Проблема в синтезе тетрапептида.

форум для специалистов в области органической химии
organic chemistry issues discussion for professional scientists
Ответить
Redmannn
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пт сен 11, 2009 8:32 pm

Проблема в синтезе тетрапептида.

Сообщение Redmannn » Ср фев 16, 2011 9:02 pm

Доброго врмени суток.

Помимо всего прочего занимаюсь ситезом (наработкой) тетрапептида.Большого опыта в синтезе пептидов не имею и поэтому уповаю на чью либо помощь в вопросе увеличения чистоты продукта последней стадии мойго синтеза:
Безымянный.gif
Методика:
В 30 мл диметилформамида рассворяют 5,51 г пролил-аргинил-глицинамида дигидрохлорида, охлаждают с помощью ледяной бани и добавляют 2,04 мл N-метилморфолина (КП-28). С интервалами в 10 минут к перемешиваемой реакционной смеси последовательно добавляют 2,59 г N-ацетил-D-метионина, 2,07 г 1-гидроксибензотриазола гидрата и 2,59 г N,N’-дициклогексилкарбодиимида. Перемешивают в течение 2 часа при 3-5С, затем до утра при комнатной температуре. Выпавший осадок N,N’-дициклогексилмочевины отфильтровывают, к фильтрату добавляют 150 мл диэтилового эфира, перемешивают, после отстаивания слой растворителей декантируют в емкость. Остаток переосаждают эфиром и этил ацетатом из метанола.

Ничего особенного (казалось бы), таким же методом (DCC - "конденсатор") получаю исходный трипептид из аминокислот и все идет отлично, перед указанной стадией снимаю Boc с пролина (HCl в ЭА). Получаю трипептид с чистотой примерно 90% (ВЖХ). При этом очистки на предидущих стадиях - переосаждения

А вот последняя стадия (показана на схеме) какая-то засада: чистота стабильно 50-60% :( требуемого тетрапептида, остальное какие-то не индентифицированные примеси пептидной природы. И начинается долгая и мучительная чистка на колонке...

Может кто нибудь может подсказать что попробовать изменить в методике что-бы повысить выход-чистоту целевого продукта. Заранее большое спасибо за любые мысли на этот счет.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Phobos
Сообщения: 6985
Зарегистрирован: Чт авг 12, 2004 9:24 am

Re: Проблема в синтезе тетрапептида.

Сообщение Phobos » Чт фев 17, 2011 10:47 am

Ну, из общих рекомендаций можно попробовать не смешивать все сразу, а сперва чисто получить на метионине HOBT-эфир и уже потом добавить его к субстрату. По крайней мере, можно попытаться понять на какой из стадий проблема. Второе - может основность пролинового азота слишком высокая и чтоб его высвободить из соли нужно основание посильнее морфолинового, что-то типа безводного карбоната в ДМФе. Третье - вопрос: а у гуанидинового хвоста тоже имеется какая-то основность и нуклеофильность?
Wodka trinkt man pur und kalt, das macht hundert Jahre alt!

Аватара пользователя
nikkochem
Сообщения: 1401
Зарегистрирован: Чт ноя 26, 2009 12:47 pm
Контактная информация:

Re: Проблема в синтезе тетрапептида.

Сообщение nikkochem » Чт фев 17, 2011 1:28 pm

Сделайте из ацетилметионина активированый эфир с перфторфенолом. Метода простая растворяете в ТГФ (предпочтительнее из-за низкой температуры замерзания) или диоксане аминокислоту (в данном случае ацетилметионин) в количестве 1,0 ммоль + добавляете туда 1,1 ммоль перфтор фенола и это все замораживаете в морозилке (в случае ТГФ). Отдельно готовите в том же растворителе ваш карбодиимид 1,1 моль и замораживаете в морозилке (опять в случае ТГФ). Затем растворы сливаете и встряхиваете (опять в случае ТГФ) - они немного разогреваються и осадок соответсвующей мочевины выпадает прямо на глазах. В случае применения диоксана (некоторые не хотят растворяться в ТГФ) к раствору диимида при охлаждении медленно капаете раствор смеси аминокислоты и перфторфенола. Соответсвующую кислоту фильтруем. Раствор перфторфенилового эфира аминокислоты добавляем к раствору 0,9 ммоль пептида + основание DIPEA или метилморфолин.
Уважающие себя физики и математики обходят стороной антинаучных художников рисущих молекулы и называющих себя химиками.

Redmannn
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пт сен 11, 2009 8:32 pm

Re: Проблема в синтезе тетрапептида.

Сообщение Redmannn » Чт фев 17, 2011 10:10 pm

Да, в принципе нужно попробовать получить эфир ацетилметионина отдельно и добавить его к к трипептиду.
Я смотрел по константам метил морфолин должен депротонировать пролин.
На аргениновом хвосте типа протонированая защита стоит. Вроде как работает - проверено на стадии конденсации дипептида пролилил-аргенин с глицин амидом гидрохлоридом.

Спасибо попробую и с перфторфенолом посмотреть как пойдет.

Интересно почему "не очень" идет реакция по схеме...

