Избыток доказательств

форум для специалистов в области органической химии
organic chemistry issues discussion for professional scientists
Аватара пользователя
Cezar
Сообщения: 3483
Зарегистрирован: Пт апр 25, 2003 6:31 pm
Контактная информация:

Избыток доказательств

Сообщение Cezar » Вт окт 23, 2007 9:19 am

В большинстве синтетических статей, особенно последних годов, что мне приходилось видеть, стандартным набором для идентификации органических веществ является следующий: 1Н NMR, 13С NMR, IR, MS, элементный анализ, когда не видишь этого "джентльменского" набора как-то уже даже непривычно становится. Так у меня простой вопрос, а зачем?

Вот берут, изучают какой-нибудь катализ, на простой модели, берут десяток несложных субстратов, на метиленовую группу отличных, и давай с них все это безобразие снимать, хотя для идентификации элементного анализа и протонника хватает за глаза. Или на моих комплексах, где углеродник не несет, фактически, никакой особой информации и протона-фосфора хватает за глаза - во всех статьях приведены. Зачем эта бессмысленная трата денег, прибоных ресурсов? Для красоты? Для экономии мышления?

Для красоты, научились бы сначала не путать спектры веществ в том же самом саплементари.

Простите, это я что-то бурчу с утра. Это все от того, наверное, что я просто чувствую себя ущербным по сравнению с западными коллегами, вот и жалуюсь. Хотя, аргументы мои не бессмысленны.
Необходимость преодоления собственного интеллектуального ничтожества есть необходимое и достаточное ограничение в доступе к научной информации

Serty
Сообщения: 8177
Зарегистрирован: Пт июл 06, 2007 12:17 pm

Сообщение Serty » Вт окт 23, 2007 10:09 am

13C может и у тебя не несет, а вот кому-нибудь может пригодится. А вот в особой полезности IR, особенно для сложных молекул я как-то сильно сомневаюсь.

Elochim
Сообщения: 170
Зарегистрирован: Ср июн 06, 2007 4:46 pm

Re: Избыток доказательств

Сообщение Elochim » Вт окт 23, 2007 10:38 am

Зачем эта бессмысленная трата денег, прибоных ресурсов? Для красоты? Для экономии мышления?

Я так думаю что фирмы которые составляют базы данных свойств химических соединений-спектры, фрагментацию MS, IR и т.д. в общем те базы которые потом доступны за деньги, делают анализы, в том случае если соединение новое, бесплатно и сразу все...Даже у нас есть такие,так что ничего удивительного, почему бы несделать если на халяву?

eukar

Re: Избыток доказательств

Сообщение eukar » Вт окт 23, 2007 10:47 am

Elochim писал(а):Я так думаю что фирмы которые составляют базы данных свойств химических соединений-спектры, фрагментацию MS, IR и т.д. в общем те базы которые потом доступны за деньги, делают анализы, в том случае если соединение новое, бесплатно и сразу все...
Во-первых, если анализ сделан коммерческой фирмой, вы его маловероятно встретите в открытой печати (по крайней мере без ссылки на эту фирму).
Во-вторых, по опыту работе в фирме, которая и этим тоже занимается - наоборот, такие фирмы очень уважают сканировать органические журналы на предмет снятых другими спектров и складывать в базы.

Elochim
Сообщения: 170
Зарегистрирован: Ср июн 06, 2007 4:46 pm

Re: Избыток доказательств

Сообщение Elochim » Вт окт 23, 2007 11:16 am

eukar писал(а):
Elochim писал(а):Я так думаю что фирмы которые составляют базы данных свойств химических соединений-спектры, фрагментацию MS, IR и т.д. в общем те базы которые потом доступны за деньги, делают анализы, в том случае если соединение новое, бесплатно и сразу все...
Во-первых, если анализ сделан коммерческой фирмой, вы его маловероятно встретите в открытой печати (по крайней мере без ссылки на эту фирму).
Во-вторых, по опыту работе в фирме, которая и этим тоже занимается - наоборот, такие фирмы очень уважают сканировать органические журналы на предмет снятых другими спектров и складывать в базы.
Ну это понятно, что спереть чужие данные святое дело, но думаю что как раз в таких случаях нужно давать ссылку на первоисточник, а использование без ведома владельца информации (например журнала) и без ссылок по сути чистое пиратство. В приличном обществе такое не проканает..И видимо поэтому ряд фирм предлагают услуги такого рода:
цитата с сайта одной российской компании:

Возможно получить ПМР спектр своего вещества бесплатно, если выполняются два условия:

1. Соединение не встречается в наших базах и проходит у нас проверку на невстречаемость в других коллекциях

2. Автор согласен на то, что спектр будет опубликован в базе Spectra.scope

Cherep
Сообщения: 23489
Зарегистрирован: Чт окт 30, 2003 9:22 am

Сообщение Cherep » Вт окт 23, 2007 5:28 pm

Вы протонник сахаров видели?
На личном опыте: COSY там иногда не помогает при отнесении.
А если 13C + HMQC вдобавок, то зело полезно.

