Хромато-масс спектрометрический анализ в медицине

[Aydar]

Мы с моим научным руководителем занялись хмс анализом в медицине, конкретно хотим поработать в области диагностики болезней методом хмс. Хотел узнать, может есть какие-нибудь методики пробоподготовки (биологические жидкости, биоптаты и т.д.) и может кто-нибудь занимался подобным вопросом?

[Polychemist]

Точно знаю, что в М. синдром кленового сиропа у новорожденных так и выявляют, есть статьи по этому поводу, в них явно пробоподготовка есть.

[Aydar]

Пробоподготовку я находил, только там пишется в общих чертах. Подумал может кто-то знает конкретные методики. В основном пишут, что проводится кислый метанолиз, экстракция гексаном полученных метиловых эфиров жирных кислот и силилирование. Но вот конкретно чего и сколько не могу найти. А так наугад делать страшновато - аппарат еще испорчу)

[Polychemist]

Гляньте тут, вдруг пригодится. И всегда можно написать авторам, спросить совета.

!!!Second-Tier Test for Quantification.pdf

!!!!Rapid Diagnosis of Maple Syrup Urine Disease in Blood Spots from Newborns by.pdf

[sav]

Нужно начинать с постановки конкретной задачи, затем делать целевой лит. обзор.

Вопрос поставлен слишком "размыто".

[Aydar]

Ну конкретно, мы хотим начать в анализе тканей сердца с целью выявления заболеваний.

[Polychemist]

Поддержу sav - а есть ли у Вас целевой лит. обзор? Вы хотя бы представляете, какие соединения там надо анализировать, с т.зр. биохимии и медицины?

[Upstream]

Это программа-минимум:
Fernando Vivanco. Cardiovascular Proteomics: Methods and Protocols. Humana Press 2007.

Код: Выделить всё

http://gen.lib.rus.ec/book/index.php?md5=5E9CCA6C23AFB30F4CC1DF033C80DAD1

Jorg von Hagen Proteomics Sample Preparation. Wiley-VCH 2008.

Код: Выделить всё

http://gen.lib.rus.ec/book/index.php?md5=5439A40A2BB38FF18FDCEB98FE3B7B6B

Antonia Vlahou. Clinical Proteomics Methods and Protocols. Humana Press 2008.

Код: Выделить всё

http://gen.lib.rus.ec/book/index.php?md5=6720237E09C5A7C63F5CCF5C4B567174

Visith Thongboonkerd. Proteomics of Human Bodyfluids: Principles, Methods, and Applications. Humana Press 2007.

Код: Выделить всё

http://gen.lib.rus.ec/book/index.php?md5=101fbb20e80ef3b21d5c5d281a4d5336

Richard J. Simpson, David W. Greening. Serum-Plasma Proteomics: Methods and Protocols. Humana Press 2011.

Код: Выделить всё

http://gen.lib.rus.ec/book/index.php?md5=86a71066a11ddf61f8058d6153679f81

Дополнительную литературу найдёте здесь:

Код: Выделить всё

http://gen.lib.rus.ec/search?req=Proteomics&nametype=orig&column[]=title

Дерзайте!

[Panda]

Мы с моим научным руководителем занялись хмс анализом в медицине, конкретно хотим поработать в области диагностики болезней методом хмс. Хотел узнать, может есть какие-нибудь методики пробоподготовки (биологические жидкости, биоптаты и т.д.) и может кто-нибудь занимался подобным вопросом?

Вы HPLC-MS или HPLC-MS-MS будете использовать?.

[Aydar]

Поддержу sav - а есть ли у Вас целевой лит. обзор? Вы хотя бы представляете, какие соединения там надо анализировать, с т.зр. биохимии и медицины?

Естественно! Мы проанализировали кучу статей и литературы. В данном методе анализируются в основном жирные кислоты в виде силилированных метиловых эфиров, которые получают метилированием биологических жидкостей, биоптатов и прочее при соответствующих условиях.

[Aydar]

HPLC-MS

[Polychemist]

Если проанализировали - хорошо. Анализ включал поиск по WoS за последние годы? Но мой вопрос был в другом. Делали ли обзор не по методу, а по медицине+биохимии? Что вообще хотите? Повторить/внедрить чужую методику? Дело полезное, берите статьи и внедряйте. Разработать что-то новое? Тогда идите от медицины/биохимии, определяйтесь, какие там вещества появляются/исчезают при конкретных заболеваний, потом терзайте мозг (свой и наш) насчет возможности/методики определения этих веществ.

[Aydar]

По медицине+биохимии делаю сейчас. Велосипед изобретать не нужно, похожие исследования ведутся, поэтому хотим улучшать, добавлять чтото новое. А на счет того, какие вещества появляются и исчезают - составлена таблица, связывающая повышенное содержание определенных веществ (оксикислот, альдегидов, предельных/непредельных кислот и пр.) при определенных заболеваниях. В книге http://rffi.molnet.ru/rffi/ru/books/o_31750#289 есть данный материал.

[StYV]

Предложу Вам две простые вещи:
1. Анализ гомованилиновой кислоты - тест на онкологию у детей (очень хорошо коррелируется);
2. Анализ полиаминов - тест на онкологию в процессе лечения (очень хорошо коррелируется).
Из собственного опыта.
С уважением StYV.

[Aydar]

Предложу Вам две простые вещи:
1. Анализ гомованилиновой кислоты - тест на онкологию у детей (очень хорошо коррелируется);
2. Анализ полиаминов - тест на онкологию в процессе лечения (очень хорошо коррелируется).
Из собственного опыта.
С уважением StYV.

Огромное спасибо!