базис для Pb

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Cveto4ek
Сообщения: 18
Зарегистрирован: Чт янв 24, 2013 1:02 pm

базис для Pb

Сообщение Cveto4ek » Ср дек 18, 2013 1:35 pm

Расчет в Gaussian03, метод B3LYP. Подскажите, какой базис лучше для свинца - SDD или CEP-121G? (органическая молекула с одним атомом Pb).

comcon1
Сообщения: 27
Зарегистрирован: Ср дек 18, 2013 12:12 pm

Re: базис для Pb

Сообщение comcon1 » Чт дек 19, 2013 11:28 am

Я не работал со свинцом, но обычно выбор базиса зависит от дальнейшей вычислительной судьбы. Нужна геометрия или парциальные заряды, или же планируется расчет возбужденных состояний, или колебательный спектр. Так что рекомендую рассказать здесь, какие виды расчетов планируются.

Cveto4ek
Сообщения: 18
Зарегистрирован: Чт янв 24, 2013 1:02 pm

Re: базис для Pb

Сообщение Cveto4ek » Чт дек 19, 2013 12:36 pm

Будет нужна геометрия, частоты (минимум это или нет), NPA, AIM, ELF, NMR.

avelon
Сообщения: 492
Зарегистрирован: Ср авг 12, 2009 5:09 pm

Re: базис для Pb

Сообщение avelon » Чт дек 19, 2013 2:24 pm

могу посоветовать базисы семейства Def2-....

Cveto4ek
Сообщения: 18
Зарегистрирован: Чт янв 24, 2013 1:02 pm

Re: базис для Pb

Сообщение Cveto4ek » Чт дек 19, 2013 2:50 pm

avelon, из этой серии для Pb подходит только QZVP, но его нет в Gaussian03 (а у меня именно эта версия, я ж указала в первом посте) - в этом-то и проблема... Поэтому нужно что-то другое, наиболее адекватное из возможного.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: базис для Pb

Сообщение Гесс » Чт дек 19, 2013 3:02 pm

базисы для свинца есть во всех наборах Def2-, начиная с SV(P).
В гауссиан догружаются через Gen

Cveto4ek
Сообщения: 18
Зарегистрирован: Чт янв 24, 2013 1:02 pm

Re: базис для Pb

Сообщение Cveto4ek » Чт дек 19, 2013 3:23 pm

Гесс , а ничего, что они работают только до Kr? Я думала, что хоть через Gen, что хоть как-то иначе - а раз ограничено, значит, ограничено.
Если можете, скажите, насколько хуже их, скажем, SDD?

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: базис для Pb

Сообщение VTur » Чт дек 19, 2013 3:33 pm

Посмотрите в литературе работает ли B3LYP для Pb. Он был разработан для первых трех строк табл. М. Для тяжелых элементов специально разрабатывались Миннесотовские функционалы Трухлара.
Если требуется потом считать AIM и ELF, то лучше использовать полноэлектронные базисы.

[ Post made via Android ] Изображение
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
Лечащий Врач
Сообщения: 382
Зарегистрирован: Вс окт 26, 2003 2:09 pm
Контактная информация:

Re: базис для Pb

Сообщение Лечащий Врач » Чт дек 19, 2013 3:43 pm

Базисы, не вшитые в Гауссиан, можно брать тут:

https://bse.pnl.gov/bse/portal

Ткните в свинец и посмотрите, какие базисы есть, инструкции для гауссиана там же сайт и выдаст. Из полноэлектронных есть семейство cc-pV?Z. Но почитайте ссылки, которые там же даются.

avelon
Сообщения: 492
Зарегистрирован: Ср авг 12, 2009 5:09 pm

Re: базис для Pb

Сообщение avelon » Чт дек 19, 2013 3:59 pm

на счет функционалов миннесотта. не знаю как для свинца, но для висмута превосходно работает M06 в совокупности с базисом Def2-.... тестировал M06, M06-L, M11, M11-L, рефернс PBE0.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: базис для Pb

Сообщение Гесс » Чт дек 19, 2013 4:03 pm

Cveto4ek писал(а):Гесс , а ничего, что они работают только до Kr? Я думала, что хоть через Gen, что хоть как-то иначе - а раз ограничено, значит, ограничено.
Если можете, скажите, насколько хуже их, скажем, SDD?
Всмысле работают только до криптона? Все эти базисы существуют от водорода до радона включительно. Если расчет с их использованием тяжелых элементов дает некорректные результаты - это другой вопрос, я такого не знаю, я тяжелыми элементами не занимаюсь.
Лечащий Врач писал(а):Базисы, не вшитые в Гауссиан, можно брать тут:
Ага. Есть еще как минимум две базы, но они менее удобные. viewtopic.php?f=71&t=100407#p741797 Я их пользовал когда bse лежал.
avelon писал(а):на счет функционалов миннесотта. не знаю как для свинца, но для висмута превосходно работает M06 в совокупности с базисом Def2-.... тестировал M06, M06-L, M11, M11-L, рефернс PBE0.
Там у них счас еще много новых, типа MN12SX, но я бы рекомендовал осторожность, они безусловно оттетстированы, но я именно MN12SX ловил глюки невоспроизводимые в других функционалах.

alxyppv
Сообщения: 560
Зарегистрирован: Сб апр 07, 2007 11:23 am

Re: базис для Pb

Сообщение alxyppv » Чт дек 19, 2013 4:48 pm

Если у Вас AIM в планах, то Вам нужен полноэлектронный базис (как Лечащий Врач уже намекнул). И SDD, и CEP - базисы с остовными потенциалами, Вам это не подходит. Т.е. это можно делать в AIMAll, но с выдачей Gaussian 09. Так что когда смотрите внешние базисы - тоже обращайте не это внимание.
А.П.

Cveto4ek
Сообщения: 18
Зарегистрирован: Чт янв 24, 2013 1:02 pm

Re: базис для Pb

Сообщение Cveto4ek » Пт дек 20, 2013 10:55 am

Всем большое спасибо за ответы! Если что-то не пойму, напишу.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 10 гостей