Аватара пользователя
Cezar
Сообщения: 3483
Зарегистрирован: Пт апр 25, 2003 6:31 pm
Контактная информация:

Сообщение Cezar » Вт окт 23, 2007 6:01 pm

Вы протонник сахаров видели?
Видели, вопрос не в том, что все эти методы никогда не нужны, а в том, что с ванилина достаточно снять протонник, чтобы понять, что он ванилин.
Необходимость преодоления собственного интеллектуального ничтожества есть необходимое и достаточное ограничение в доступе к научной информации

Аватара пользователя
Сержл
Сообщения: 9875
Зарегистрирован: Пн авг 21, 2006 8:01 pm

Сообщение Сержл » Вт окт 23, 2007 6:18 pm

Cezar писал(а):
Вы протонник сахаров видели?
Видели, вопрос не в том, что все эти методы никогда не нужны, а в том, что с ванилина достаточно снять протонник, чтобы понять, что он ванилин.
Точно :roll: , а в 13 С все расходится лучше. Надо быть супердарованием (в случае сложного спектра), ну и очень спокойным человеком, что б только по протону сказать- да, вот оно. Я уверен только, когда сниму все, что под руками. Хотя, в ряде случаев, достаточно и 31Р, когда косяков не предвидится. Но для статьи еще делаю ряд видов спектроскопии, что б совесть не грызла, в "академию дураков" пока не хочется.

Аватара пользователя
Cezar
Сообщения: 3483
Зарегистрирован: Пт апр 25, 2003 6:31 pm
Контактная информация:

Сообщение Cezar » Вт окт 23, 2007 7:03 pm

Надо быть супердарованием (в случае сложного спектра), ну и очень спокойным человеком, что б только по протону сказать- да, вот оно.
Да никто про сложные спектры не говорит, говорю муру снимают по тридцать раз, а потом чего-нибудь сделаешь хорошего, а тебе в редакции фигу - чего у вас углеродника нет. И ответ, а нахрена? Не принимается.
Необходимость преодоления собственного интеллектуального ничтожества есть необходимое и достаточное ограничение в доступе к научной информации

Аватара пользователя
pH<7
Сообщения: 4236
Зарегистрирован: Ср апр 21, 2004 6:48 pm
Контактная информация:

Сообщение pH<7 » Вт окт 23, 2007 7:04 pm

Cezar писал(а):
Вы протонник сахаров видели?
Видели, вопрос не в том, что все эти методы никогда не нужны, а в том, что с ванилина достаточно снять протонник, чтобы понять, что он ванилин.
Да ну?! Вот это кто?

9.83 (s, 1H)
7.44 (d, 1H, J=1.9 Hz)
7.42 (dd, 1H, J=1.9, 8.8 Hz)
6.97 (d, 1H, J=8.8 Hz)
6.12 (br s, 1H)
3.97 (s, 3H)

Осторожней с примерами...
Последний раз редактировалось pH<7 Вт окт 23, 2007 9:01 pm, всего редактировалось 1 раз.
Carpe diem

Аватара пользователя
Сержл
Сообщения: 9875
Зарегистрирован: Пн авг 21, 2006 8:01 pm

Сообщение Сержл » Вт окт 23, 2007 7:11 pm

Это рафинад, больше нравятся статьи, где 1.2-4.1, m, 20H, 6.8-8.7, m, 30 H.

Аватара пользователя
pH<7
Сообщения: 4236
Зарегистрирован: Ср апр 21, 2004 6:48 pm
Контактная информация:

Сообщение pH<7 » Вт окт 23, 2007 7:12 pm

Это пример простого спектра (с максимумом информации, для полного счастья), из которого Cezar берётся сделать вывод о структуре.

Рафинад - это dddd (J = a, b, c, d Hz)
Carpe diem

Аватара пользователя
Сержл
Сообщения: 9875
Зарегистрирован: Пн авг 21, 2006 8:01 pm

Сообщение Сержл » Вт окт 23, 2007 7:18 pm

У меня все-таки кое-чего играет, если только по протону описывать. А вдруг растворитель влетел, а вдруг примесюга какая. Когда несколько спектров (и все сходится), тогда спокойнее, хотя, иногда, все равно есть сомнения.

Аватара пользователя
pH<7
Сообщения: 4236
Зарегистрирован: Ср апр 21, 2004 6:48 pm
Контактная информация:

Сообщение pH<7 » Вт окт 23, 2007 7:26 pm

Неудивительно, что играет, и не у тебя одного. Поэтому сейчас требуют то, что требуют. Это подпитывается регулярными случаями откровенного гона даже в ведущих журналах.

Есть люди, которые хотели бы спектры в статьях видеть в FIDах, даже не в графическом виде.
Carpe diem

Аватара пользователя
ИСН
Робин Гуд
Сообщения: 8535
Зарегистрирован: Пт окт 10, 2003 5:32 pm
Контактная информация:

Сообщение ИСН » Вт окт 23, 2007 7:26 pm

Мну бесит, когда при наличии хорошего и несомненного (да, он не всегда таков) Xray - хотят ещё чего-то.

