InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

здесь можно обсудить кошечек и ёжиков
Аватара пользователя
PAY
Сообщения: 229
Зарегистрирован: Пн окт 22, 2007 10:44 am

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение PAY » Чт июл 03, 2008 1:29 pm

adgaj писал(а): Ты уже не первый, кто мне это говорит. Но меня больше всего огорчает в такое говорящих людях, что дальше этого ничего не идет.
Ну ты интересный... Ты что думаешь, все сразу кинутся тебе на помощь составлять задачи, писать прогу? Если бы у меня появилось желание делать это, то сделал бы самостоятельно. Но никакого смысла я не вижу в создани такой системы. (По-крайней мере для меня). Ценность она может составить для преподов.
Еще: я из дисфора решил максимум задачек 20-30 и то, потому что было больше интересны не задачки, а именно сама программа, пощелкать, побаловаться и прочее.
Если составлять уж задачи, то не для студентов НГУ(потому что там эта прога нах кому не нужна), а ровняться на мировой уровень, делать мощную прогу на английском языке и писать ее под web на PHP или чем-нибудь подобном.
Кстати, а это хорошая мысль! В принципе, я бы поучавствовал в таком проекте, как в составлении задач, так и в написании программы на PHP. Надо подумать над этим... :issue:
Erwin with his psi can do
Calculation quite a few
But one thing has not been seen
Just what does psi really mean?

Аватара пользователя
adgaj
Сообщения: 518
Зарегистрирован: Чт мар 16, 2006 3:29 pm

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение adgaj » Чт июл 03, 2008 1:31 pm

Ну как сказать неочевидный... Не видеть же студентам какие Инчи вращаются в этом ДИСФОРе! :D
А Смаилз... Нехватало только ещё и в них разбираться )))
А книжка? А кидай книжку! :wink:

Аватара пользователя
adgaj
Сообщения: 518
Зарегистрирован: Чт мар 16, 2006 3:29 pm

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение adgaj » Чт июл 03, 2008 1:35 pm

PAY писал(а):Надо подумать над этим... :issue:
Вот-вот, думай. Потому что у мну на примете нет какого-либо PHP программера. Будешь ценным кадром )))
Что же до задач на англицком да и вообще для Веба. Хорошо! Прекрасно! Замечательнейши!!!! Но только после написания дисфора для ПК. И так я все алгоритмы до конца не осознаю, с ними бы разобраться...

Аватара пользователя
PAY
Сообщения: 229
Зарегистрирован: Пн окт 22, 2007 10:44 am

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение PAY » Чт июл 03, 2008 1:40 pm

adgaj писал(а):
PAY писал(а):Надо подумать над этим... :issue:
Вот-вот, думай. Потому что у мну на примете нет какого-либо PHP программера. Будешь ценным кадром )))
Что же до задач на англицком да и вообще для Веба. Хорошо! Прекрасно! Замечательнейши!!!! Но только после написания дисфора для ПК. И так я все алгоритмы до конца не осознаю, с ними бы разобраться...

Блин, если я и буду этим заниматься, то точно не с тобой. У меня есть знакомые, как PHP-программеры, так и люди, знающие органику очень продвинуто(по-крайне мере один точно :D(привет ему кстати) ). Я PHP на таком уровне еще не знаю пока(я токо учусь). Но вот эти всякие SFи проч. они используют для рисования ChemDraw и ему подобные штуки, вот интересно как они реализуют это "узнавание" :issue:
Erwin with his psi can do
Calculation quite a few
But one thing has not been seen
Just what does psi really mean?

Аватара пользователя
adgaj
Сообщения: 518
Зарегистрирован: Чт мар 16, 2006 3:29 pm

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение adgaj » Чт июл 03, 2008 1:48 pm

Ээ... Какое узнавание?

Marxist

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение Marxist » Чт июл 03, 2008 1:49 pm

Тебя в первую очередь интересует вторая глава.
В смайлсах уж точно разобраться проще, чем в инчи. Ну и код бабеля посмотри.

Аватара пользователя
PAY
Сообщения: 229
Зарегистрирован: Пн окт 22, 2007 10:44 am

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение PAY » Чт июл 03, 2008 1:52 pm

adgaj писал(а):Ээ... Какое узнавание?
Ну это я так образно назвал процесс поиска по БД введенной структуры/подструктуры. В ДИСФОР ведь просто точное соответствие структур надо будет искать. Задача еще легче
Erwin with his psi can do
Calculation quite a few
But one thing has not been seen
Just what does psi really mean?

Аватара пользователя
PAY
Сообщения: 229
Зарегистрирован: Пн окт 22, 2007 10:44 am

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение PAY » Чт июл 03, 2008 1:53 pm

Кстати, где-то в инете я уже видел что-то подобное :roll: :roll: :roll:
Erwin with his psi can do
Calculation quite a few
But one thing has not been seen
Just what does psi really mean?

Аватара пользователя
adgaj
Сообщения: 518
Зарегистрирован: Чт мар 16, 2006 3:29 pm

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение adgaj » Чт июл 03, 2008 2:01 pm

PAY писал(а):В ДИСФОР ведь просто точное соответствие структур надо будет искать. Задача еще легче
Мало того что точное, так ещё и выбирать всего из штук пяти структур.

eukar

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение eukar » Сб июл 05, 2008 8:10 pm

1) ACD/ChemSketch умеет генерить инчи. Даже фришная версия. Это к тому, чтобы проверить правильность своего алгоритма при случае. (Программа, как известно, написана в России).
2) Он учитывает цис-транс, потому что коды для изомеров дает разные (с точностью до одного знака плюс или минус в нотации).
3) Сейчас личной отправлю контакт руководителя этого проекта. По совместительству он член какого-то июпашного совета по номенклатуре. Как будешь его уговаривать раскрывть секреты - твое дело...

