Сделали модифицированный олигонуклеотид.
На нем, через линкер, висит тиоэфир замещенного тританола(1), пытаемся анализировать его методом MALDI, видим модифицированный олигонуклеотид (2), но упорно не получается получить сигнал от тритил-катиона(3). Если взять исходный реагент, которым модифицировали олигонуклеотид, сигнал тритильного катиона виден хорошо(до 0,1 пикомоль). С олига(100 пм.) сигнала нет.
Пробовали с разными матрицми(2,5-дигидроксибензойная, 3-гидроксиацетофенон), олиги лучше всего видны с ацетофеноном, исходные тритилы с 2,5-дигидроксибензойной.
С одного эксперимента удалось получить отличный сигнал, попросили повторить анализ той же точки на мишени - подтвердилось, вновь нанесли "удачный" образец на мишень, и нифига
Есть соображение, что поскольку олиг после ВЭЖХ, в пробирке высокая концентрация ацетата аммония, может ли он мешать сигналу?