Gaussian, SRRF=PCM, dG(cav)/dT

[VTur]

В PCM предполагается, что вращательные и колебательные составляющие в т/д функции при сольватации остаются неизменными. Не такое уж плохое приближение, если нет сильных, специфических взаимодействий в растворе.

Я бы сказал так - если нет водородных связей. Иначе или красный, или синий сдвиг и Е0 и т/д свойства уезжает сразу на кучу ккал/моль в зависимости от числа частот.

[helicase]

Ну, на какую именно кучу ккал - нужно считать. В PCM можно считать и частоты. Кроме того, есть чисто утилитарный аспект - насколько данный эффект нивелируется параметризацией модели в целом (через радиусы, которые зависят о мол. топологии, эффективных зарядов, гибридизации и т.п.). В стандарном PCM и воду считают (вода в воде), и гидратацию других полярныx молекул без особых заморочек.

[VTur]

Энергия нулевых колебаний зашита в параметризацию?

[YuraM]

Да, все так как Вы сказали - взял производную dGtr/dT и получил выражение для Str.. сейчас пишу код)))

Спасибо за помощь!

[helicase]

Энергия нулевых колебаний зашита в параметризацию?

Нет. Речь шла об изменении этой величины при сольватации. Предполагается, что оно мало либо может быть "учтено" неявным, сторонним образом (через подгонку экспериментальных Gsolv).

[VTur]

А какова погрешность метода? Я нигде не встречал.

[helicase]

В пределах 1 ккал/моль. >90% процентов людей считают гидратацию. У этих, например, [J. Chem. Phys. 107, 3210 (1997)] погрешность составила 0.2 ккал/моль для выборки из 43 молекул и 1 ккал/моль для 27 ионов. Растворитель - вода. Для неводных - хуже (часто - много хуже), по-хорошему нужна перепараметризация, т.е. радиусы не универсальны.

[VTur]

В пределах 1 ккал/моль.

Блин, "химическая точность"! Для энтальпии образования - предел мечтаний.