Преобразовать формат .cif в .xyz

[ChemNata20]

Здравствуйте. Подскажите, пожалуйста, с поомщью какой программы преобразовать, координаты в .cif формате (файлы Кембриджской базы данных) в формат .xyz

[Shorku]

Mercury, в известной степени кемкрафт

[ Post made via Android ]

[Гесс]

Avogadro.
ЕМНИП есть один нюанс - некоторые проги сохраняют атомы внутри элементарной ячейки, и если ячейка "косая", то потом можно долго мучаться.
Авогадро транслирует атомы в "прямоугольный папллелепипед" который и сохраняет, и дает вектора ячейки в отдельном окне в формате

Код: Выделить всё

А 0 0
Б В 0
Г Д Е

а не через углы и пр.

[ihammers]

Если кому-нибудь ещё интересно, то данную задачу можно решить через OpenBabel:

Код: Выделить всё

~$ obabel -icif AMS_DATA.cif -oxyz -OAMS_DATA.xyz --fillUC strict # создаст ячейку

Так же можно воспользоваться VESTA.
Доп. информацию по работе с программой можно почерпнуть из следующих видео: "Crystal Structure of NaCl" и "Crystal Structure of Diamond".