Какой компьютерной программы вам не хватает

[SIG]

Ну вообще известно, что в АСD сидело много людей и тупо вбивало в базу структуры и их реальные спектры из публикаций. Все равно, с протонными спектрами пока получается не очень. И еще есть проблема с тем, что в реальных молекулах проявляются всякие пространственные эффекты, влияющие на мультиплетность. Потом влияние ассиметричеких центров, иногда банальное совпадение химсдвигов - короче, все очень непросто. Не знаю насколько это правда, но мне говорили, что неплохо работают программы по расшифровке структуры в комплексе с ЯМР-спектрометром, когда можно доделать в автоматическом режиме необходимые ЯМР-эксперименты.

[avelon]

если придете к единому мнению и реально нужной задачи для программы, желательно интересной, то могу помочь с написанием

[Marxist]

Лучше подключитесь к допиливанию опенбабеля.

[настоящий drug]

есть такая идея нужной программы:
она
1. экстрагирует химические названия например из статьи (пдф) особенно из експериментал парт или суппортинг инфо.
2. потом распознаёт и пишет структуры в сдф файл например

ну ето так в самом простом виде.

[Phobos]

Вот мне вчера сильно не хватало программы для рисования системы для реакции. Labkit в Chemsketch дает какие-то крохи. Невозможно показать гибкие трубки, нет реакторов, только колбы, нет систем типа сокслета, дин-старка или непрерывной экстракции. Приходится какие-то фрагменты вырезать в пейнте, потом засовывать обратно в рисовалку. Трубку, вставленную в горлышко колбы через такой уплотняющий переходник с навинчивающейся крышечкой - хрен там. Часто, если рисуешь вставленный в колбу холодильник, он выглядит как бы наложенным сверху, стирая части колбы. И т.д. и т.п.

[kika]

Если можно, мне бы хотелось спросить.
Существует ли в открытом доступе какая-нибудь простенькая программка по расчету материального и теплового баланса, без расчета аппаратов, технологических схем, просто материальные и тепловые потоки.
К примеру, ввожу в нее уравнения реакций по каждой стадии, выходы, температуры, а она - раз, и все посчитала, хотя понимаю, что за этим "раз" и решение системы уравнений и много-много труда.
Или это моя полная фантазия? Тогда прошу извинить.

[Любитель_Манниха]

Было бы неплохо, если б при поиске работы по химическим ключевым словам или просто просмотра списков вакансий прятались вакансии манагеров по продажам

[Marxist]

1. экстрагирует химические названия например из статьи (пдф) особенно из експериментал парт или суппортинг инфо.
2. потом распознаёт и пишет структуры в сдф файл например

Полно таких программ.

[настоящий drug]

Полно таких программ.

есть бесплатные? например?

к началу топика:
здесь есть нечто типа NMR в структуру
http://helios.univ-reims.fr/Labos/UPRES ... x_ENG.html
а здесь еще куча всякой фигни:
http://www.redbrick.dcu.ie/~noel/linux4chemistry/

[starless]

Полно таких программ.

есть бесплатные? например?

Всякие есть

[настоящий drug]

ОЦР немного не то что я имел ввиду
попробую еше раз.
бесплатная программа которая (хотябы)
извлекает лист июпак названий веществ описаных в експериментал парт
(это те которые болд шрифтом в начале абзацев)

типичный пример пдфа- супплементал инфо в J.Org.Chem.
или Пх.Д тезисы свиазанные с синтезом в-в
большой плюс также иметь возможность загружать пдфы батчами

я буду благодарен если мне посоветуют такую программу

[starless]

LexiChem

[Cherep]

.... приблуду для LaTeX чтобы ей некую формальную БД с химсдвигами и КССВ а она бац - по правилам АмХимОбщ выплюнула в dvi отформатированое описание ЯМР спектра вещества

[настоящий drug]

LexiChem

как я понял Лексикем - часть платной программы ОпенАй
превращает название в структуру и переводит между языками.
думаю это не совсем соответствует моему последнему посту.
или я заблуждаюсь?

[starless]

академикам -- бесплатно; вашему описанию соответствует полностью, если совместить с любой программой вытаскивания текста из pdf или ocr.

[настоящий drug]

правилно ли я вас пониал что лексикем хавает сырой неформатированый текст и находит там июпак названия среди методик и аналитикал дата?
в доступном мне описании лексикем об етом не упоминалось

насколько я понимаю проблему она в основном сводится к тому что вы написали после слова если.
сначала пдф переводиат в правильно форматированный текст , после чего можно извлечь лист июпак названий имеющих некие атрибуты типа с новой строки и тп

[Krokodil]

Дорогие друзья!
Необходима СУБД - аналог ISIS-Base, ISIS-Host
Задача - работа с большими иерархическими реакционными (RXN) базами данных: импорт *.rdf, работа с данными в СУБД (создание новых записей, редактирование и удаление старых, подструктурный поиск по БД), экспорт в *.rdf
Обязательное условие - после экспорта из базы данных, экспортированный *.rdf не должен потерять иерархические (вложенные) поля, и самое главное, атомы в *.rdf файлах, относящиеся к записи реакции, не должны терять нумерации (как это происходит при использовании локальной ISIS-Base).
Заранее благодарю за разумные ответы!

[suprachemister]

Необходима СУБД - аналог ISIS-Base, ISIS-Host

слышал что у Enamine раньше была такая проблема, они обратились вроде к компании Symyx, но те загнули цену больше 50 килобаксов, тогда Enamine отказался и напряг укр программистов написать собственную SQL базу за гораздо меньшие деньги, что и было успешно сделано)

[SIG]

Вообще-то ISIS Host неворованный вроде стоит тоже около 50 килобаксов. Какие-же все они в этих конторах жадные - что эти деньги для такой крупной фирмы? Впрочем, я не отрицаю, что местные программисты сделали хорошо, просто масштаб мышления потрясает.

[suprachemister]

это не жадность а экономия средств компании) хотя денег у них достаточно
крупные конторы типа Enamine, Asinex купили ISIS/Host или аналог вместе с сервером
поставить такой сервер у себя дома в подвале было бы прикольно) но думаю технически непросто, недешево и нецелесообразно