Тестовый инпут гауссиана для замеров скорости

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2639
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Тестовый инпут гауссиана для замеров скорости

Сообщение Droog_Andrey » Чт сен 16, 2021 5:29 pm

Shorku писал(а):
Вт сен 14, 2021 11:41 am
Может быть, кстати, запилить отдельную тему с типовым тестовым инпутом под какой-нибудь распространенный кв-хим пакет, чтобы можно было выкладывать конфиг конкретных машин и результаты?

Код: Выделить всё

#p CCSD(T)/cc-pV5Z

C4++

2  1
C  1.0  0.0  0.0
C -1.0  0.0  0.0
C  0.0  1.0  0.0
C  0.0 -1.0  0.0
2^74207281-1 is prime!

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2639
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: Тестовый инпут гауссиана для замеров скорости

Сообщение Droog_Andrey » Чт сен 16, 2021 5:53 pm

AMD Ryzen 7 2700X @ 4GHz
64 Gb DDR4 @ 3GHz

%NProcShared=8
%Mem=48Gb

6:56
2^74207281-1 is prime!

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1051
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: Тестовый инпут гауссиана для замеров скорости

Сообщение Shorku » Чт сен 16, 2021 11:05 pm

.
Мы не любим успокоительные иллюзии и сказки на ночь.Мы любим газовые атаки и механические марши железных солдат.Однажды,когда после ежедневной предательской работы на этот мир вы ляжете в свои мягкие кроватки,мы пожелаем вам страшной ночи и атомной войны.

Аватара пользователя
bigM
Сообщения: 4308
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2017 2:05 am

Re: Тестовый инпут гауссиана для замеров скорости

Сообщение bigM » Пт сен 17, 2021 11:37 pm

Droog_Andrey писал(а):
Чт сен 16, 2021 5:53 pm
AMD Ryzen 7 2700X @ 4GHz
64 Gb DDR4 @ 3GHz

%NProcShared=8
%Mem=48Gb

6:56
с почином, конечно. но были б интересны скриншоты программ типа CPU-Z и логи обращений к памяти в процессе расчётов типа MemTest, но это отдельный труд
Не красота спасёт мир, а транквилизаторы.

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2639
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: Тестовый инпут гауссиана для замеров скорости

Сообщение Droog_Andrey » Сб сен 18, 2021 1:55 pm

У меня убунту, там разве что free и lscpu, но они просто подтвердят частоту ЦП и объём памяти.

Думаю, для начала можно просто накидать временные результаты, а уже потом, если возникнет интерес к каким-либо из них на фоне общей картины, выяснить детали при необходимости.
2^74207281-1 is prime!

Аватара пользователя
6apu_aJlu6acoB
Сообщения: 44
Зарегистрирован: Ср фев 07, 2018 3:55 pm

Re: Тестовый инпут гауссиана для замеров скорости

Сообщение 6apu_aJlu6acoB » Чт дек 16, 2021 1:06 pm

AMD Ryzen Threadripper 3960X
64 Gb DDR4
Ubuntu 20.04.3; Gaussian 16, Revision C.01

%NProcShared=46
%Mem=60Gb

Elapsed time: 3:42
:focus:
Все говорят, что у меня /dev/hands кривой, и все делаю через /dev/ass, а у меня этих файлов вообще нет :dontknow:

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2639
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: Тестовый инпут гауссиана для замеров скорости

Сообщение Droog_Andrey » Ср дек 22, 2021 10:47 pm

На 46 потоков Гауссиан фигово распараллеливает. Что если написать например 16?
2^74207281-1 is prime!

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 677
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: Тестовый инпут гауссиана для замеров скорости

Сообщение Yurii » Вс янв 16, 2022 8:45 pm

Droog_Andrey писал(а):
Ср дек 22, 2021 10:47 pm
На 46 потоков Гауссиан фигово распараллеливает. Что если написать например 16?
Это из-за симметрии системы. Например, для ih хоть два ядра, хоть 20 - время счета практически не изменится, хотя, если посмотреть на загрузку ядер, все в ажуре. Симметрия - дело тонкое: в свое время я ее хорошо распараллеливал на полуэмпирике (модифицированный мною gamess). А в gaussin, судя по коду g09, очень много халтуры из-за непонимания некоторых базовых вещей, хотя даже и Грановский не мог с этим справиться. Intel в MKL и поныне так и не справился с некоторыми вещами в диагонализации, хотя позиционирует свой пакет как самый быстрый в мире.
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Аватара пользователя
Yurii
Сообщения: 677
Зарегистрирован: Сб авг 11, 2007 1:59 am

Re: Тестовый инпут гауссиана для замеров скорости

Сообщение Yurii » Пт апр 08, 2022 1:59 pm

12-ти ядерные Xeon'ы ~2.6 ггц (кластер)
лицензионный кластерный вариант с Линдой Gaussian 16, Revision C.01 AVX2
три расчета:
1. на одном ядре
2. на одном процессоре (12 ядер)
3. на двух нодах (48 ядер)
Лицензионный диск почти 6 гигов.
Посмотрите, к каким парадоксам приводит симметрия в расчетах.
https://cloud.mail.ru/public/yJpy/qbBy8kryR
прозвище "Фабержé" легендарный разведчик Дроздов получил за свое уникальное умение работать с информацией, добывать ее и превращать в драгоценность высшей пробы.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 3 гостя