+++ поиск в Reaxys

Поиск в химических базах данных (Beilstein, SciFinder и др.)
Ответить
Аватара пользователя
Dottie
Сообщения: 513
Зарегистрирован: Ср янв 24, 2007 1:49 pm

+++ поиск в Reaxys

Сообщение Dottie » Пн мар 04, 2013 8:20 pm

Добрый вечер коллеги.

Помогите пожалуйста с поиском упоминаний о получении соединений - см. вложение.
R - любые заместители (алкил, арил, галоген, алкокси, арилокси, меркапто, нитро и т.п. в любой комбинации), алкильная цепь без заместителей, аминогруппа первичная.

Код: Выделить всё

SMILES - [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C1=C(C)N([*])C2=C1C([*])=C([*])C([H])=C2[*]
Спасибо заранее!!
untitled_molecule_file.mol
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Последний раз редактировалось Dottie Вт мар 05, 2013 11:11 pm, всего редактировалось 1 раз.

mishka
Сообщения: 6023
Зарегистрирован: Вт окт 16, 2007 4:59 pm

Re: поиск в Reaxys

Сообщение mishka » Пн мар 04, 2013 10:11 pm

у меня реаксис такой смайлс не понимает

Аватара пользователя
Dottie
Сообщения: 513
Зарегистрирован: Ср янв 24, 2007 1:49 pm

Re: поиск в Reaxys

Сообщение Dottie » Вт мар 05, 2013 8:23 am

Переделал))

Код: Выделить всё

SMILES - C12=C([R])C([H])=C([R])C([R])=C1C(C(C(N)([H])[H])([H])[H])=C(C)N2[R]

mishka
Сообщения: 6023
Зарегистрирован: Вт окт 16, 2007 4:59 pm

Re: поиск в Reaxys

Сообщение mishka » Вт мар 05, 2013 10:04 am

результаты по смайлсу, который Вы нарисовали.
Если Вы хотите, чтобы в каких-то положениях были любые заместители - оставляйте эти положения пустыми, а не проставляйте R, результаты будет как правило отличаться в этих случаях.
Там где должны быть атомы водорода - обязательно рисуйте их.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Dottie
Сообщения: 513
Зарегистрирован: Ср янв 24, 2007 1:49 pm

Re: поиск в Reaxys

Сообщение Dottie » Вт мар 05, 2013 10:21 am

mishka, спасибо за поиск, действительно совсем не то(
SMILES переделал, оставив пустыми позиции в которых предполагается наличие водородов или заместителей, а позиции, где заместителей быть не должно, забил водородами.

Код: Выделить всё

C12=CC([H])=CC=C1C(C(C(N([H])[H])([H])[H])([H])[H])=C(C([H])([H])[H])N2
Благодарю за совет, для меня не совсем очевидно как верно составить поисковый запрос в Reaxis.
Последний раз редактировалось Dottie Вт мар 05, 2013 10:30 am, всего редактировалось 1 раз.

mishka
Сообщения: 6023
Зарегистрирован: Вт окт 16, 2007 4:59 pm

Re: поиск в Reaxys

Сообщение mishka » Вт мар 05, 2013 10:29 am

-->
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Dottie
Сообщения: 513
Зарегистрирован: Ср янв 24, 2007 1:49 pm

Re: поиск в Reaxys

Сообщение Dottie » Вт мар 05, 2013 10:39 am

Спасибо огромное, однако в файле с поиском исключительно незамещенный 2-метилтриптамин и тримеры с димерами, заместителей, к сожалению, нет((

mishka
Сообщения: 6023
Зарегистрирован: Вт окт 16, 2007 4:59 pm

Re: поиск в Reaxys

Сообщение mishka » Вт мар 05, 2013 11:32 am

наверное забыл птичку поставить на СУБструктурном поиске. в конце дня пересмотрю.

mishka
Сообщения: 6023
Зарегистрирован: Вт окт 16, 2007 4:59 pm

Re: поиск в Reaxys

Сообщение mishka » Вт мар 05, 2013 10:13 pm

субстр. поиск за вычетом результатов из предыдущего поста.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Dottie
Сообщения: 513
Зарегистрирован: Ср янв 24, 2007 1:49 pm

Re: поиск в Reaxys

Сообщение Dottie » Вт мар 05, 2013 11:10 pm

mishka, спасибо! то что надо!!!

Ответить

Вернуться в «Химические базы данных»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 11 гостей