Квантово-химические расчеты в GAMESS

вопросы строения молекул и квантовой химии
OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение OrganikNV » Ср дек 08, 2010 1:09 pm

Подскажите, пожалуйста, как наиболее точно рассчитать барьеры внутреннего вращения в программе PCGAMESS???

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение VTur » Ср дек 08, 2010 6:10 pm

Увеличить базис и усилить сходимость по силам.

Что Вы имеете в виду "наиболее точно " и для каких целей?
После отстоя требуйте долива

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение OrganikNV » Ср дек 08, 2010 6:36 pm

Я имею ввиду, как их рассчитать вообще? Как найти поверхность потенциальной энергии?

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение OrganikNV » Ср дек 08, 2010 6:54 pm

Если можете,сбросьте пару примеров!!!

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение VTur » Ср дек 08, 2010 10:12 pm

Вот исходник. Там же пример
http://classic.chem.msu.su/gran/gamess/scan.html
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
Lantano
Сообщения: 189
Зарегистрирован: Чт окт 09, 2008 10:35 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение Lantano » Чт дек 09, 2010 12:42 am

OrganikNV писал(а):Я имею ввиду, как их рассчитать вообще? Как найти поверхность потенциальной энергии?
Для оценки барьера внутреннего вращения (если Вы не учитываете изменение энергии нулевых колебаний) Вам не нужна поверхность потенциальной энергии. Нужно знать электронные энергии в двух точках ППЭ - в точке минимума и седловой. Их разность и есть искомый барьер.
P.S. Вы слишком общие вопросы задаете. Будьте конкретней.
"Если миру не нужен свет - Не беда, проживёт и так.
Если стал не нужен поэт - Не беда, он наймётся в кабак..."

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение OrganikNV » Чт дек 09, 2010 2:11 pm

Спасибо, попробую разобраться!

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение OrganikNV » Чт дек 09, 2010 2:35 pm

Кому не трудно, подскажите последовательность нахождения переходного соотояния!

Аватара пользователя
Lantano
Сообщения: 189
Зарегистрирован: Чт окт 09, 2008 10:35 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение Lantano » Пт дек 10, 2010 11:31 am

OrganikNV писал(а):Кому не трудно, подскажите последовательность нахождения переходного соотояния!
Это народ тут обсуждает viewtopic.php?f=11&t=54931. Как раз для случая внутреннего вращения. Какая у Вас система?
"Если миру не нужен свет - Не беда, проживёт и так.
Если стал не нужен поэт - Не беда, он наймётся в кабак..."

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение OrganikNV » Пт дек 10, 2010 1:32 pm

Мне необходимо рассчитать барьеры инверсии и вращения вокруг С=N Связей. Я знаю, как выглядит переходное состояние при инверсии, но его необходимо правильно оптимизировать. Я в этом новичок и не уверена, что делаю это правильно. Что касается вращения, - с этим совсем туго в плане рассчётов.

Аватара пользователя
Lantano
Сообщения: 189
Зарегистрирован: Чт окт 09, 2008 10:35 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение Lantano » Пт дек 10, 2010 7:49 pm

Ну если не хотите говорить про рассчитываемую систему, тогда встаете в предполагаемое переходное состояние и:
$CONTRL RUNTYP=sadpoint
$statpt NSTEP=100 OPTTOL=0.00001 Hess=calc IHREP=2 $END
"Если миру не нужен свет - Не беда, проживёт и так.
Если стал не нужен поэт - Не беда, он наймётся в кабак..."

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение OrganikNV » Пн дек 13, 2010 2:36 pm

Спасибо!

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение OrganikNV » Пн дек 27, 2010 2:53 pm

Подскажите пожалуйста, какие параметры необходимо вводить при расчёте анионов, радикалов, катионов.

Аватара пользователя
Lantano
Сообщения: 189
Зарегистрирован: Чт окт 09, 2008 10:35 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение Lantano » Пн дек 27, 2010 5:14 pm

Заряд и мультиплетность.
"Если миру не нужен свет - Не беда, проживёт и так.
Если стал не нужен поэт - Не беда, он наймётся в кабак..."

OrganikNV
Сообщения: 257
Зарегистрирован: Вт дек 07, 2010 6:27 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение OrganikNV » Пт фев 04, 2011 3:25 pm

Я рассчитываю анион, icharge=-1 mult=3, scftyp=rhf. Программа выдаёт ошибку: "для данного scftyp=rhf mult=1". Попробовала scftyp=uhf, получился бредовый результат. Подскажите, пожалуйста, в чём проблема?

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение VTur » Пт фев 04, 2011 11:00 pm

OrganikNV писал(а):Я рассчитываю анион, icharge=-1 mult=3, scftyp=rhf. Программа выдаёт ошибку: "для данного scftyp=rhf mult=1". Попробовала scftyp=uhf, получился бредовый результат. Подскажите, пожалуйста, в чём проблема?
А бредовость то в чём?
После отстоя требуйте долива

Rusia
Сообщения: 190
Зарегистрирован: Пн авг 06, 2007 9:35 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение Rusia » Пт фев 04, 2011 11:54 pm

Можно "бредовую" часть аутпута?

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение sanya1024 » Пт фев 11, 2011 3:41 am

Замените rhf на rohf -- бред кончится
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

NadezhdaKulikova
Сообщения: 9
Зарегистрирован: Вт янв 05, 2010 5:27 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение NadezhdaKulikova » Ср мар 14, 2012 5:24 pm

Доброго времени суток! Такой вопрос: проведен расчет оптимизации геометрии в вакууме (RHF, 6-31, все просто и банально), дальше беру из этого расчета геометрию (оптимизированную), хочу посчитать энергию в растворителе ДМСО, расчет не идет (YOUR B MATRIX HAS A SMALL DETERMINANT. THIS SUGGESTS YOU MAY HAVE BADLY CHOSEN COORDINATES.). Прочитала тут в диалогах, что это "проблемы второго порядка" - может, кто напишет, где почитать, как их решать? И вобще, разве такое может быть, чтобы GAMESS забраковал свою же геометрию?

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Квантово-химические расчеты в GAMESS

Сообщение sanya1024 » Ср мар 14, 2012 7:59 pm

Можно инпут и выдачу в студию? (в заархивированном виде, конечно)
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 10 гостей