Докинг с использованием CUDA

[Ivan110]

Вопрос к специалистам по докингу. Есть ли программы с поддержкой параллельных вычислений с использованием CUDA?

[Гесс]

Ну я не специалист, но вроде Autodock, Molegro, Frodrug.
Я не работаю ни с чем.

[Ivan110]

В них вроде возможности CUDA не задействованы...

[eFo]

Quick search: http://hex.loria.fr

[ihammers]

Вопрос к специалистам по докингу. Есть ли программы с поддержкой параллельных вычислений с использованием CUDA?

Вам точно нужно использовать CUDA или вы хотите задействовать в расчётах GPGPU, чтобы сократить время расчёта? Если сократить время расчёта, то смотрите на поддержку в программах OpenCL.
Вдруг вас заинтересует следующая ссылка: BUDE: A General Purpose Molecular Docking Program Using OpenCL.

PS: я не специалист по докингу.

[uchebnik fiziki]

ну вот есть какая-то программа загадочная: http://lasigma.loni.org/package/dock/

но вообще это не нужно.