Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)
Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)
Уважаемы вычислители.
Мы закончили первый год курса "Теория молекулярно-динамических расчетов". Хотим представить видеозаписи лекций на суд общественности.
Список всех видео с аннотациями по курсу "Теория молекулярно-динамических расчетов"
В курсе излагаются теоретические основы проведения и обработки молекулярно-динамических расчетов. Материал достаточно сложный и не рекомендуется тем, кто хочет ознакомиться с тем, что такое молекулярная динамика. Напротив, курс предполагает, что слушатель уже в некоторой степени знаком с вычислительной химией и предлагает рассмотреть данный материал всерьез. В первой части курса рассказывается о технологиях расчета потенциальной энергии, во второй части — о технологиях интегрирования уравнений движения. В заключительной части рассказывается об извлечении информации из траекторий МД. Основными опорными учебниками курса являются «Molecular simulation of Liquids» (M. Allen, D. Tidesley) и «Understanding molecular simulations» (D. Frenkel, B. Smith), хотя некоторых вещей там нет.
В лекциях существенно ненулевое количество матана, статов, теормеха и разных других аспектов физики.
Для примера вот аннотация одной из лекций:
"Лекция 5Б. Термостат. Виды термостатов. Термостат Нозе. Лагранжева механика. Расширение системы — координата «bath». Лагранжево представление расширенной системы в термостате Нозе. Выведение канонического распределение для подсистемы. Свойства дельта-функции. Настройки термостата Нозе, цепочки вложенных термостатов."
и сама лекция https://www.youtube.com/watch?v=ObnuAnY ... e=youtu.be
Естественно, в лекциях бывают ошибки, затупы и вообще не слишком удачные места. В следующем году (если нам вдруг не снимут курс) практически все лекции планируется переснять. Однако эти версии мы хотели бы вывесить уже сейчас. Наверняка, найдутся те, кому они будут интересны и понятны. Большая просьба к потенциальным зрителям - если видите ошибку или хотите оставить какой-то комментарий именно к конкретной лекции - пожалуйста делайте это прямо на YouTube, а не здесь и не в коментах сайта ERG.
Мы закончили первый год курса "Теория молекулярно-динамических расчетов". Хотим представить видеозаписи лекций на суд общественности.
Список всех видео с аннотациями по курсу "Теория молекулярно-динамических расчетов"
В курсе излагаются теоретические основы проведения и обработки молекулярно-динамических расчетов. Материал достаточно сложный и не рекомендуется тем, кто хочет ознакомиться с тем, что такое молекулярная динамика. Напротив, курс предполагает, что слушатель уже в некоторой степени знаком с вычислительной химией и предлагает рассмотреть данный материал всерьез. В первой части курса рассказывается о технологиях расчета потенциальной энергии, во второй части — о технологиях интегрирования уравнений движения. В заключительной части рассказывается об извлечении информации из траекторий МД. Основными опорными учебниками курса являются «Molecular simulation of Liquids» (M. Allen, D. Tidesley) и «Understanding molecular simulations» (D. Frenkel, B. Smith), хотя некоторых вещей там нет.
В лекциях существенно ненулевое количество матана, статов, теормеха и разных других аспектов физики.
Для примера вот аннотация одной из лекций:
"Лекция 5Б. Термостат. Виды термостатов. Термостат Нозе. Лагранжева механика. Расширение системы — координата «bath». Лагранжево представление расширенной системы в термостате Нозе. Выведение канонического распределение для подсистемы. Свойства дельта-функции. Настройки термостата Нозе, цепочки вложенных термостатов."
и сама лекция https://www.youtube.com/watch?v=ObnuAnY ... e=youtu.be
Естественно, в лекциях бывают ошибки, затупы и вообще не слишком удачные места. В следующем году (если нам вдруг не снимут курс) практически все лекции планируется переснять. Однако эти версии мы хотели бы вывесить уже сейчас. Наверняка, найдутся те, кому они будут интересны и понятны. Большая просьба к потенциальным зрителям - если видите ошибку или хотите оставить какой-то комментарий именно к конкретной лекции - пожалуйста делайте это прямо на YouTube, а не здесь и не в коментах сайта ERG.
- uchebnik fiziki
- Сообщения: 4265
- Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm
Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)
Хорошее дело! Но выглядит ужасно, ничего не слышно.
Рекомендации:
1. Поставьте нормальный свет, но лучше дополнять презенташками и видео, если возможно.
2. Купите микрофон и пишите звук с него, а не с камеры.
3. Вырежьте паузы.
4. Сделайте нормальный текст в качестве основы.
Рекомендации:
1. Поставьте нормальный свет, но лучше дополнять презенташками и видео, если возможно.
2. Купите микрофон и пишите звук с него, а не с камеры.
3. Вырежьте паузы.
4. Сделайте нормальный текст в качестве основы.
Свобода, равенство, братство.
Или смерть.
Или смерть.
Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)
Спасибо. Это примерно понятно.
На первом году курса особенно заморачиваться с постановкой съемок мы не стали, потому что содержание пока не вызывает нашего удовлетворения. Сейчас мы подождем отзывов и комментариев по сути, примем экзамен, скорректируем программу. А снимать красиво будем, наверное, год на третий.
