Платенсимицин: 999 синтезов за полтора года.

[sidhar]

Николау сварил карбаплатенсимицин и адамантанплатенсимицин. Красиво
http://chemnews.org/full/example/index.php?id=75
Статья про карба в обменнике

[pH<7]

Поправил название темы

Немного непонятно, зачем эти карбааналоги. Рентген показал, что кислород в каркасной структуре связан с треонином белка. Вроде как и без варки понятно, что метиленовое звено на его месте так не умеет. Непонятно, какой другой изостер можно тиснуть, азот не подходит - будет [-NH2-]+, сера тоже не то, сложный эфир или амид туда не вставишь... может сульфон?

[Marxist]

Рентген показал, что кислород в каркасной структуре связан с треонином белка. Вроде как и без варки понятно, что метиленовое звено на его месте так не умеет.

Рентген не смотрел &copy;, но разве треонин там не может развернуться в сторону лиганда метильной группой?

[horks]

Поправил название темы

Немного непонятно, зачем эти карбааналоги. Рентген показал, что кислород в каркасной структуре связан с треонином белка. Вроде как и без варки понятно, что метиленовое звено на его месте так не умеет. Непонятно, какой другой изостер можно тиснуть, азот не подходит - будет [-NH2-]+, сера тоже не то, сложный эфир или амид туда не вставишь... может сульфон?

"X-ray crystallographic analysis of the platensimycin
complex with its target FabF protein indicates a hydrogen
bonding interaction between the ether oxygen of the molecule and
the T270 threonine residue of its target. It was with the aim of
investigating the effect of this ethereal hydrogen bond acceptor on
the platensimycin bioactivity that the synthesis of carbaplatensimycin
(3) was undertaken."

Вряд ли такая межмолекулярная водородная связь может быть сильной. Видимо, хотели оценить, на сколько сильно скажется такая замена на устойчивости комплекса. Будет ли она критичной для проявления биоактивности.

[sidhar]

Вряд ли такая межмолекулярная водородная связь может быть сильной. Видимо, хотели оценить, на сколько сильно скажется такая замена на устойчивости комплекса. Будет ли она критичной для проявления биоактивности.

А в придачу красивую вещь сварить и попонтоваться

[horks]

Скорее всего у Николау был проект, касающийся синтеза разных аналогов. Про активные вещества они пока молчат, патент готовят. А про неактивные им разрешили написать креатив в JACS.

[VOVAN CIR]

Скорее всего у Николау был проект, касающийся синтеза разных аналогов. Про активные вещества они пока молчат, патент готовят. А про неактивные им разрешили написать креатив в JACS.

Наверняка так Сейчас сидят и пишут список всех возможных заместителей на 500 страниц

[Marxist]

Вряд ли такая межмолекулярная водородная связь может быть сильной. Видимо, хотели оценить, на сколько сильно скажется такая замена на устойчивости комплекса. Будет ли она критичной для проявления биоактивности.

Что Вам не нравится? Отличная водородная связь, даже не галогеновая и не CH...O.

[horks]

Вряд ли такая межмолекулярная водородная связь может быть сильной. Видимо, хотели оценить, на сколько сильно скажется такая замена на устойчивости комплекса. Будет ли она критичной для проявления биоактивности.

Что Вам не нравится? Отличная водородная связь, даже не галогеновая и не CH...O.

CH...O в каких соединениях такая бывает??

[Marxist]

CH...O в каких соединениях такая бывает??

J. Med. Chem. 2005, 48, 1278-1281
см. в обменнике

Вообще в лиганд-рецепторных комплексах встречается очень много извратных взаимодействий, причём в большинстве случаев они энергетически выгодные.

[IB]

Поправил название темы

. Есть вариант - "Платенсимицин и 40 его синтезов за полтора года". Ну вроде "Али-Баба и сорок разбойников". Символично.

А так с "999" "проблему 2000-ого года" напоминает

[pH<7]

Только что вышедший обзор по сабжу в exchange.

[Cherep]

<...> Thus it was a sensation when a Merck research group reported that classical screening of metabolites from Streptomyces platensis has unearthed a low-molecular-weight organic compound with remarkable antibiotic properties.

Ну чего они преувеличивают. Молекула сложнее чем пенициллины...