кластеры

455 · Сообщение **455** » Ср янв 16, 2008 11:24 pm

Здравствуйте!
Подскажите, пожалуйста - если разделить молекулу (например:коллаген I-ого типа) на разные части (кластеры) и посчитать для каждой из них восприимчивость, то как можно общую восприимчивость для всей молекулы
найти? Где можно прочитать о кластерах? И можно найти ее , как сумму
восприимчивости каждой из частей?
Заранее спасибо!!!

arkansas · Сообщение **arkansas** » Чт янв 17, 2008 7:15 pm

О какой восприимчивости идет речь?

455 · Сообщение **455** » Сб янв 19, 2008 10:44 pm

Речь идет о диэлектрической нелинейной восприимчивости.

arkansas · Сообщение **arkansas** » Вс янв 20, 2008 3:40 pm

Поскольку поляризация аддитивна, диэл. восприимчивость тоже д.б. аддитивна (для несимметричной молекулы она еще и тензорная). А вот чем посчитать поляризацию белковых кластеров, я не знаю

arkansas · Сообщение **arkansas** » Вс янв 20, 2008 5:31 pm

arkansas писал(а):Поскольку поляризация аддитивна, диэл. восприимчивость тоже д.б. аддитивна (для несимметричной молекулы она еще и тензорная). А вот чем посчитать поляризацию белковых кластеров, я не знаю

455 · Сообщение **455** » Вс янв 20, 2008 7:25 pm

А сложить нелинейные восприимчивости просто нельзя?

arkansas · Сообщение **arkansas** » Вс янв 20, 2008 8:46 pm

Если они посчитаны для одного и того же направления поляризации в молекуле, то можно, я думаю.

455 · Сообщение **455** » Вс янв 20, 2008 8:50 pm

Они были просчитаны в Gaussian03W с одинаковыми условиями...

arkansas · Сообщение **arkansas** » Вс янв 20, 2008 9:19 pm

А скажите, зачем Вам этот расчет? К реальной, макроскопической восприимчивости коллагена он ведь может иметь довольно слабое отношение

455 · Сообщение **455** » Вс янв 20, 2008 9:36 pm

Ну, моя курсовая работа - "Численный расчет нелинейной восприимчивости коллагена I- ого типа"

455 · Сообщение **455** » Вс янв 20, 2008 10:47 pm

А в чем вы посоветуете посчитать?
Заранее спасибо!

arkansas · Сообщение **arkansas** » Вс янв 20, 2008 11:38 pm

В расчетных методах я не шарю, сорри.
Понимаете, диэлектрическая восприимчивость и проницаемость, вообще-то, определены для макросистем, для молекул они не имеют смысла, но в случае макромолекул, наверное, какая-то натяжка допустима. Вам нужна диэл. восприимчивость в статическом поле (правильно я понимаю?). Прежде всего, нужно определиться, какова структура образца. Если жесткая нить и поле в ее направлении, это одно, тогда, наверное, можно использовать расчетное значение для молекулы. Если нет, тогда расчет значительно усложняется.
Советую для начала почитать эту книжку.

VTur · Сообщение **VTur** » Пн янв 21, 2008 5:37 pm

Примените аддитивно-групповой подход. Посчитайте малые молекулы, где есть эти группы. Найдите для всех групп восприимчивости (разнесите восприимчивость молекулы по группам). Сложите из Ваших групп нужную молекулу и найдите её восприимчивость, как самму по группам. Для магнитной восприимчивости этот метод проходит.

455 · Сообщение **455** » Пн янв 21, 2008 9:34 pm

Спасибо за совет!А можете дать ссылочку на статью или книжечку - где я могу об этом прочитать?

VTur · Сообщение **VTur** » Пн янв 21, 2008 10:00 pm

455 писал(а):Спасибо за совет!А можете дать ссылочку на статью или книжечку - где я могу об этом прочитать?

В прямую, для этих свойств, я ссылок не знаю. Просто занимаюсь, в том числе, аддитивно-групповым методом.

Но посмотрите статьи Бейдера и ссылки в них.
MOLECULAR PHYSICS, 2002, VOL. 100, NO. 21, 3333-3344
MOLECULAR PHYSICS, 1992, VOL. 75, NO. 5, 1167
J. Phys. Chem. A 2000, 104, 5579-5589 (здесь ссылки)

Форум химиков