нужен человек который будет учить органике

[Vittorio]

N₆ - это не гексазин, а диазид.

оффтоп
имел в виду гексаазабензол. Таки гексазин.

[Natalie_L]

Кстати, сейчас кругом полно рекламы "английский по скайпу"... так что желающие могут найтись и необязательно из Москвы... а, у вас же денег нет, забыла, да...

[гаер*]

Ы, контрольный смайл забыл! Vittorio, Вы слишком серьёзны!
Aitvarasch, доброхоты Вас будут бесплатно учить органике прямо в этой теме - спрашивайте!

[Aitvarasch]

Хорошо, спасибо, я составлю список вопросов.

[ Post made via Android ]

[amge]

N₆ - это не гексазин, а диазид.

имел в виду гексаазабензол. Таки гексазин.

Прикола ради посчитал изомеры N₆, заодно опробовал новый метод генерации начальных приближений для квантовой химии. Диазид получился наиболее стабильным из найденных изомеров. А гексазин самопроизвольно разваливается на три азота .

[FOX-7]

Коллега! А этот не прикинете?

[Гесс]

гексаазабареллен!

[amge]

Гексаазабареллен, хоть и красив, зараза, получился нестабильным. Стационарная точка второго порядка, спуск с которой по IRC приводит к 4 азотам.

[Гесс]

перазадодекаэдран? ))))
декаазатрихинацен?

А если бареллен забить шахматно бора-аза?

[FOX-7]

а нельзя ли пойти от обратного, и прикинуть структуру, которая будет устойчива, ну хотя бы при минусовых температурах

[Гесс]

насколько я понимаю это бы быстро убило смысл компьютерной химии: заставить машину найти устойчивую структуру без исходных данных.

Можно просто утверждать что например структуры с невыгодной геометрией имеют меньшие шансы на жизнь чем с адекватной. Соответственно если мы знаем что нормальный угол для азота где то недалек от sp3углерода, а двойные связи N=N - не самые распространенные в химии, и сопряжение с делокализацией места не имеет, то следует отказаться от октаазакубана, гексаазабензола и пр. И декаазатрихинацена наверное тоже.

[FOX-7]

не знаю, можно ли тут все объяснять только геометрией. N-O фрагмент мог бы как-нибудь помочь?

[Гесс]

Я не говорю что геометрия все решит. такое окислороживание может и снизить энергию системы...
Короче считать надо, а у меня и своя работа нефурычит...

[Aitvarasch]

Вот и вот и вопрос. Как посчитать устойчивость структуры, всё было интересно, везде пишут: посчитать, посчитать- а как?)

[ Post made via Android ]

[Polychemist]

Aitvarasch, Вы задаёте вроде как осмысленные вопросы. Ну так задайте их в специализированном разделе, по квантовой химии. Там Вам порекомендуют оптимальную программу. Вы её возьмёте, установите, прочитаете мануал, что непонятно - спросите.

[amge]

А если бареллен забить шахматно бора-аза?

Это помогает . Из "бензола" N3B3 и "баррелена" N4B4 получаются вот такие забавные каракатицы со связями B-B длиною около 1.9 ангстрем:

NB.gif

[Гесс]

amge - нифига себе "помогло". Ну если предположить что N3B3 должен существовать в форме боразола (С6 тоже небось фигню какую то даст), то может стоит и боразабареллен гидрировать. А вообще надо поискать неужели никто не занимался столь элементарным комп.фантазированием.
Aitvarasch - предельно, предельно упрощенно - кемофис 3Д умеет делать "оптимизацию". В некоторых случаях полученные структуры достаточно хороши чтобы с них начинаьб более высокоуровневый рассчет (то есть умеренно далеки от реальности). В то же время он никогда не рвет нарисованных связей, зачастую дает инвертированные углероды, а иногда просто глупости (попробуйте оптимизировать в нем призман). Его позитивная сторона - он умеет скажем создавать инпуты гауссиана.
Гауссиан программа небесплатная, но ... также возбмите и вьювер к ней, забиваем небольшие метод с базисом и запускаем на любимом компьютере. Для молекулок которые здесь счас обсуждаются - вполне реально.
Если хотите попытать свое счастье на системах в сотни атомов возьмите например Материалстудио и считать чем то типа вампа. Хотя для этого уже лучше иметь выход на сервер, иначе рискуете. Программа тоже небесплатная, работает только под Виндой.
А вообще популярных программ десятки, заточенных под чтолибо-сотни. Турбомоль, АДФ, Орка, Природа... Где то в квантовой химии уже был вопрос какая прога лучше (поиск сферического коня в темной комнате). Они изначально разные, платные и бесплатные, требующие сервера и ранящиеся хоть на смартах, учитывающие разные типы взаимодействия, распараллеливающие вычисления и нет, заточенные под работу с переходными металлами, под спектры, под поиск переходных состояний. Молекулу из 4 атомов можно считать минуты на мобильнике а можно недели на капл-кластере. Результаты различны.

[amge]

а нельзя ли пойти от обратного, и прикинуть структуру, которая будет устойчива, ну хотя бы при минусовых температурах

Первая часть задачи, найти структуры определенного состава, которые в принципе могут быть устойчивы (т.е. которым соответствуют локальные минимумы на ППЭ), решаема. Собственно, такую задачу я и решал для поиска изомеров N6. С помощью специальной программы были генерированы структуры (много, 500 шт.), в которых атомы азота были соединены хаотически, без учета какой-либо химии. Затем эти структуры были взяты как начальные приближения для квантовой химии (DFT). Подавляющее большинство из них в процессе оптимизации распались на азоты, но некоторые случайно оказались вблизи локальных минимумов системы N6, они там и остались.
Вторая часть задачи, найти структуры, которые будут устойчивы хотя бы при минусовых температурах, тоже в принципе решаема, но уже гораздо сложнее. Чтобы частицу можно было зафиксировать, соответствующий ей локальный минимум должен быть достаточно глубоким (например, чтобы успеть записать спектр ЯМР при при -100 гр. - глубже 12 ккал/моль). Т.е. нужно найти высоту всех без исключения перевалов (переходных состояний) из данного минимума, и куда эти перевалы ведут. Я не знаю способа автоматического поиска переходных состояний. Т.е., нужно самому придумывать механизм реакции и затем проверять его расчетами. Но всегда может оказаться, что какая-либо быстрая реакция просто не пришла в голову (объекты же типа N6 весьма нетривиальны, и их реакции могут отличаться от обычных).
И, наконец, третий аспект проблемы. Растворитель. Запросто может оказаться, что частица, вполне стабильная в вакууме, будет очень легко реагировать с растворителем, и поэтому зафиксировать ее не удастся. Простейший пример - метильный катион (его обсуждали на форуме).

[amge]

amge - нифига себе "помогло". Ну если предположить что N3B3 должен существовать в форме боразола (С6 тоже небось фигню какую то даст), то может стоит и боразабареллен гидрировать. А вообще надо поискать неужели никто не занимался столь элементарным комп.фантазированием.

Не, гидрированный не интересно, наверняка ведь будет вполне стабилен. А истинный квантовый химик должен считать только такие структуры, которые невозможно синтезировать, чтобы проверить было нельзя (шутка ).

[Panda]

Хорошо протроллили. Сознательно или нет не знаю. ЛОЛ. Лицей чуствуется