Создание Input-файла в программе Gaussian

вопросы строения молекул и квантовой химии
Sokolik93
Сообщения: 14
Зарегистрирован: Чт окт 17, 2013 4:58 pm

Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение Sokolik93 » Чт окт 17, 2013 5:12 pm

Приветствую всех! Я с недавнего времени начал заниматься квантово-механическими расчетами в программе Gaussian. Вроде освоил все базовые команды и проводил расчеты небольших молекул. Но столкнулся с проблемой: мой научный да задание оптимизировать молекулу Pd4CoC40N8H8O16. Долго я уже бьюсь над этой проблемой,подскажите кто знает(прикладываю рисунок молекулы и Input).
Собственно проблема в том что нет сходимости, пишет: problems with inexpensive integrals и бесконечные циклы.

%mem=200MW
%chk=Pd4CoC40N8H8O16
#T PBEPBE/CEP-121G SCF=Qc Opt

Pd4CoC40N8H8O16

0 2
6 -3.804307776 12.665315924 -6.286405262
6 -3.529831137 11.312901397 -6.021757484
7 -3.447945973 11.185381889 -4.645060464
6 -3.656943715 12.394266303 -4.002156644
6 -3.885070580 13.351099369 -5.005546388
6 -4.017921953 13.397181542 -7.484479647
6 -4.176553182 14.740671916 -4.975271168
6 -4.336925533 15.459645941 -6.160449250
6 -4.255701184 14.771615917 -7.445391796
1 -4.016843363 12.896156311 -8.447642876
1 -4.296218463 15.261236967 -4.030080047
6 -4.492835311 15.356636817 -8.814210893
6 -4.676918224 16.907864693 -5.916498887
8 -5.405475346 17.262687272 -4.966473927
8 -5.102450638 14.726687652 -9.703354749
8 -4.107432877 17.907926117 -6.654824074
8 -3.949355802 16.556737329 -9.180064310
46 -2.793040682 17.690802123 -8.085011354
6 -3.836118180 6.627350648 -7.554747918
6 -3.859030734 6.730600189 -6.153600006
7 -4.042779224 8.070769793 -5.856206304
6 -4.140527989 8.844065591 -7.001136735
6 -4.014795186 7.967713072 -8.092264540
6 -3.702709003 5.530055179 -8.446255167
6 -4.053134656 8.155774638 -9.499372742
6 -3.872737865 7.077168011 -10.366179968
6 -3.693304413 5.732553930 -9.826850142
1 -3.623476630 4.515371701 -8.068299453
1 -4.240544207 9.138014738 -9.922191915
6 -3.579210757 4.443406377 -10.599656064
6 -3.984805114 7.475495706 -11.815738640
8 -4.792307184 8.347461384 -12.198959506
8 -4.127283390 3.391197805 -10.210404085
8 -3.125311319 6.983761812 -12.758621818
8 -2.774005814 4.341160810 -11.699951834
46 -1.642147576 5.749656975 -12.446506635
27 -3.019799517 9.316295857 -3.841869057
7 -3.947201328 6.287726831 -4.810076335
7 -2.657880613 12.326702833 -3.052573527
7 -3.678739584 10.099506369 -6.661990864
6 -1.908250222 5.845515331 -1.773985471
6 -1.925727471 7.205907804 -2.125308384
7 -2.535240190 7.288719370 -3.366234480
6 -2.957297166 6.053101256 -3.877638353
6 -2.535905465 5.108078759 -2.860105731
6 -1.443009299 5.142945173 -0.630925286
6 -2.672947277 3.698229953 -2.758437435
6 -2.168916220 3.012653335 -1.652441313
6 -1.539088207 3.752518680 -0.562957033
1 -1.021491427 5.677678870 0.214706673
1 -3.186950177 3.134378358 -3.530814547
6 -1.025197525 3.200441172 0.742138580
6 -2.446368223 1.532236825 -1.714342117
8 -3.507487166 1.080133992 -2.192747369
8 -1.182494577 3.807537184 1.821830972
8 -1.498608245 0.613806866 -1.356853754
8 -0.262090898 2.066734599 0.785006092
46 0.317811024 0.997771134 -0.745790908
6 -1.888959551 11.900763255 -0.590630031
6 -2.579670013 11.743800417 -1.804171398
7 -2.757481802 10.382573713 -1.987763111
6 -2.213456946 9.646878882 -0.947956891
6 -1.656834297 10.570880093 -0.047537349
6 -1.443444941 13.037947648 0.133917356
6 -0.989002179 10.432726765 1.198136957
6 -0.512889021 11.554481750 1.878042861
6 -0.745638293 12.888595832 1.333040615
1 -1.653796881 14.040893211 -0.224639631
1 -0.853927614 9.454321213 1.648882390
6 -0.392644619 14.210664604 1.965241054
6 0.131307328 11.202164046 3.194601884
8 -0.302124828 10.278018021 3.913860294
8 -1.157168213 15.195873266 1.902701782
8 1.289841523 11.801707613 3.604365866
8 0.831875480 14.423603949 2.535036893
46 2.310848660 13.147897585 2.621755918
7 -1.858541048 8.424706041 -1.481556225

C H N O Pd Co 0
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение Гесс » Чт окт 17, 2013 5:49 pm

Дайте аутпут выдаваемый Гауссианом.

