ортогональное снятие пептидных защит

[maks]

товарищи пептидщики , доценты с кандидатами
не поделитесь есть ли какие подводные камни в ортогональных депротекциях такой аминокислоты
http://www.chemicalbook.com/ProdSupplie ... 262_EN.htm
более интересно снять Бок , но возможно и ФМОК информация будет не лишняя

[S324]

[maks]

она самая

[chemist]

Минимальным количеством ТФУК м.б. можно селективно убрать только БОК, надо пробовать разные соотношения. ФМОК селективно убирается пиперидином, БОК к нему устойчив.
А почему ортогональное-то? (Ортогональность = перпендикуляность). В таких случаях говорят о селективности

[Serty]

Да нет о защитах так часто говорят, когда одну можно снять не затрагиваю другую. Термин устоявшийся...
Снимаются они как уже chemist написал, правда вместо пиперидина можно брать и пирролидин(снимает быстрее), морфолин(медленнее), даже TEA снимает, но уж совсем медленно.
Однако здесь может быть засада: пробовали как-то получать амиды 4-алкиламино-N-Fmoc-азетидина, и оказалось, что на азетидине она сидит очень нестойко, и под действием TEA успевала слететь. Получили кашу, где основным был бис-амид. Возможно это причуда азетидина, но если нужно работать в основных условиях стоит соблюдать осторожность

[chemist]

Да нет о защитах так часто говорят, когда одну можно снять не затрагиваю другую. Термин устоявшийся...

Спасибо. коллега Serty, буду знать, это, видимо, термин сугубо пептидчиков

[maks]

а вот то что это после снятия Бока будет монометиламин не таит ли ничего непредвинно неприятного
вопрос возник потому что ФМОК диметиламиноглицина гидрохлорид известен, вполне продажный реагент, а ФМОК монометиламиноглицина гидрохлорида мы не нашли , может он как неуловимый Джо не нужен никому , а может какие то заморочки ожидаются ?
снимать все же хотелось бы в HCl диоксане ,например ,что бы получить гидрохлорид, а не трифторацетат

[Serty]

ФМОК диметиламиноглицина - а это как, что-то я не понял куда здесь Fmoc то приделан
Думаю проблем не будет, пока в виде гидрохлорида, а вот как в основание переведете то всяко может быть. Интересно а в каких условиях лизин в капролактам сворачивается.

[maks]

извиняюсь лизина
вот и у меня вопрос , в этом духе , N-метилкапролактам ,как продукт не нужен
и монометиламин одной молекулы ФМОК с другой не собьет ли ? впрочем кислая среда...

[Serty]

Вот и я о том, пока соль не собъет, а виде основания жить будет недолго.

[Nickolas]

Да, основание может себя само утюжить:

Undesired removal of the Fmoc group by the free o-amino function.pdf

[Serty]

Еще одно замечание о Fmoc. Часто когда описывают ее отщепление рисуют образование фульвена - 9-метиленфлуорена. Так то оно так, но сей продукт весьма реакционоспособен, и легко присоединяется к аминам. Я в основном наблюдал 9-флуоренилметилпирролидин в качестве основного продукта этого рода. Таким образом, он в принципе может сесть и на высвобождаемую амино-функцию, и это будет зависеть от основности амина, и избытка амина используемого для снятия. Кстати при стятии не аминными основаниями, например TBAF, иногда добавляют тиолы как скавенжер для фульвена.

[Nickolas]

Была статья, где гидрированием снимали Fmoc в присутствии ацетонитрила или под 3-мя атмосферами. Так вроде проще с выделением.