Есть вопрос небольшой. Появилось желание промоделировать реакцию с SN2 механизмом, ну, допустим, СН3Cl + OH-. Так вот, не соображу как быть с крайними структурами. Когда какая-нибудь таутомерия или смена конформации, там ясно - крайние структуры это локальные минимумы на поверхности. А здесь как их задать, чтобы путь реакции просчитать?
S[sub]N[/sub]2
S[sub]N[/sub]2
Коллеги, всех с наступающим!
Есть вопрос небольшой. Появилось желание промоделировать реакцию с SN2 механизмом, ну, допустим, СН3Cl + OH-. Так вот, не соображу как быть с крайними структурами. Когда какая-нибудь таутомерия или смена конформации, там ясно - крайние структуры это локальные минимумы на поверхности. А здесь как их задать, чтобы путь реакции просчитать?
Есть вопрос небольшой. Появилось желание промоделировать реакцию с SN2 механизмом, ну, допустим, СН3Cl + OH-. Так вот, не соображу как быть с крайними структурами. Когда какая-нибудь таутомерия или смена конформации, там ясно - крайние структуры это локальные минимумы на поверхности. А здесь как их задать, чтобы путь реакции просчитать?
Before we are quantum chemists we are scientists, happy eye-witnesses of miracles going on around us.
Re: S[sub]N[/sub]2
Найдите TS и сделайте IRC в разные стороны. Когда нуклеофил/фуг будут достаточно далеко от реакционного центра - кривая энергии выродится в сумму изолированных частиц и ее можно обрубать. В противном случае, если вы будете делать оптимизацию, анион начнет описывать довольно бессмысленную дугу вокруг молекулы, без реального понижения энергии, пока не придет в какой то артефактный минимум.
Re: S[sub]N[/sub]2
Спасибо!
Before we are quantum chemists we are scientists, happy eye-witnesses of miracles going on around us.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 55 гостей