Sokolik93
Сообщения: 14
Зарегистрирован: Чт окт 17, 2013 4:58 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение Sokolik93 » Чт окт 17, 2013 6:40 pm

Вот
%mem=200MW
%chk=Pd4CoC40N8H8O16
-----------------------------
#T PBEPBE/CEP-121G SCF=Qc Opt
-----------------------------
---------------
Pd4CoC40N8H8O16
---------------
Symbolic Z-matrix:
Charge = 0 Multiplicity = 2
6 -3.80431 12.66532 -6.28641
6 -3.52983 11.3129 -6.02176
7 -3.44795 11.18538 -4.64506
6 -3.65694 12.39427 -4.00216
6 -3.88507 13.3511 -5.00555
6 -4.01792 13.39718 -7.48448
6 -4.17655 14.74067 -4.97527
6 -4.33693 15.45965 -6.16045
6 -4.2557 14.77162 -7.44539
1 -4.01684 12.89616 -8.44764
1 -4.29622 15.26124 -4.03008
6 -4.49284 15.35664 -8.81421
6 -4.67692 16.90786 -5.9165
8 -5.40548 17.26269 -4.96647
8 -5.10245 14.72669 -9.70335
8 -4.10743 17.90793 -6.65482
8 -3.94936 16.55674 -9.18006
46 -2.79304 17.6908 -8.08501
6 -3.83612 6.62735 -7.55475
6 -3.85903 6.7306 -6.1536
7 -4.04278 8.07077 -5.85621
6 -4.14053 8.84407 -7.00114
6 -4.0148 7.96771 -8.09226
6 -3.70271 5.53006 -8.44626
6 -4.05313 8.15577 -9.49937
6 -3.87274 7.07717 -10.36618
6 -3.6933 5.73255 -9.82685
1 -3.62348 4.51537 -8.0683
1 -4.24054 9.13801 -9.92219
6 -3.57921 4.44341 -10.59966
6 -3.98481 7.4755 -11.81574
8 -4.79231 8.34746 -12.19896
8 -4.12728 3.3912 -10.2104
8 -3.12531 6.98376 -12.75862
8 -2.77401 4.34116 -11.69995
46 -1.64215 5.74966 -12.44651
27 -3.0198 9.3163 -3.84187
7 -3.9472 6.28773 -4.81008
7 -2.65788 12.3267 -3.05257
7 -3.67874 10.09951 -6.66199
6 -1.90825 5.84552 -1.77399
6 -1.92573 7.20591 -2.12531
7 -2.53524 7.28872 -3.36623
6 -2.9573 6.0531 -3.87764
6 -2.53591 5.10808 -2.86011
6 -1.44301 5.14295 -0.63093
6 -2.67295 3.69823 -2.75844
6 -2.16892 3.01265 -1.65244
6 -1.53909 3.75252 -0.56296
1 -1.02149 5.67768 0.21471
1 -3.18695 3.13438 -3.53081
6 -1.0252 3.20044 0.74214
6 -2.44637 1.53224 -1.71434
8 -3.50749 1.08013 -2.19275
8 -1.18249 3.80754 1.82183
8 -1.49861 0.61381 -1.35685
8 -0.26209 2.06673 0.78501
46 0.31781 0.99777 -0.74579
6 -1.88896 11.90076 -0.59063
6 -2.57967 11.7438 -1.80417
7 -2.75748 10.38257 -1.98776
6 -2.21346 9.64688 -0.94796
6 -1.65683 10.57088 -0.04754
6 -1.44344 13.03795 0.13392
6 -0.989 10.43273 1.19814
6 -0.51289 11.55448 1.87804
6 -0.74564 12.8886 1.33304
1 -1.6538 14.04089 -0.22464
1 -0.85393 9.45432 1.64888
6 -0.39264 14.21066 1.96524
6 0.13131 11.20216 3.1946
8 -0.30212 10.27802 3.91386
8 -1.15717 15.19587 1.9027
8 1.28984 11.80171 3.60437
8 0.83188 14.4236 2.53504
46 2.31085 13.1479 2.62176
7 -1.85854 8.42471 -1.48156


GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Initialization pass.
----------------------------
! Initial Parameters !
! (Angstroms and Degrees) !
-------------------------- --------------------------
! Name Definition Value Derivative Info. !
--------------------------------------------------------------------------------
! R1 R(1,2) 1.4051 estimate D2E/DX2 !
! R2 R(1,5) 1.4551 estimate D2E/DX2 !
! R3 R(1,6) 1.4201 estimate D2E/DX2 !
! R4 R(2,3) 1.385 estimate D2E/DX2 !
! R5 R(2,40) 1.38 estimate D2E/DX2 !
! R6 R(3,4) 1.3851 estimate D2E/DX2 !
! R7 R(3,37) 2.0789 estimate D2E/DX2 !
! R8 R(4,5) 1.4051 estimate D2E/DX2 !
! R9 R(4,39) 1.38 estimate D2E/DX2 !
! R10 R(5,7) 1.4201 estimate D2E/DX2 !
! R11 R(6,9) 1.3954 estimate D2E/DX2 !
! R12 R(6,10) 1.0857 estimate D2E/DX2 !
! R13 R(7,8) 1.3955 estimate D2E/DX2 !
! R14 R(7,11) 1.0857 estimate D2E/DX2 !
! R15 R(8,9) 1.4598 estimate D2E/DX2 !
! R16 R(8,13) 1.5075 estimate D2E/DX2 !
! R17 R(9,12) 1.5074 estimate D2E/DX2 !
! R18 R(12,15) 1.2486 estimate D2E/DX2 !
! R19 R(12,17) 1.3673 estimate D2E/DX2 !
! R20 R(13,14) 1.2487 estimate D2E/DX2 !
! R21 R(13,16) 1.3673 estimate D2E/DX2 !
! R22 R(16,18) 1.9545 estimate D2E/DX2 !
! R23 R(17,18) 1.9551 estimate D2E/DX2 !
! R24 R(19,20) 1.4051 estimate D2E/DX2 !
! R25 R(19,23) 1.4551 estimate D2E/DX2 !
! R26 R(19,24) 1.4201 estimate D2E/DX2 !
! R27 R(20,21) 1.385 estimate D2E/DX2 !
! R28 R(20,38) 1.4174 estimate D2E/DX2 !
! R29 R(21,22) 1.3851 estimate D2E/DX2 !
! R30 R(22,23) 1.4051 estimate D2E/DX2 !
! R31 R(22,40) 1.38 estimate D2E/DX2 !
! R32 R(23,25) 1.4201 estimate D2E/DX2 !
! R33 R(24,27) 1.3954 estimate D2E/DX2 !
! R34 R(24,28) 1.0857 estimate D2E/DX2 !
! R35 R(25,26) 1.3955 estimate D2E/DX2 !
! R36 R(25,29) 1.0857 estimate D2E/DX2 !
! R37 R(26,27) 1.4598 estimate D2E/DX2 !
! R38 R(26,31) 1.5075 estimate D2E/DX2 !
! R39 R(27,30) 1.5074 estimate D2E/DX2 !
! R40 R(30,33) 1.2486 estimate D2E/DX2 !
! R41 R(30,35) 1.3673 estimate D2E/DX2 !
! R42 R(31,32) 1.2487 estimate D2E/DX2 !
! R43 R(31,34) 1.3673 estimate D2E/DX2 !
! R44 R(34,36) 1.9545 estimate D2E/DX2 !
! R45 R(35,36) 1.9551 estimate D2E/DX2 !
! R46 R(37,43) 2.1382 estimate D2E/DX2 !
! R47 R(37,61) 2.1549 estimate D2E/DX2 !
! R48 R(38,44) 1.38 estimate D2E/DX2 !
! R49 R(39,60) 1.38 estimate D2E/DX2 !
! R50 R(41,42) 1.4051 estimate D2E/DX2 !
! R51 R(41,45) 1.4551 estimate D2E/DX2 !
! R52 R(41,46) 1.4201 estimate D2E/DX2 !
! R53 R(42,43) 1.385 estimate D2E/DX2 !
! R54 R(42,77) 1.38 estimate D2E/DX2 !
! R55 R(43,44) 1.4023 estimate D2E/DX2 !
! R56 R(44,45) 1.4512 estimate D2E/DX2 !
! R57 R(45,47) 1.4201 estimate D2E/DX2 !
! R58 R(46,49) 1.3954 estimate D2E/DX2 !
! R59 R(46,50) 1.0857 estimate D2E/DX2 !
! R60 R(47,48) 1.3955 estimate D2E/DX2 !