Аватара пользователя
Сержл
Сообщения: 9875
Зарегистрирован: Пн авг 21, 2006 8:01 pm

Сообщение Сержл » Вт окт 23, 2007 7:31 pm

Рентген штука хорошая, но, как говорил покойник Стручков, растет из смесюги только одно, рентген показывает либо только цис, либо только транс. Хотя, картинки народ любит.

Аватара пользователя
Cezar
Сообщения: 3483
Зарегистрирован: Пт апр 25, 2003 6:31 pm
Контактная информация:

Сообщение Cezar » Вт окт 23, 2007 7:33 pm

Да ну?! Вот это кто?
Понятия не имею, хотя подумаю на досуге. Альдегид, транс-алкен, сопряженный с кольцом, метокси группа или сложноэфирная.

Это сферическое вещество в вакууме или оно получено в какой-то реакции, каким-то методом, с него элементник есть? Ну что ты детский сад разводишь, неужели не ясно, о чем я говорю. Давай еще задачек сюда олимпиадных накидаем, смотри как голову ломать придется, какое это все отношение к реальности то имеет?

Я всего лишь хочу сказать, что о некоторые авторы используют явно избыточное для доказательства несложного вещества количество методов. Ты хочешь сказать, что всегда чем больше, тем лучше?
Мну бесит, когда при наличии хорошего и несомненного (да, он не всегда таков) Xray - хотят ещё чего-то.
Это то как раз понятно, во-первых, хиральность рентген не определяет для одноцентровых молекул, насколько я понимаю, во-вторых, я когда воспроизводить буду тоже на рентген потащу для сверки с оригиналом?
Необходимость преодоления собственного интеллектуального ничтожества есть необходимое и достаточное ограничение в доступе к научной информации

Аватара пользователя
ИСН
Робин Гуд
Сообщения: 8535
Зарегистрирован: Пт окт 10, 2003 5:32 pm
Контактная информация:

Сообщение ИСН » Вт окт 23, 2007 7:49 pm

Cezar писал(а):во-первых, хиральность рентген не определяет для одноцентровых молекул, насколько я понимаю
всё он определяет, лишь бы там были хоть какие-то атомы из следующих строчек таблицы. если тяжелее кислорода ничего нет, тогда да, беда.
С "во-вторых" да, хрен поспоришь.

Аватара пользователя
Ahha
Сообщения: 3937
Зарегистрирован: Чт сен 20, 2007 7:02 pm

Сообщение Ahha » Вт окт 23, 2007 8:02 pm

pH<7 писал(а): Вот это кто?

9.83 (s, 1H)
7.44 (d, 1H, J=1.9 Hz)
7.42 (dd, 1H, J=1.9, 8.8 Hz)
6.97 (d, 1H, J=8.8 Hz)
6.12 (s, 1H)
3.97 (s, 3H)
Правильный ответ в данном случае "черт его знает". Но так, чисто из спортивного интереса - м-метоксибензальдегид? В общем, божиться, что угадал хотя бы класс соединения, не буду. Первое, что в голову приходит из общих соображений, благо, правила расщепления в фенильном кольце я уже благополучно забыл.

Аватара пользователя
pH<7
Сообщения: 4236
Зарегистрирован: Ср апр 21, 2004 6:48 pm
Контактная информация:

Сообщение pH<7 » Вт окт 23, 2007 9:11 pm

Ahha писал(а):Правильный ответ в данном случае "черт его знает". Но так, чисто из спортивного интереса - м-метоксибензальдегид? В общем, божиться, что угадал хотя бы класс соединения, не буду. Первое, что в голову приходит из общих соображений, благо, правила расщепления в фенильном кольце я уже благополучно забыл.
Чтобы ароматика уехала до 6.12, надо постараться. Я подправил исходные условия (6.12 br s). Это изованилин, с базы AIST.
Cezar писал(а):
Да ну?! Вот это кто?
Понятия не имею, хотя подумаю на досуге. Альдегид, транс-алкен, сопряженный с кольцом, метокси группа или сложноэфирная.

Это сферическое вещество в вакууме или оно получено в какой-то реакции, каким-то методом, с него элементник есть? Ну что ты детский сад разводишь, неужели не ясно, о чем я говорю. Давай еще задачек сюда олимпиадных накидаем, смотри как голову ломать придется, какое это все отношение к реальности то имеет?

Я всего лишь хочу сказать, что о некоторые авторы используют явно избыточное для доказательства несложного вещества количество методов. Ты хочешь сказать, что всегда чем больше, тем лучше?
У транс-алкенов не бывает таких маленьких констант.
Просто даже ванилин как пример не слишком сложного вещества - мимо. Приведи какой-нибудь пример избыточной, по твоему мнению, характеризации.

Текущие требования -- 1H, 13C, HRMS, IR (как простейший метод, съёмка занимает 30 секунд), удельное вращение (если есть) считаю приемлемыми. Это просто общепринятый набор методов характеризации, и не нам его менять. Так заведено, а я не против. Самому приятно, в конце концов.
Carpe diem

Ответить

Вернуться в «органическая химия / organic chemistry»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 15 гостей