На первом году курса особенно заморачиваться с постановкой съемок мы не стали, потому что содержание пока не вызывает нашего удовлетворения. Сейчас мы подождем отзывов и комментариев по сути, примем экзамен, скорректируем программу. А снимать красиво будем, наверное, год на третий.
- uchebnik fiziki
- Сообщения: 4265
- Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm
Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)
А вы это делаете как онлайн-курс в рамках каких-то там универовских программ?
Свобода, равенство, братство.
Или смерть.
Или смерть.
Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)
Это не онлайн-курс. Это обычный спецкурс, просто мы снимаем его теоретическую часть - там вопросы студентов возникают прямо на видео. Одна пара в неделю лекций + одна пара практикума, который снимать бессмысленно 
Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)
Отличная задумка.
Скажите, а вы это на голом энтузиазме делаете или у вас есть грант на выпуск курса. Просто это большая работа, участие в которой должны принимать не только хорошие лекторы но и проф. звуко- и видео операторы/монтажеры. Возможно есть варианты добыть деньги у универа? Обычно администрация не скупиться давать деньги на подобного рода проэкты. Популяризация как никак, ну и всякие там рейтинги опять таки явно или не явно учитывают подобные проекты
Скажите, а вы это на голом энтузиазме делаете или у вас есть грант на выпуск курса. Просто это большая работа, участие в которой должны принимать не только хорошие лекторы но и проф. звуко- и видео операторы/монтажеры. Возможно есть варианты добыть деньги у универа? Обычно администрация не скупиться давать деньги на подобного рода проэкты. Популяризация как никак, ну и всякие там рейтинги опять таки явно или не явно учитывают подобные проекты
"Bite my shiny metal ass"
Bender
Bender
Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)
мы просто снимаем тот курс, который ведем. Никакой специальной видеоработой мы не занимались. Основной потоковый курс нашего профессора по матбиологии (Г.Ризниченко) тоже весь записан и безо всякого монтажа. И никто никаких денег ей не предлагал, хотя ее курс не в пример более серьезный и масштабный. Думаю, в следующий раз мы возьмем манжетку с микрофоном и будем писать звук с нее. И писать постараемся крупнее и тупить меньше. На какие-то бОльшие телодвижения у нас просто физически не будет времени.
Вопрос про гранты вообще хорош. Я сейчас с ходу нашел только гранты Потанина для преподавателей магистратуры. В следующем году можно будет попробовать сунуть.. Ничего больше не нашел. Если вы что-то знаете - думаю, все вам будут благодарны за ссылки (не только мы).
Вопрос про гранты вообще хорош. Я сейчас с ходу нашел только гранты Потанина для преподавателей магистратуры. В следующем году можно будет попробовать сунуть.. Ничего больше не нашел. Если вы что-то знаете - думаю, все вам будут благодарны за ссылки (не только мы).
- uchebnik fiziki
- Сообщения: 4265
- Зарегистрирован: Пн авг 20, 2012 9:04 pm
Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)
https://distant.msu.ru/
бабло из программы развития, как я понимаю
бабло из программы развития, как я понимаю
Свобода, равенство, братство.
Или смерть.
Или смерть.
Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)
Я, к сожалению, совсем не осведомлен о такого рода грантах. Но если бы мне нужно было найти деньги на нечто подобное я бы пошел по цепочке институтских инстанций. У универов/институтов обычно есть соответствующие статьи расходов на подобную деятельность - а у МГУ деньги на пропаганду быть должны, я думаю. Насколько реально получить эти деньги "с разгона" это другой вопрос и тут бы спросить у кого-нибудь кто уже ходил по этой тропке. Может ваш шеф легче найдет путь к "источнику"comcon1 писал(а): Вопрос про гранты вообще хорош. Я сейчас с ходу нашел только гранты Потанина для преподавателей магистратуры. В следующем году можно будет попробовать сунуть.. Ничего больше не нашел. Если вы что-то знаете - думаю, все вам будут благодарны за ссылки (не только мы).
Несколько лет назад на хабре была статья про то как писать видео лекции + комментарии к ней - может вам будет полезно?!
Habra
"Bite my shiny metal ass"
Bender
Bender
Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)
Спасибо! Судя по оглавлению, вторая половина курса должна быть очень полезной.
Кстати, а почему во водной лекции стретч и бендинг энергии нарисованы как 1/х^2, а не x^2, я чего-то не так понимаю, или это просто опечатки?
Кстати, а почему во водной лекции стретч и бендинг энергии нарисованы как 1/х^2, а не x^2, я чего-то не так понимаю, или это просто опечатки?
Make quantum chemistry, not war
Re: Курс лекций "Теория молекулярно-динамических расчетов" (ВИДЕО)
Это, очевидно очепятка. Нарисована как раз парабола, а подписано с ошибкой. Спасибо - я поставил на видео комент, что на такой-то секунде на доске ошибка. Я говорю - если что-то смотрите и видите ошибку - не стесняйтесь, пожалуйста, об этом писать прямо туда. многое очевидное пропускается, некоторые места могут иметь концептуальные ошибки.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 48 гостей