Есть ли в Firefly аналог QST2?

[evl48]

Уважаемые коллеги, а нет ли в Firefly процедуры поиска переходных состояний, аналогичной QST2 в Гауссиане?

[Reizen]

Если только её в самое последнее время не создали, то - нет.

Да и зачем она нужна? Этот алгоритм далеко не так хорош, как кажется. В тех случаях, когда координата реакции соответствует какому-нибудь простому перемещению (например, линейному смещению атома или группы), сконструировать стартовую геометрию для переходного состояния можно и вручную, мысленно подвинув все нужные координаты. А в тех случаях, когда путь реакции более извилист и мысленное построение не помогает, QST2 тоже спасует почти наверняка.

[VTur]

Если нет нескольких почти равноценных горбов и реагенты и продукты отвечают этому пути реакции, QST2 и QST3 почти наверняка приведут к цели.

[evl48]

Если только её в самое последнее время не создали, то - нет.

Да и зачем она нужна? Этот алгоритм далеко не так хорош, как кажется. В тех случаях, когда координата реакции соответствует какому-нибудь простому перемещению (например, линейному смещению атома или группы), сконструировать стартовую геометрию для переходного состояния можно и вручную, мысленно подвинув все нужные координаты. А в тех случаях, когда путь реакции более извилист и мысленное построение не помогает, QST2 тоже спасует почти наверняка.

А что выбирать за координату реакции в случае циклоприсоединения, когда более или менее синхронно образуются сразу 2 связи? QST2 как раз справлялся...

[Reizen]

в случае циклоприсоединения, когда более или менее синхронно образуются сразу 2 связи

Наверное, там один фрагмент поступательно двигался к другому? так это как раз и есть простой случай. Координата реакции - сближение центров фрагментов (или каких-нибудь точек, условно взятых за центры).