Аватара пользователя
nikkochem
Сообщения: 1401
Зарегистрирован: Чт ноя 26, 2009 12:47 pm
Контактная информация:

Re: Проблема в синтезе тетрапептида.

Сообщение nikkochem » Пт фев 18, 2011 2:54 pm

Скажем еще раз спасибо Upstream - это он надоумил перейти меня на перфторфенол.
Уважающие себя физики и математики обходят стороной антинаучных художников рисущих молекулы и называющих себя химиками.

Redmannn
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пт сен 11, 2009 8:32 pm

Re: Проблема в синтезе тетрапептида.

Сообщение Redmannn » Сб фев 19, 2011 4:41 pm

nikkochem, перейти с 1гидрокси-бензотриазола и еже с ним? А почему пришлось переходить и как успех?
Мучал всегда вопрос у меня банка с HOBt*H2O в расчетах воду не в счет и все идет нормально и DCC с этой водой не реагирует что ли?

Аватара пользователя
nikkochem
Сообщения: 1401
Зарегистрирован: Чт ноя 26, 2009 12:47 pm
Контактная информация:

Re: Проблема в синтезе тетрапептида.

Сообщение nikkochem » Сб фев 19, 2011 6:33 pm

Redmannn писал(а):nikkochem, перейти с 1гидрокси-бензотриазола и еже с ним? А почему пришлось переходить и как успех?
Мучал всегда вопрос у меня банка с HOBt*H2O в расчетах воду не в счет и все идет нормально и DCC с этой водой не реагирует что ли?
Хобота мало, а перфторфенола много да и водой он хорошо отмывается. А реакция с DCC, насколько я понимаю, начинается с присоединения к DCC протона.
Уважающие себя физики и математики обходят стороной антинаучных художников рисущих молекулы и называющих себя химиками.

Redmannn
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пт сен 11, 2009 8:32 pm

Re: Проблема в синтезе тетрапептида.

Сообщение Redmannn » Вт фев 07, 2012 9:47 am

Всем привет.

Помимо всего остального ковырялся помаленьку и с тетрапептидом, схема синтеза сверху.

В последнем варианте делал реакцию с пентафторфенолом (в двух вариантах активированный эфир выделял и коплекс-F добавлял), исходный трипептид чистый ВЖХ-МС, все ок за исключением одной проблемы - на ВЖХ продукта реакциии (требуемый тетрапептид) в виде 2-х близкоходящих пика с равными молекулярными массами. Взял в реакцию вместо N-ацетил-D-метионина N-ацетил-L-метионина и получил те же два пика только в противоположном соотношении. Вывод - идет рацемизация, получаю два диастереомерных вещества. Раньше пробовал варианты с HOBt + DCC.

А мне нужно именно N-ацетил-D-метионил...

Прочитал что в случае N-ацетил- производных рацемизация вообще не избежна, так ли это?
Возмрожно есть какие-то еще антирацемизирующие "присадки" для случаев с N-ацетил- карбокси компонентой?
Что можно тут еще предпринять? Препаративной ВЖХ нет.

Спасибо за ваши ответы.

Serty
Сообщения: 8177
Зарегистрирован: Пт июл 06, 2007 12:17 pm

Re: Проблема в синтезе тетрапептида.

Сообщение Serty » Вт фев 07, 2012 10:48 am

Может вам стоит перейти на использование Boc-Met-OH? ВОС-и рацемизуются заметно труднее. А затем вводить ацетил чем нибудь мягеньким.
Стадий больше, согласен, но можно выиграть на очистке.

Redmannn
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пт сен 11, 2009 8:32 pm

Re: Проблема в синтезе тетрапептида.

Сообщение Redmannn » Вт фев 07, 2012 11:06 am

Была такая мысль, но как ввести Ac если Arg только протонирован...?

Serty
Сообщения: 8177
Зарегистрирован: Пт июл 06, 2007 12:17 pm

Re: Проблема в синтезе тетрапептида.

Сообщение Serty » Вт фев 07, 2012 12:15 pm

Ну например сделать пентафторфениловый эфир уксусной кислоты, или мы как-то использовали N-ацетилимидазол.

vovan70
Сообщения: 18
Зарегистрирован: Вс мар 21, 2010 7:00 pm

Re: Проблема в синтезе тетрапептида.

Сообщение vovan70 » Вт фев 07, 2012 11:18 pm

Уважаемый Redmannn! данный кусок аргинин вазопрессина с ацетилметионином я бы получал по другой схеме:
Ac-Met-OpFP+ H-Pro-OH -->Ac-Met-Pro-OH
Boc-Arg OpFP +H-Gly-NH2 -->Boc-Arg-Gly-NH2
Boc-Arg-Gly-NH2 --> H-Arg-Gly-NH2
Ac-Met-Pro-OH + H-Arg-Gly-NH2 --> товар :)
чистить было бы проще...
а вот это Вы , наверное, видели http://bd.patent.su/2394000-2394999/pat ... t56ab.html

Ответить

Вернуться в «органическая химия / organic chemistry»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 10 гостей