайте. Подсказать ничего не могу.
Цель - чтобы при поиске ввести Ваш файл, нажать кнопку и скопировать результаты и не заниматься вводом Ваших реакций, исключений и включений.

В том, что Вы прислали обычная субструктура, которую и в виде смайлса можно было выложить (выдает сотни результатов поиска) или набор структур с рисунка, неадаптированный к реакции.
Поинтересуйтесь как в виде Rdf вводил waxman
viewtopic.php?f=65&t=104112
у него где-то и несколько запросов реакций в одном rdf файле были.

Аватара пользователя
filin1987
Сообщения: 61
Зарегистрирован: Вс апр 03, 2011 4:47 pm

Re: Поиск в Reaxys и SciFinder

Сообщение filin1987 » Пн фев 24, 2014 7:52 pm

Спасибо за ссылки, mishka.
Переделал запросы 3 rdf - файла, посмотрите, пожалуйста:
2.rdf
1.rdf
str.rdf
Подобный поиск уже был viewtopic.php?f=65&t=88428, но мне нужно

1) с мая 2012 года по сегодняшний день.

2)один файл включая автора - Масливец А.Н. ( Maslivets A. N.), другой без него

3)убрать опцию include tautomer (сделали в предыдущем запросе)

4) синтез и реакции
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

mishka
Сообщения: 6022
Зарегистрирован: Вт окт 16, 2007 4:59 pm

Re: Поиск в Reaxys и SciFinder

Сообщение mishka » Пн фев 24, 2014 9:32 pm

авторов и таутомеры не отмечал. (по автору сами выборку уже сделаете)

для str.rdf год не указывал

год(>2011) в 1 rdf указывал, но если реакция кот. попадается была также описана ранее то прошлые ссылки тоже приводятся



для 2 rdf as product >2011 год
2615 reactions out of 307 citations
для 2 rdf as starting >2011 год
5107 reactions out of 524 citations
это не копировал
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
filin1987
Сообщения: 61
Зарегистрирован: Вс апр 03, 2011 4:47 pm

Re: Поиск в Reaxys и SciFinder

Сообщение filin1987 » Вт фев 25, 2014 8:41 am

Огромное спасибо, mishka :up:

Ответить

Вернуться в «Химические базы данных»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 2 гостя