Ввод группы симметрии в Firefly

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
Nickalaich
Сообщения: 48
Зарегистрирован: Сб фев 25, 2017 2:23 pm

Ввод группы симметрии в Firefly

Сообщение Nickalaich » Пт апр 07, 2017 7:58 pm

В учебных целях нужно рассчитать геометрию и энергетические уровни нитрат-радикала. Начинаю с RHF расчета катиона, по литературе группа симметрии D3h. Расчет получился, но молекула получилась NO2, а я не этого хотел. Может кто подсказать, где я накосячил?
Вход:
$DATA
Title
DNH 3

N 7.0 0.0 0.0 0.0
O 8.0 0.0 0.0 1.00000

Выход:
TOTAL NUMBER OF SHELLS = 42
TOTAL NUMBER OF BASIS FUNCTIONS = 165
NUMBER OF ELECTRONS = 22
CHARGE OF MOLECULE = 1
STATE MULTIPLICITY = 1
NUMBER OF OCCUPIED ORBITALS (ALPHA) = 11
NUMBER OF OCCUPIED ORBITALS (BETA ) = 11
TOTAL NUMBER OF ATOMS = 3
THE NUCLEAR REPULSION ENERGY IS 76.2015183365

THIS MOLECULE IS RECOGNIZED AS BEING LINEAR.

Аватара пользователя
madschumacher
Сообщения: 892
Зарегистрирован: Ср авг 05, 2015 4:30 pm

Re: Ввод группы симметрии в Firefly

Сообщение madschumacher » Сб апр 08, 2017 12:57 am

Попробуйте 1.0 для координаты кислорода написать на позиции x или y. :wink: Видимо, вдоль оси z действует плоскость σh, т.е. C3 совпадает с z. (извините, что не точно говорю, но можете глянуть в мануале как заведомо правильно надо :very_shuffle: ).
И да узрел Охламон, что сие есть круть несусветная!

Аватара пользователя
Vit Nhoc
Сообщения: 1400
Зарегистрирован: Сб июн 06, 2015 12:28 pm

Re: Ввод группы симметрии в Firefly

Сообщение Vit Nhoc » Сб апр 08, 2017 4:31 am

Нитрат-радикал - это NO3?
Можете построить молекулу в Chemcraft, придать ей симметрию D3h через меню Edit/Set point group, далее перейти во вкладку Coords и выбрать Coords format/Gamess-US input (unique atoms). Я попробовал это сделать, действительно программа разместила кислород не на оси Z:

$DATA
NO3
Dnh 3

NITROGEN 7.0 0.000000000 0.000000000 0.000000000
OXYGEN 8.0 0.698895631 1.210522742 0.000000000
$END
"Ты должен сделать добро из зла, потому что больше его сделать не из чего". АБ Стругацкие.

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2050
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: Ввод группы симметрии в Firefly

Сообщение amge » Вс апр 09, 2017 7:02 am

D3h - неабелева группа, и, насколько я понимаю, молекулу с такой симметрией невозможно точно задать в декатровых координатах. Попробуйте z-матрицей. А еще лучше, по моему, взять ближайшую абелеву группу C2v и не париться. Тем более что у Гамеес куча ограничений для неабелевых групп - чуть что, и он начинает считать в С1.

Аватара пользователя
Droog_Andrey
Сообщения: 2700
Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
Контактная информация:

Re: Ввод группы симметрии в Firefly

Сообщение Droog_Andrey » Пн апр 10, 2017 6:43 am

amge писал(а):
Вс апр 09, 2017 7:02 am
D3h - неабелева группа, и, насколько я понимаю, молекулу с такой симметрией невозможно точно задать в декатровых координатах.
Да ну.

Код: Выделить всё

N  0.0  0.0  0.0
O  1.0 -0.5 -0.5
O -0.5  1.0 -0.5
O -0.5 -0.5  1.0
2^74207281-1 is prime!

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2050
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: Ввод группы симметрии в Firefly

Сообщение amge » Пн апр 10, 2017 9:45 am

Действительно. Спасибо за науку.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 9 гостей