Аватара пользователя
adgaj
Сообщения: 518
Зарегистрирован: Чт мар 16, 2006 3:29 pm

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение adgaj » Вс июл 06, 2008 10:30 am

Хех, а может и не придеться - я пошастал по Академу, наткнулся на инст. Математики, ну и нашел там человека, занимающегося всяческими графами и их изоморфизмом, т. е. канонизацией. Так же у него есть наработки по циклам, это к цис-трансу, а так же по ранжированию соседей, это к оптике.
Теперь осталось это всё перекинуть с Паскаля в Си, немного принакрутить, да и похоже сё.

Правда возникнет ещё куча проблем...

Cherep
Сообщения: 23489
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение Cherep » Вс июл 06, 2008 3:44 pm

Хорошо если б вы это распространяли потом по лицензии GPL и код открыли, соответственно :shuffle: Это пожелание, всеголишь.

Аватара пользователя
adgaj
Сообщения: 518
Зарегистрирован: Чт мар 16, 2006 3:29 pm

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение adgaj » Вс июл 06, 2008 5:04 pm

Ээ... Ну... Так сказать...

Короче мы посидим и подумаем над этим предложением :roll:

ЗЫ А хто такое
Cherep писал(а):лицензии GPL

Cherep
Сообщения: 23489
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение Cherep » Вс июл 06, 2008 5:38 pm

http://www.fsf.org/licensing/licenses/gpl.html
The licenses for most software and other practical works are designed to take away your freedom to share and change the works. By contrast, the GNU General Public License is intended to guarantee your freedom to share and change all versions of a program--to make sure it remains free software for all its users.
Чтобы у других была свобода поковыряться в ваших исходниках. Может они чего подправят.

Аватара пользователя
adgaj
Сообщения: 518
Зарегистрирован: Чт мар 16, 2006 3:29 pm

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение adgaj » Вс июл 06, 2008 5:45 pm

Поправят, куда денутся. У программера малость кривые руки, или мелкие уши - мну он не слышит на нек. важные (с моей точки зрения) исправления. Вот так то.

Аватара пользователя
pH<7
Сообщения: 4236
Зарегистрирован: Ср апр 21, 2004 6:48 pm
Контактная информация:

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение pH<7 » Вт июл 15, 2008 3:12 am

Hello Paul,

I've really enjoy reading your blog. You're onto
something by reviewing synthetic papers the way you
do.

Like you, I agree that an InChI on a Webpage is
unsightly and unnecessary. Unfortunately, despite many
attempts by myself and others, I know of no way to
unobtrusively get an intact, long InChI into a Webpage
without breaking the layout.

Awhile back, I followed the path you're taking now,
but with no success. My intent was to have google
index the InChI so that it could be found by the
InChIMatic service:

http://inchimatic.com

I've written about my little experiment here:

http://depth-first.com/articles/2007/03 ... -chemistry

Six months later, Google still hasn't indexed the
InChI I tried to sneak through by hiding it in my
article. Nor have any of the other major search
engines. The only thing that comes up are links to the
above article, which puts the InChI in plain sight (I
used the overflow property to prevent my page layout
from breaking -- still, even that has it's
problems...)

The problem is that Google fights a daily battle
royale against spammers and Search Engine Optimization
(SEO) tricksters. All of the things we can think of to
hide InChIs are also the same techniques used by these
lugnuts trying to sell junk. Some
would even say that trying to hide "meaningless"
content such as InChIs in your webpage will result in
a penalty in Google's results. I can't vouch for that
theory, but who knows? At the very least the content
is ignored during Google's indexing process.

In Firefox 2/Linux, I couldn't see the alt text by
mousing over the second image in your article. Nor in
Linux/Konqueror.

Recently, the InChI team has released software that
builds fixed-length InChIs using a technique called
hashing:

http://www.iupac.org/inchi/release102.html

It's a promising approach, but like InChI will depend
on widespread adoption to become useful.

Given the current problems, I stick by my conclusion
that the Web still isn't ready for chemistry. That's
not to say the solution isn't waiting to be discovered
- just that it hasn't been found and made public yet.

cheers,
Rich
Carpe diem

Аватара пользователя
adgaj
Сообщения: 518
Зарегистрирован: Чт мар 16, 2006 3:29 pm

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение adgaj » Вт июл 15, 2008 11:16 am

Хм... Когда я рылся в чьюх-то блогах, я похоже этот текст пропустил - наверно автор придумал незаинтересовавшее меня название. Прочитал этот текст тут.
Общую идею я уже слышал и читал у создателей Инча, когда они повествовели об ИнчеКее. Чесслово, это звучало как панацея от всех бед. :roll:
А в остальном... Этот кусок Инча больше для интереса, чем для того самого злобного слова ДИСФОР. Или какая-то другая идея была у тебя, Протончег, когда ты копировал этот текст сюда? :?

ЗЫ Пасибо, ещё один текст на англицком - а то я уже хотел их забросить.

Аватара пользователя
pH<7
Сообщения: 4236
Зарегистрирован: Ср апр 21, 2004 6:48 pm
Контактная информация:

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение pH<7 » Вт июл 15, 2008 6:55 pm

Не было никакой идеи.
Carpe diem

Аватара пользователя
adgaj
Сообщения: 518
Зарегистрирован: Чт мар 16, 2006 3:29 pm

Re: InChI с чем его едят?! И кто знает о нём всё...

Сообщение adgaj » Ср июл 16, 2008 1:13 am

Сенкс, что сказал, а то уже цатый раз перечитываю, и идею увидеть не могу... :D

Ответить

Вернуться в «лицом к лицу»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 14 гостей