Гауссиан: Spurious integrated density or basis function

вопросы строения молекул и квантовой химии
Darth Vasya
Сообщения: 426
Зарегистрирован: Чт май 24, 2007 1:54 pm

Re: Гауссиан: Spurious integrated density or basis function

Сообщение Darth Vasya » Вт дек 16, 2008 9:05 am

o-oxhem писал(а): Вообще в нормальных кв.-хим. лаб. на PC устанавливают 8Гб оперативной памяти.
В нормальных кв.-хим. лаб. считают не на PC :)
Плохо зная грамматику, сложные конструкции должны употребляться с осторожностью.

PWRD
Сообщения: 18
Зарегистрирован: Сб апр 05, 2008 5:20 pm

Re: Гауссиан: Spurious integrated density or basis function

Сообщение PWRD » Вт дек 16, 2008 10:45 am

VTur писал(а):Тогда для Me10 хороший большой потенциал, а для Sn4 подбирайте ЕСР.
пробывал штутгардские ECP использовать,
либо не сходится SCF, либо разносит молеклу, либо в кучу

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Гауссиан: Spurious integrated density or basis function

Сообщение VTur » Вт дек 16, 2008 8:44 pm

Не заморачивайтесь. Значительная часть данных в публикациях того же качества.
У элементов 4 периода и дальше есть три проблемные области - около ядер, в третьем слое электронов и вдали от ядер. Хартри с Фоком их, по определению, не видят, потому и сходятся. Можете их и печатать.
Хотите корреляцию - базис должен быть сбалансирован, а значит для металлов очень большим.
Есть, правда, теория возмущений, но думаю, на РС ждать придется долго.
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: Гауссиан: Spurious integrated density or basis function

Сообщение Yurii » Ср янв 06, 2010 3:27 am

У меня сложилось такое впечатление, что эту ошибку ребята из гауссиана специально не исправили в g03, хотя нареканий на нее хватает: оставили под g09 - там все ок при неизменной точности расчета. Да и под EM64T могли программу g09 значительно быстрей сделать, а не сделали (искуственно тормознули).
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

o-oxhem
Сообщения: 425
Зарегистрирован: Вт июл 08, 2008 10:33 pm

Re: Гауссиан: Spurious integrated density or basis function

Сообщение o-oxhem » Ср янв 06, 2010 9:37 am

Yurii писал(а): Да и под EM64T могли программу g09 значительно быстрей сделать, а не сделали (искуственно тормознули).
Почему возникло такое мнение?

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: Гауссиан: Spurious integrated density or basis function

Сообщение Yurii » Чт янв 07, 2010 3:30 am

o-oxhem писал(а):
Yurii писал(а): Да и под EM64T могли программу g09 значительно быстрей сделать, а не сделали (искуственно тормознули).
Почему возникло такое мнение?
Для тех, кто занимается сборкой Гауссиана из исходников, это не является большим секретом. Из исходного кода можно выжать, смотря от задачи, еще до 50% скорости.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Izberg
Сообщения: 166
Зарегистрирован: Пт фев 08, 2008 3:33 pm

Re: Гауссиан: Spurious integrated density or basis function

Сообщение Izberg » Чт апр 01, 2010 2:21 pm

Прошу помощи. Не сходится расчет. Пробовались DIIS, GDIIS, xqc, calcall. Болтается около одной геометрии. Хартри-фоком оптимизируется на ура.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

o-oxhem
Сообщения: 425
Зарегистрирован: Вт июл 08, 2008 10:33 pm

Re: Гауссиан: Spurious integrated density or basis function

Сообщение o-oxhem » Чт апр 01, 2010 6:43 pm

B3LYP - это функционал hybrid GGA approximation. А у Вас предполагается существенное разделение заряда, с которым GGA не может справиться. Попробуйте mp2 в том же базисе - всё должно "оптимизироваться на ура".

Izberg
Сообщения: 166
Зарегистрирован: Пт фев 08, 2008 3:33 pm

Re: Гауссиан: Spurious integrated density or basis function

Сообщение Izberg » Чт апр 01, 2010 8:43 pm

o-oxhem писал(а): GGA не может справиться. Попробуйте mp2 в том же базисе.
а кроме расчета мр2 еще что-то может помочь?

o-oxhem
Сообщения: 425
Зарегистрирован: Вт июл 08, 2008 10:33 pm

Re: Гауссиан: Spurious integrated density or basis function

Сообщение o-oxhem » Чт апр 01, 2010 8:58 pm

Ну, попытайтесь немного изменить длины связей. Но я подчеркиваю, что Вы столкнулись с тем, что GGA почти не может описать. Впрочем, ещё можно попробовать функционалы с большей долей хатри-фоковского обмена, например, BHandLyp. Но ... может все-таки mp2?
Или уменьшите базис для b3lyp. Если вдруг сойдется, то стартуйте с опт. структуры в более широком базисе.
Можно попытаться с баз. наб. cc-pvdz или cc-pvtz.
Можно доюавить Maxstep=5 в группу opt.

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: Гауссиан: Spurious integrated density or basis function

Сообщение Yurii » Сб апр 03, 2010 12:11 pm

Izberg писал(а):Прошу помощи. Не сходится расчет. Пробовались DIIS, GDIIS, xqc, calcall. Болтается около одной геометрии. Хартри-фоком оптимизируется на ура.
Используйте вместо b3lyp m062x и у вас тоже будет оптимизироваться на ура.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2700
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: Гауссиан: Spurious integrated density or basis function

Сообщение Droog_Andrey » Ср авг 31, 2011 10:06 pm

Droog_Andrey писал(а):
o-oxhem писал(а):Итак, Вашу проблему можно обойти.

Я добавил в скрипт: 6D 10F IOP(3/47=28)
Вот, теперь понятно. Иопы - хорошая штука.
Оказалось, дело в том, что в базисных наборах UGBS присутствуют базисные функции с очень узкими максимумами, для которых необходимо большее разрешение интегральной сетки в радиальном направлении, вплоть до Integral(DKHSO,Grid=600590) для тяжёлых атомов. Если же просто указать IOp(3/47=28), то в околоядерном пространстве получится чёрт знает что, а это существенно для того же золота и т.п.
Последний раз редактировалось Droog_Andrey Сб сен 03, 2011 2:56 pm, всего редактировалось 2 раза.
2^74207281-1 is prime!

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 682
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: Гауссиан: Spurious integrated density or basis function

Сообщение Yurii » Ср авг 31, 2011 11:12 pm

В g03 от этой ошибки для некоторых систем нельзя было избавиться и при "приличных" атомах (С, H), и при "приличных" базисах. Вроде я об этом уже писал.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 7 гостей