УФ-спектры, Gamess, Firefly и Hyperchem..........

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
kali666
Сообщения: 1229
Зарегистрирован: Вт ноя 30, 2004 9:01 am

УФ-спектры, Gamess, Firefly и Hyperchem..........

Сообщение kali666 » Вс май 11, 2014 5:46 pm

Привет всем.
В общем, видимо не отверчусь я от квантов.
Итак, в зоне доступа у меня HyperChem кажись 8й(лицуха на факультете есть); скачан 2013-gamess и я зависла над firefly 8.0.1, к которой не подходит мой пароль от 7ки.
ОС стоит у меня Win7Pro*64bit(Core i7-870, 3.2 ГГц, 16 Гб оперативки)
Старый Firefly работать отказался. Щазз буду письмо Грановскому писать для получения нового пароля.
2013-gamess устанавливается из exeшника, при этом какая-то дичь - запускаю bat-файл, а он сообщает, что отсутствует parameters.gms
Файл parameters.gms на самом деле есть и в нем все правильно прописано((((

Теперь вопросы:
- где быстрее считать УФ-спектры?
-правильно я понимаю, что в человеческом виде они легко получаются из расчетов например chemissian?
-пока я жду пароль firefly, может меня кто-то тыкнет в ошибки установки gamess?хелпов я нормальных не нашла на версию, которая все сама ставит
- по HyperChem. Какой алгоритм расчета? Я сто лет в кванты не залезала(страшно сказать-мне их еще и не преподавали!)....хотелось бы выяснить - могёт нынче какая-нибудь программа с приемлемой точностью считать спектры фотоинициаторов....
Не спасешься от доли кровавой,
Что земным предназначила твердь.
Но молчи: несравненное право -
Самому выбирать свою смерть.
Н. Гумилев

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: УФ-спектры, Gamess, Firefly и Hyperchem..........

Сообщение Shorku » Вс май 11, 2014 6:45 pm

Папка, в которую гамесс установлен латиницей или кирилицей обозвана?

[ Post made via Android ] Изображение
Make quantum chemistry, not war

kali666
Сообщения: 1229
Зарегистрирован: Вт ноя 30, 2004 9:01 am

Re: УФ-спектры, Gamess, Firefly и Hyperchem..........

Сообщение kali666 » Вс май 11, 2014 6:47 pm

c:\gamess.64
он сам создает папку, да и я в курсе про кириллицу в путях.
может он вообще не живет на русской винде из=за какой-нить кодовой страницы??(что вообще странно)
Не спасешься от доли кровавой,
Что земным предназначила твердь.
Но молчи: несравненное право -
Самому выбирать свою смерть.
Н. Гумилев

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: УФ-спектры, Gamess, Firefly и Hyperchem..........

Сообщение Гесс » Вс май 11, 2014 6:49 pm

kali666 писал(а): - где быстрее считать УФ-спектры?
TDDFT, как оно реализовано в вышеназванных программах - незнаю.

Аватара пользователя
Shorku
Сообщения: 1075
Зарегистрирован: Вт дек 13, 2011 2:17 pm

Re: УФ-спектры, Gamess, Firefly и Hyperchem..........

Сообщение Shorku » Вс май 11, 2014 6:53 pm

kali666 писал(а):c:\gamess.64
он сам создает папку, да и я в курсе про кириллицу в путях.
может он вообще не живет на русской винде из=за какой-нить кодовой страницы??(что вообще странно)
Под русифицированной семеркой работает.

[ Post made via Android ] Изображение
Make quantum chemistry, not war

M.Sh.
Сообщения: 23
Зарегистрирован: Чт янв 30, 2014 10:48 pm

Re: УФ-спектры, Gamess, Firefly и Hyperchem..........

