ChemBiooffice 13 (2012)

форум для специалистов в области органической химии
organic chemistry issues discussion for professional scientists
Ответить
StYV
Сообщения: 3080
Зарегистрирован: Пн окт 24, 2005 11:43 pm

ChemBiooffice 13 (2012)

Сообщение StYV » Чт сен 27, 2012 5:53 pm

Появился такой продукт. Доступен "триал" на 2 недели, пока получаешь ключ - около 10 дней (так у меня было - не скачивайте в пятницу).
Все сравнивалось с 12 версией (у меня на компе ее нет).
На Win 7 12 версия не ставиться (это не мое мнение).
Операционка WIN 7 домашняя расширенная.
Не установился SQL Server 2008 (у меня был до того 2003). Почему не знаю да и неинтересно.
Соответственно не установился электронный журнал.
Просмотрщик ЯМР MestReNova LITE требует лицензии - может оно так и надо.
Интерфейс почти такой-же.
ЯМР-спектры считает иначе, чем 12.
Именует тоже несколько иначе - нет квадратных, фигурных скобок.
3d-модели при использовании MM2 считает тоже иначе.
Пример из нашего опыта:
В рамках плановых работ лаборатории был синтезирован дендример, формально аналогичный доксорубицину. 3d-модель по 12 версии интереса не вызвала. После изучения дендримера оказалось, что он обладает низкой токсичностью (на порядок менее, чем доксорубицин), высокой противоопухолевой активностью, а также отсутствием МЛУ.
В 13 версии 3d-модель выглядела совершенно иначе, что как-то объясняет полученные результаты.
С уважением StYV.

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2050
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: ChemBiooffice 13 (2012)

Сообщение amge » Пт сен 28, 2012 8:25 am

StYV писал(а):3d-модели при использовании MM2 считает тоже иначе
Возможно, ваш дендример конформационно нежесткий. У меня сложилось впечатление, что ChemOffice и другие рисовалки, умеющие превращать 2D в 3D, не пытаются найти наилучший конформер, а выдают первый попавшийся. Различные версии ChemOffice сравнивать не доводилось, но типична ситуация, когда разные программы (ChemOffice, ChemSketch, MarvinSketch) в более-менее сложных случаях выдают различные конформеры одного и того же соединения, причем зачастую ни один из них не является наилучшим (наиболее стабильным). Вообще, найти наилучший конформер - довольно сложная задача, для этого есть специальные программы.

Еще, по моим наблюдениям, если имеете дело не с биополимером, то MM2 не очень адекватен, MMFF94 (вроде бы в ChemOffice это силовое поле тоже есть) лучше.

StYV
Сообщения: 3080
Зарегистрирован: Пн окт 24, 2005 11:43 pm

Re: ChemBiooffice 13 (2012)

Сообщение StYV » Пн окт 01, 2012 8:21 pm

Вдобавок ко всему 13 не совсем правильно именует:
дициклопентадиен обзывает как
- 3a,4,7,7a-tetrahydro-1H-4,7-methanoindene
а Marvin
- tricyclo[5.2.1.0(2,6)]deca-3,8-triene.
Последнее имя правильное.
С уважением StYV.

Cherep
Сообщения: 23489
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: ChemBiooffice 13 (2012)

Сообщение Cherep » Пн окт 01, 2012 8:22 pm

а там нет где-то в настройках переключения между номенклатурами ACS и IUPAC?

StYV
Сообщения: 3080
Зарегистрирован: Пн окт 24, 2005 11:43 pm

Re: ChemBiooffice 13 (2012)

Сообщение StYV » Ср окт 03, 2012 5:47 pm

В хелпе написано, что придерживается правил и рекомендаций "official IUPAC, IUBMB, and CAS", а также сложившийся практике. Примерно как-то так. В закладках нифига не нашел где галочку поставить. В общем песня - догадайтесь сами!
С уважением StYV.

практик
Сообщения: 133
Зарегистрирован: Вс апр 17, 2011 2:51 pm

Re: ChemBiooffice 13 (2012)

Сообщение практик » Чт окт 04, 2012 11:16 pm

tricyclo[5.2.1.0(2,6)]deca-3,8-diene.
Последнее имя правильное.

young
Сообщения: 575
Зарегистрирован: Вс июл 04, 2004 4:42 pm

Re: ChemBiooffice 13 (2012)

Сообщение young » Вс окт 14, 2012 5:48 pm

StYV писал(а):На Win 7 12 версия не ставиться (это не мое мнение)
У меня на ноуте (win 7 домашняя базовая) стоит 12 версия :shuffle:

StYV
Сообщения: 3080
Зарегистрирован: Пн окт 24, 2005 11:43 pm

Re: ChemBiooffice 13 (2012)

Сообщение StYV » Пн окт 15, 2012 10:02 am

О плясках с бубном в этом случае очень много написано.
С уважением StYV.

Аватара пользователя
SkydiVAR
Сообщения: 10844
Зарегистрирован: Пн янв 19, 2009 12:51 am
Контактная информация:

Re: ChemBiooffice 13 (2012)

Сообщение SkydiVAR » Пн окт 15, 2012 11:42 am

Не читал. Стоит ChemBioOffice Ultra 12.0 на Win7Pro. Про проблемы при установке не припоминаю...
Меч-кладенец - оружие пофигистов.

mishka
Сообщения: 6023
Зарегистрирован: Вт окт 16, 2007 4:59 pm

Re: ChemBiooffice 13 (2012)

Сообщение mishka » Чт окт 18, 2012 11:20 pm

13-ый офис на Аваксхоум появился ....

Аватара пользователя
chemkostya
Сообщения: 41
Зарегистрирован: Чт мар 26, 2009 12:14 am

Re: ChemBiooffice 13 (2012)

Сообщение chemkostya » Вс апр 14, 2013 1:18 pm

mishka писал(а):13-ый офис на Аваксхоум появился ....
Скачал, на семерку поставился, но версия триал

Ответить

Вернуться в «органическая химия / organic chemistry»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 7 гостей