Преобразование координат.

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
etzell
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пн май 10, 2010 12:55 pm

Преобразование координат.

Сообщение etzell » Пн сен 27, 2010 1:57 pm

Доброе время! Хотелось узнать ответ на следующий вопрос. У меня молекула состоит из двух частей. Первая часть находится в стабильном положении, а вторая вращается вокруг оси. У меня возникает задача, после вращения второй части на определенный угол, мне приходится в ручную пересчитывать координаты атомов, которые входят во вторую часть.. Есть ли программы, которые бы производили бы этот расчет?

Аватара пользователя
Lantano
Сообщения: 189
Зарегистрирован: Чт окт 09, 2008 10:35 pm

Re: Преобразование координат.

Сообщение Lantano » Пн сен 27, 2010 2:57 pm

Один раз запишите координаты в виде Z-матрицы, где нужный Вам угол задан явно. А дальше в том же FireFly считаете c $CONTRL EXETYP=CHECK $END и, руками меняя угол, получаете новые, например, декартовы координаты.
"Если миру не нужен свет - Не беда, проживёт и так.
Если стал не нужен поэт - Не беда, он наймётся в кабак..."

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2050
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: Преобразование координат.

Сообщение amge » Пн сен 27, 2010 3:16 pm

Вроде бы, ChemCraft может это сделать наглядно, через графический интерфейс.

etzell
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пн май 10, 2010 12:55 pm

Re: Преобразование координат.

Сообщение etzell » Пн сен 27, 2010 6:41 pm

Хотелось бы про Chemcraft более подробнее получить ответ. С зет-матрицей тоже надо глянуть.

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Преобразование координат.

Сообщение EvgeniX » Пн сен 27, 2010 11:22 pm

etzell писал(а):Хотелось бы про Chemcraft более подробнее получить ответ. С зет-матрицей тоже надо глянуть.
Выбираете 2 атома, лежащих на оси, вокруг которой вращать, а далее Edit->Rotate along selected.
http://www.chemcraftprog.com/download.html

etzell
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пн май 10, 2010 12:55 pm

Re: Преобразование координат.

Сообщение etzell » Вт сен 28, 2010 8:21 am

Координаты меняются при этом? Я видел, что там просто можно вращать молекулу как цело относительно атома, но не вращать отдельную часть молекулы относительно другой, ИЗМЕНЯЯ КООРДИНАТЫ ПРИ ЭТОМ..

Аватара пользователя
EvgeniX
Сообщения: 2780
Зарегистрирован: Пт апр 27, 2007 5:32 am

Re: Преобразование координат.

Сообщение EvgeniX » Вт сен 28, 2010 9:44 am

etzell писал(а):Координаты меняются при этом? Я видел, что там просто можно вращать молекулу как цело относительно атома, но не вращать отдельную часть молекулы относительно другой, ИЗМЕНЯЯ КООРДИНАТЫ ПРИ ЭТОМ..
Декартовы координаты меняются в соответствии с тем, что отображается на экране (только в окне надо нажать Apply).

etzell
Сообщения: 139
Зарегистрирован: Пн май 10, 2010 12:55 pm

Re: Преобразование координат.

Сообщение etzell » Вт сен 28, 2010 11:12 am

Cпасибо, нашел!) Chemcraft - очень удобная программа)

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 6 гостей