Сообщение M.Sh. » Вс май 11, 2014 8:25 pm

1) Проверьте имя компьютера (д.б. латинкой).
2) GAMESS рассчитывает TDDFT довольно быстро. В manual'е и в примерах очень доступно. Однако, если в молекуле есть внутримолекулярный перенос заряда, расчёт TDDFT может оказаться неверным.
3) Так что лучше попробуйте CC или CI - дольше, но надёжнее.

kali666
Сообщения: 1229
Зарегистрирован: Вт ноя 30, 2004 9:01 am

Re: УФ-спектры, Gamess, Firefly и Hyperchem..........

Сообщение kali666 » Вс май 11, 2014 8:40 pm

Имя компа-верно.
Мануал читаю...
Относительно правильности расчета - я сначала попробую то, на что у меня есть экспериментальные данные. Если сходимости не будет - забуду про кванты еще на 10 лет....
Не спасешься от доли кровавой,
Что земным предназначила твердь.
Но молчи: несравненное право -
Самому выбирать свою смерть.
Н. Гумилев

Ferom
Сообщения: 1049
Зарегистрирован: Чт дек 16, 2010 11:43 am

Re: УФ-спектры, Gamess, Firefly и Hyperchem..........

Сообщение Ferom » Чт май 15, 2014 10:09 pm

В HyperChem быстрее всего оптимизировать в полуэмпирике, например ZINDO/1, а затем рассчитывать свойства возбужденного состояния, выбрав в Setup->Semi empirical -> ZINDO/S, а в Options -> Configuration Interaction -> Singly Excited. После этого выбираем Compute->Single Point, и тогда появиться возможность выбрать Compute->Electronic Spectrum. Нажимаем и сравниваем с экспериментом. Для органической молекулы в 60 атомов на компьютере 5-летней давности процедура занимает около 30 минут.

kali666
Сообщения: 1229
Зарегистрирован: Вт ноя 30, 2004 9:01 am

Re: УФ-спектры, Gamess, Firefly и Hyperchem..........

Сообщение kali666 » Чт май 15, 2014 10:37 pm

Ferom, спасибо....у нас тут комп гакнулся на STA-шнике, не до квантов опять...носимся между приборами...на выходных теперь к квантам
Не спасешься от доли кровавой,
Что земным предназначила твердь.
Но молчи: несравненное право -
Самому выбирать свою смерть.
Н. Гумилев

Аватара пользователя
surius
Сообщения: 1489
Зарегистрирован: Пт сен 21, 2007 11:20 am

Re: УФ-спектры, Gamess, Firefly и Hyperchem..........

Сообщение surius » Пт май 16, 2014 6:27 pm

kali666 писал(а): Относительно правильности расчета - я сначала попробую то, на что у меня есть экспериментальные данные. Если сходимости не будет - забуду про кванты еще на 10 лет....
Не подумайте что я вам плохого желаю, но сходимости не будет. Даже так скажу, если будет хорошее поподание расчетных в экспериментальные, то вероятно, где-то ошибка.
"Bite my shiny metal ass"
Bender

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: УФ-спектры, Gamess, Firefly и Hyperchem..........

Сообщение Гесс » Пт май 16, 2014 6:32 pm

surius писал(а):
kali666 писал(а): Относительно правильности расчета - я сначала попробую то, на что у меня есть экспериментальные данные. Если сходимости не будет - забуду про кванты еще на 10 лет....
Не подумайте что я вам плохого желаю, но сходимости не будет. Даже так скажу, если будет хорошее поподание расчетных в экспериментальные, то вероятно, где-то ошибка.
Пожалуй не так плохо, но стабильного попадания хоть с каким то разумным отклонением, даже для узкого класса веществ, сразу со старта получить почти нереально.

Аватара пользователя
surius
Сообщения: 1489
Зарегистрирован: Пт сен 21, 2007 11:20 am

Re: УФ-спектры, Gamess, Firefly и Hyperchem..........

Сообщение surius » Пт май 16, 2014 10:53 pm

kali666, если не секрет, покажите что хотите покрутить :shuffle:
"Bite my shiny metal ass"
Bender

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 11 гостей