+++структурки антибиотиков SF, reaxis или spresi

Поиск в химических базах данных (Beilstein, SciFinder и др.)
Ответить
Аватара пользователя
Vanya Ivanov
Сообщения: 1796
Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm

+++структурки антибиотиков SF, reaxis или spresi

Сообщение Vanya Ivanov » Сб фев 09, 2013 11:02 am

Задачка не очень тривиальная, но все же может сработает ....
Я тут синтезнул простецкие производные эритромицинов - вроде с чистотой все Ок.
Но вот с доступом к базам - проблемы. В общедоступных базах по кейвордам что то не нашел, но соединения простые и их должны были бы описать. Помогите, пожалуйста, со структурным поиском по платным БД.
Я даю производные эритромицина и кларитромицина. Это разные нотации smile в т.ч. со стерео и без стерео структруры, с геомерическими изомерами и без. Может что нибудь сработает?

CC[C@H]3OC(=O)[C@H]©[C@@H](OC1C[C@@]©(OC)[C@@H](O)[C@H](C)O1)[C@H]©[C@@H](OC2O[C@H](C)C[C@H](N(C)C)[C@H]2O)[C@]©(O)C[C@@H](C)C(=NOCC(=O)O)[C@H]©[C@@H](O)[C@]3(C)O


CCC3OC(=O)C(C)C(OC1CC(C)(OC)C(O)C(C)O1)C(C)C(OC2OC(C)CC(N(C)C)C2O)C(C)(OC)CC(C)C(=NOCC(=O)O)C(C)C(O)C3(C)O

CCC3OC(=O)C(C)C(OC1CC(C)(OC)C(O)C(C)O1)C(C)C(OC2OC(C)CC(N(C)C)C2O)C(C)(O)CC(C)C(=NOCC(=O)O)C(C)C(O)C3(C)O

CCC3OC(=O)C(C)C(OC1CC(C)(OC)C(O)C(C)O1)C(C)C(OC2OC(C)CC(N(C)C)C2O)C(C)(OC)CC(C)C(=NOCC(=O)O)C(C)C(O)C3(C)O

CCC3OC(=O)C(C)C(OC1CC(C)(OC)C(O)C(C)O1)C(C)C(OC2OC(C)CC(N(C)C)C2O)C(C)(OC)CC(C)C(=NOCC(O)=O)C(C)C(O)C3(C)O
Последний раз редактировалось Vanya Ivanov Пн фев 11, 2013 9:06 am, всего редактировалось 1 раз.

anonimous
Сообщения: 143
Зарегистрирован: Сб июн 14, 2008 4:04 pm

Re: структурки антибиотиков SF, reaxis или spresi

Сообщение anonimous » Сб фев 09, 2013 4:09 pm

Первый smile рисовалка не распознала.По остальным в Reaxys ничего нет,ни в качестве продукта,ни просто по структурному поиску :(

Аватара пользователя
Vanya Ivanov
Сообщения: 1796
Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm

Re: структурки антибиотиков SF, reaxis или spresi

Сообщение Vanya Ivanov » Сб фев 09, 2013 6:03 pm

Может с моим редактором smile что то? - но вроде нарисовал правильно, все на месте.
А что пишет? может попробовать ввести протой smile кларитромицина? может мой редактор не корректно пишет большой smile - хотя вряд ли. Ведь раньше проблем не было.
Найдите что нибудь для простого кларитромицина, пожалуйста, что бы опробовать правильность написания структур. Если работает для не трансформированной структуры, а для производного дает - "0", то есть вероятность, что структурка новая.

исходный кларитромицин (информация не нужно - просто попробуйте - работает или нет):
CCC1C(C(C(C(=O)C(CC(C(C(C(C(C(=O)O1)C)OC2CC(C(C(O2)C)O)(C)OC)C)OC3C(C(CC(O3)C)N(C)C)O)(C)OC)C)C)O)(C)O

одно и тоже производное - из двух разных редактор (инфа нужна - очень):

CCC1C(C(C(C(=NOCC(=O)O)C(CC(C(C(C(C(C(=O)O1)C)OC2CC(C(C(O2)C)O)(C)OC)C)OC3C(C(CC(O3)C)N(C)C)O)(C)OC)C)C)O)(C)O

CCC3OC(=O)C(C)C(OC1CC(C)(OC)C(O)C(C)O1)C(C)C(OC2OC(C)CC(N(C)C)C2O)C(C)(OC)CC(C)C(=NCCC(O)=O)C(C)C(O)C3(C)O

Может кто поможет со SciFinderom?

Аватара пользователя
SkydiVAR
Сообщения: 10845
Зарегистрирован: Пн янв 19, 2009 12:51 am
Контактная информация:

Re: структурки антибиотиков SF, reaxis или spresi

Сообщение SkydiVAR » Сб фев 09, 2013 6:49 pm

SF. нашелся только один по подструктуре.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Меч-кладенец - оружие пофигистов.

mishka
Сообщения: 6023
Зарегистрирован: Вт окт 16, 2007 4:59 pm

Re: структурки антибиотиков SF, reaxis или spresi

Сообщение mishka » Сб фев 09, 2013 9:09 pm

субструктурный поиск по кларитромицину
CCC1C(C(C(C(=O)C(CC(C(C(C(C(C(=O)O1)C)OC2CC(C(C(O2)C)O)(C)OC)C)OC3C(C(CC(O3)C)N(C)C)O)(C)OC)C)C)O)(C)O
в реаксисе дает 1068 substances out of 752 citations


реаксис нашел из первого поста по субструктуре для этого
CCC3OC(=O)C(C)C(OC1CC(C)(OC)C(O)C(C)O1)C(C)C(OC2OC(C)CC(N(C)C)C2O)C(C)(O)CC(C)C(=NOCC(=O)O)C(C)C(O)C3(C)O
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Vanya Ivanov
Сообщения: 1796
Зарегистрирован: Пн авг 29, 2005 6:40 pm

Re: структурки антибиотиков SF, reaxis или spresi

Сообщение Vanya Ivanov » Пн фев 11, 2013 9:06 am

Спасибо огромное, то что нужно.
А то я уж испугался, что синтезнул, что-то новое. Хлопот не оберешься.

Ответить

Вернуться в «Химические базы данных»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 7 гостей