+++Биологическая активность по субструктуре

Поиск в химических базах данных (Beilstein, SciFinder и др.)
Ответить
frank
Сообщения: 14
Зарегистрирован: Вс мар 14, 2010 12:41 pm

+++Биологическая активность по субструктуре

Сообщение frank » Сб апр 07, 2012 12:55 am

Здравствуйте, уважаемые форумчане!
Помогите, пожалуйста, найти информацию о биологической активности соединений с фрагментом 1 - C13C(C2C(C1)CCCC2)CCCN3
Если будет слишком много результатов, то можно ограничиться фрагментом 2 - C13C(C2C(C1)CCCC2)CC4C(N3)CCCC4
Буду очень признателен
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Последний раз редактировалось frank Сб апр 14, 2012 9:18 am, всего редактировалось 3 раза.

Аватара пользователя
Chem_DM
Сообщения: 7805
Зарегистрирован: Чт апр 15, 2010 9:42 pm

Re: Биологическая активность по субструктуре

Сообщение Chem_DM » Сб апр 07, 2012 7:50 pm

Сбрасываю фармактивность.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
А я уйду из бытия, в небытиё, оно мое.

frank
Сообщения: 14
Зарегистрирован: Вс мар 14, 2010 12:41 pm

Re: Биологическая активность по субструктуре

Сообщение frank » Вс апр 08, 2012 9:41 pm

Спасибо большое, Chem_DM!!!
Мне заведомо известны некоторые ссылки на биоактивность инденопиридинов, в том числе алкалоидов группы 4-азафлуорена, которых в отчете нет. Подскажите, пожалуйста, это Reaxys плохо ищет и стоит искать в чем-то другом или нужно как-то по-другому составлять запрос?

starless

Re: Биологическая активность по субструктуре

Сообщение starless » Вс апр 08, 2012 10:27 pm

Думаю, потому, что нарисованная структура не является ароматической, в отличие от инденопиридинов и азафлуоренов. Если вас интересует активность этих соединений, то их и надо изображать.

frank
Сообщения: 14
Зарегистрирован: Вс мар 14, 2010 12:41 pm

Re: Биологическая активность по субструктуре

Сообщение frank » Пн апр 09, 2012 8:21 am

starless писал(а):Думаю, потому, что нарисованная структура не является ароматической, в отличие от инденопиридинов и азафлуоренов. Если вас интересует активность этих соединений, то их и надо изображать.
Спасибо за быстрый ответ!
Я наивно предполагал, что поиск будет осуществляться по субструктуре, по всем атомам, исключая водород. Возможно ли так (наличие/отсутствие двойных связей не критично) организовать запрос?

Serty
Сообщения: 8177
Зарегистрирован: Пт июл 06, 2007 12:17 pm

Re: Биологическая активность по субструктуре

Сообщение Serty » Пн апр 09, 2012 11:14 am

SSS не меняет кратности связей, а вы не указали, что связи должны быть "Any" :wink:
Вариант с "Any Bonds" :arrow:
Забавно, похоже вы получили в нагрузку все аконитиновые алкалоиды :)
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

frank
Сообщения: 14
Зарегистрирован: Вс мар 14, 2010 12:41 pm

Re: Биологическая активность по субструктуре

Сообщение frank » Пн апр 09, 2012 1:29 pm

Теперь все супер :D
Всем огромное спасибо!

frank
Сообщения: 14
Зарегистрирован: Вс мар 14, 2010 12:41 pm

Re: +++ Биологическая активность по субструктуре

Сообщение frank » Чт апр 12, 2012 8:31 pm

Можно еще одну просьбу для полноты картины?
Изомер C12NCCCC1CC3C2CCCC3, двойные связи не критичны (any bonds, если я правильно понял), интересует все также биоактивность.
Заранее спасибо!
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Serty
Сообщения: 8177
Зарегистрирован: Пт июл 06, 2007 12:17 pm

Re: Биологическая активность по субструктуре

Сообщение Serty » Пт апр 13, 2012 10:40 am

В таком варианте 1440 хитов, а это многовато для сохранения(макс 1000). Требуется как то конкретизировать структуру.
Я сделал пробный вариант - с ароматизацией Py:arrow: . С ароматическим Ph их все равно слишком много - 1228.

frank
Сообщения: 14
Зарегистрирован: Вс мар 14, 2010 12:41 pm

Re: Биологическая активность по субструктуре

Сообщение frank » Пт апр 13, 2012 12:45 pm

Спасибо, Serty!
C ароматическим Ph было бы замечательно, но раз много, то тогда можно ограниться инденохинолином. Индановый Ph - ароматический, в остальных циклах - any bonds (если, конечно, так можно)
C13NC4C(CC1CC2=CC=CC=C23)CCCC4
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Serty
Сообщения: 8177
Зарегистрирован: Пт июл 06, 2007 12:17 pm

Re: Биологическая активность по субструктуре

Сообщение Serty » Пт апр 13, 2012 2:19 pm

Можно, почему нельзя :) :arrow:
В предидущем запросе очень много наваяли продуктов Ганча с индандионом :D , поэтому и не влезало...
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

frank
Сообщения: 14
Зарегистрирован: Вс мар 14, 2010 12:41 pm

Re: +++Биологическая активность по субструктуре

Сообщение frank » Сб апр 14, 2012 9:24 am

Serty!Спасибо еще раз, огромное!!!

Ответить

Вернуться в «Химические базы данных»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 30 гостей