В учебных целях нужно рассчитать геометрию и энергетические уровни нитрат-радикала. Начинаю с RHF расчета катиона, по литературе группа симметрии D3h. Расчет получился, но молекула получилась NO2, а я не этого хотел. Может кто подсказать, где я накосячил?
Вход:
$DATA
Title
DNH 3
N 7.0 0.0 0.0 0.0
O 8.0 0.0 0.0 1.00000
Выход:
TOTAL NUMBER OF SHELLS = 42
TOTAL NUMBER OF BASIS FUNCTIONS = 165
NUMBER OF ELECTRONS = 22
CHARGE OF MOLECULE = 1
STATE MULTIPLICITY = 1
NUMBER OF OCCUPIED ORBITALS (ALPHA) = 11
NUMBER OF OCCUPIED ORBITALS (BETA ) = 11
TOTAL NUMBER OF ATOMS = 3
THE NUCLEAR REPULSION ENERGY IS 76.2015183365
THIS MOLECULE IS RECOGNIZED AS BEING LINEAR.
Ввод группы симметрии в Firefly
- Nickalaich
- Сообщения: 48
- Зарегистрирован: Сб фев 25, 2017 2:23 pm
- madschumacher
- Сообщения: 892
- Зарегистрирован: Ср авг 05, 2015 4:30 pm
Re: Ввод группы симметрии в Firefly
Попробуйте 1.0 для координаты кислорода написать на позиции x или y.
Видимо, вдоль оси z действует плоскость σh, т.е. C3 совпадает с z. (извините, что не точно говорю, но можете глянуть в мануале как заведомо правильно надо
).
И да узрел Охламон, что сие есть круть несусветная!
Re: Ввод группы симметрии в Firefly
Нитрат-радикал - это NO3?
Можете построить молекулу в Chemcraft, придать ей симметрию D3h через меню Edit/Set point group, далее перейти во вкладку Coords и выбрать Coords format/Gamess-US input (unique atoms). Я попробовал это сделать, действительно программа разместила кислород не на оси Z:
$DATA
NO3
Dnh 3
NITROGEN 7.0 0.000000000 0.000000000 0.000000000
OXYGEN 8.0 0.698895631 1.210522742 0.000000000
$END
Можете построить молекулу в Chemcraft, придать ей симметрию D3h через меню Edit/Set point group, далее перейти во вкладку Coords и выбрать Coords format/Gamess-US input (unique atoms). Я попробовал это сделать, действительно программа разместила кислород не на оси Z:
$DATA
NO3
Dnh 3
NITROGEN 7.0 0.000000000 0.000000000 0.000000000
OXYGEN 8.0 0.698895631 1.210522742 0.000000000
$END
"Ты должен сделать добро из зла, потому что больше его сделать не из чего". АБ Стругацкие.
Re: Ввод группы симметрии в Firefly
D3h - неабелева группа, и, насколько я понимаю, молекулу с такой симметрией невозможно точно задать в декатровых координатах. Попробуйте z-матрицей. А еще лучше, по моему, взять ближайшую абелеву группу C2v и не париться. Тем более что у Гамеес куча ограничений для неабелевых групп - чуть что, и он начинает считать в С1.
- Droog_Andrey
- Сообщения: 2700
- Зарегистрирован: Сб сен 29, 2007 8:29 pm
- Контактная информация:
Re: Ввод группы симметрии в Firefly
Да ну.
Код: Выделить всё
N 0.0 0.0 0.0
O 1.0 -0.5 -0.5
O -0.5 1.0 -0.5
O -0.5 -0.5 1.02^74207281-1 is prime!
Re: Ввод группы симметрии в Firefly
Действительно. Спасибо за науку.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 9 гостей