S[sub]N[/sub]2

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
RAS
Сообщения: 151
Зарегистрирован: Ср янв 13, 2010 12:47 pm

S[sub]N[/sub]2

Сообщение RAS » Ср дек 30, 2015 11:25 am

Коллеги, всех с наступающим! :beer:

Есть вопрос небольшой. Появилось желание промоделировать реакцию с SN2 механизмом, ну, допустим, СН3Cl + OH-. Так вот, не соображу как быть с крайними структурами. Когда какая-нибудь таутомерия или смена конформации, там ясно - крайние структуры это локальные минимумы на поверхности. А здесь как их задать, чтобы путь реакции просчитать?
Before we are quantum chemists we are scientists, happy eye-witnesses of miracles going on around us.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: S[sub]N[/sub]2

Сообщение Гесс » Ср дек 30, 2015 11:59 am

Найдите TS и сделайте IRC в разные стороны. Когда нуклеофил/фуг будут достаточно далеко от реакционного центра - кривая энергии выродится в сумму изолированных частиц и ее можно обрубать. В противном случае, если вы будете делать оптимизацию, анион начнет описывать довольно бессмысленную дугу вокруг молекулы, без реального понижения энергии, пока не придет в какой то артефактный минимум.

Аватара пользователя
RAS
Сообщения: 151
Зарегистрирован: Ср янв 13, 2010 12:47 pm

Re: S[sub]N[/sub]2

Сообщение RAS » Ср дек 30, 2015 12:26 pm

Спасибо!
Before we are quantum chemists we are scientists, happy eye-witnesses of miracles going on around us.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 55 гостей