Снятие Mtt с лизина

[Шри-Япутра]

Коллеги, кто-нибудь снимал селективно mtt с лизина? А то слетает, редиска, в ходе синтеза (пептид делаем на ринк-амидном полимере по Fmoc-стратегии, активация HBTU).

[Serty]

Mtt -что это, а то я в списке защитных групп(Greene Wuts, 3ed) что-то не нашел...

[Шри-Япутра]

Mtt -что это, а то я в списке защитных групп(Greene Wuts, 3ed) что-то не нашел...

адское детище Novabiochem, тритил в котором в одном бензольном ядре в пара-положении метильная группа . есть еще Mmt-то же, только в пара положении метокси-группа, вроде как более лабильная защита. Страшно предположить, сколь она лабильна-Mtt, похоже, слетает даже от сквозняка

[Marxist]

тритил в котором в среднем бензольном ядре метильная группа в пара-положении

В каком ещё среднем?

[Шри-Япутра]

в одном из бензольных ядер. извиняюсь

[Schlenk]

Mtt снимается 1% ТФА в дихлорметане. методика в каталоге novabiochem.

[pH<7]

Не вижу био, зачем в эту ветку?

[Cherep]

вчера забыл перекинуть.

[Cherep]

А пептид с ринк-амидного полимера не слетит в этих кислых условиях?
Кстати тут не все пептидчики, можно было бы и формулки нарисовать.

[Schlenk]

с rink amide в 1% не слетит

[Cherep]

вообще, логично наверное

[Serty]

Коллеги, кто-нибудь снимал селективно mtt с лизина? А то слетает, редиска, в ходе синтеза (пептид делаем на ринк-амидном полимере по Fmoc-стратегии, активация HBTU).

Понятно, с mmt имели дело, но не знал этой аббревиатуры Но мне осталось непонятным: ее нужно селективно снять? Или она слетает при синтезе с HBTU, когда не нужно? Советы по снятию уже есть... А вот как она слетает при синтезе не очень понятно - ведь там неск. экв. трет. амина используется. Кстати, а какой - DIPEA, TEA, NMM?

[Шри-Япутра]

10 экв DIPEA. Нам тоже не очень понятно, почему слетает. Методик в новобиохеме аж две (вторая-гексафторизопропанолом/трифторэтанолом в хлористом метилене.) Но обе работают (у нас) только в том случае,если Mtt-лизин находится на N-конце. Если же в середине или на С-конце, Mtt валится в ходе синтеза.
Собственно, потому и спрашиваю-может кто-то сталкивался со схожей проблемой?

[Алексей Хрущёв]

Наверно защиту HBTU губит.
Попробуйте другие активаторы или другую защитную группу. Как говорится ВОК- вам в помощь
Или разветвленные пептиды варите

[Serty]

Наверно защиту HBTU губит.
Попробуйте другие активаторы или другую защитную группу. Как говорится ВОК- вам в помощь
Или разветвленные пептиды варите

А как он ее может губить?
Я не знаю в каком виде вводятся аминокислоты, если в виде HCl-солей может срабатывает DIPEA*HCl как источник протона для снятия кислотолабильной группы? Хотя я о таком не слышал... C HBTU работаем постоянно, но не в пептидном синтезе, и наиболее типичными побочными процессами являются:

1) R-NH2 -> R-N=C(NMe2)2 для вторичных аминов также образуются гуанидины. Обычно происходит при неправильном порядке загрузки, или если кислота слишком медленно активируется.
2) R-COOBt + Et3N -> R-CONEt2 Для DIPEA тоже идет, но в меньшей степени. Это бывает при работе с слабоосновными аминами, типа хлоранилинов

Кстати, наблюдается просто снятие защиты, или побочные?

[Алексей Хрущёв]

Известно, что HOBT, то из чего "делают" наиболее популярные конденсирующие реагенты - BOP, HBTU, TBTU, снимает некоторые защитные группы в очень мягких условиях, например Tos у тау-азота гистидина. (Гершкович, Химический синтез пептидов).
Может имеет место реакция по схожему механизму

Гидрохлориды аминокислот не применяются, аминогруппа должна быть защищенной

[Serty]

Гидрохлориды аминокислот не применяются, аминогруппа должна быть защищенной

Совсем забыл пептидный синтез Действительно, наращивание идет с другого конца. Я как то больше использую HBTU в других целях, а там гидрохлоридов полно. В приведенных вами примерах скорее действует BtO-, но вряд ли он будет сносить кислотолабильную группу.

Шри-Япутра
А как обнаруживается, что Mtt слетела? Получаются разветвленные пептиды?

Мне вообще эта защитная группа кажется странной для Lys. Почему бы не образовываться типа RCON(Mtt)(CH2)4-... Всеже вторичный амин, хотя слабый и стерически затрудненный. Но в условиях т.ф синтеза, когда используют несколько экв. аминокислоты. Может нужны более мягкие условия или конд. агенты?

[Шри-Япутра]

я извиняюсь, после того, как взяли HFIP из новой банки, все получилось
мы варим меченные пептиды, но до этого метили их по N-концу, что не вызывает особых проблем. а тут возникла необходимость синтеза меченного по C-концу.
еще раз извиняюсь.
Правда, снять mtt 1% TFA так и не получилось. При активации HBTU/HOBt или DIC/HOBt mtt слетает нафиг при синтезе (получаются разветвленные пептиды).
в общем, если таки потрбуется работать с mtt, активируйте чистым HBTU, снимайте дихлорметан:HFIP:TFE:TIS как в новобиохеме