! R61 R(47,51) 1.0857 estimate D2E/DX2 !
! R62 R(48,49) 1.4598 estimate D2E/DX2 !
! R63 R(48,53) 1.5075 estimate D2E/DX2 !
! R64 R(49,52) 1.5074 estimate D2E/DX2 !
! R65 R(52,55) 1.2486 estimate D2E/DX2 !
! R66 R(52,57) 1.3673 estimate D2E/DX2 !
! R67 R(53,54) 1.2487 estimate D2E/DX2 !
! R68 R(53,56) 1.3673 estimate D2E/DX2 !
! R69 R(56,58) 1.9545 estimate D2E/DX2 !
! R70 R(57,58) 1.9551 estimate D2E/DX2 !
! R71 R(59,60) 1.4051 estimate D2E/DX2 !
! R72 R(59,63) 1.4551 estimate D2E/DX2 !
! R73 R(59,64) 1.4201 estimate D2E/DX2 !
! R74 R(60,61) 1.385 estimate D2E/DX2 !
! R75 R(61,62) 1.3851 estimate D2E/DX2 !
! R76 R(62,63) 1.4051 estimate D2E/DX2 !
! R77 R(62,77) 1.38 estimate D2E/DX2 !
! R78 R(63,65) 1.4201 estimate D2E/DX2 !
! R79 R(64,67) 1.3954 estimate D2E/DX2 !
! R80 R(64,68) 1.0857 estimate D2E/DX2 !
! R81 R(65,66) 1.3955 estimate D2E/DX2 !
! R82 R(65,69) 1.0857 estimate D2E/DX2 !
! R83 R(66,67) 1.4598 estimate D2E/DX2 !
! R84 R(66,71) 1.5075 estimate D2E/DX2 !
! R85 R(67,70) 1.5074 estimate D2E/DX2 !
! R86 R(70,73) 1.2486 estimate D2E/DX2 !
! R87 R(70,75) 1.3673 estimate D2E/DX2 !
! R88 R(71,72) 1.2487 estimate D2E/DX2 !
! R89 R(71,74) 1.3673 estimate D2E/DX2 !
! R90 R(74,76) 1.9545 estimate D2E/DX2 !
! R91 R(75,76) 1.9551 estimate D2E/DX2 !
! A1 A(2,1,5) 107.377 estimate D2E/DX2 !
! A2 A(2,1,6) 133.1817 estimate D2E/DX2 !
! A3 A(5,1,6) 119.4318 estimate D2E/DX2 !
! A4 A(1,2,3) 106.701 estimate D2E/DX2 !
! A5 A(1,2,40) 137.5465 estimate D2E/DX2 !
! A6 A(3,2,40) 112.7416 estimate D2E/DX2 !
! A7 A(2,3,4) 111.8452 estimate D2E/DX2 !
! A8 A(2,3,37) 118.6191 estimate D2E/DX2 !
! A9 A(4,3,37) 129.5275 estimate D2E/DX2 !
! A10 A(3,4,5) 106.7012 estimate D2E/DX2 !
! A11 A(3,4,39) 99.6381 estimate D2E/DX2 !
! A12 A(5,4,39) 129.9597 estimate D2E/DX2 !
! A13 A(1,5,4) 107.3755 estimate D2E/DX2 !
! A14 A(1,5,7) 119.426 estimate D2E/DX2 !
! A15 A(4,5,7) 133.1889 estimate D2E/DX2 !
! A16 A(1,6,9) 120.6388 estimate D2E/DX2 !
! A17 A(1,6,10) 120.6953 estimate D2E/DX2 !
! A18 A(9,6,10) 118.6573 estimate D2E/DX2 !
! A19 A(5,7,8) 120.6385 estimate D2E/DX2 !
! A20 A(5,7,11) 120.687 estimate D2E/DX2 !
! A21 A(8,7,11) 118.666 estimate D2E/DX2 !
! A22 A(7,8,9) 119.8907 estimate D2E/DX2 !
! A23 A(7,8,13) 112.5478 estimate D2E/DX2 !
! A24 A(9,8,13) 127.4293 estimate D2E/DX2 !
! A25 A(6,9,8) 119.8922 estimate D2E/DX2 !
! A26 A(6,9,12) 112.5598 estimate D2E/DX2 !
! A27 A(8,9,12) 127.4186 estimate D2E/DX2 !
! A28 A(9,12,15) 121.8469 estimate D2E/DX2 !
! A29 A(9,12,17) 121.4064 estimate D2E/DX2 !
! A30 A(15,12,17) 116.51 estimate D2E/DX2 !
! A31 A(8,13,14) 121.8502 estimate D2E/DX2 !
! A32 A(8,13,16) 121.422 estimate D2E/DX2 !
! A33 A(14,13,16) 116.4874 estimate D2E/DX2 !
! A34 A(13,16,18) 126.4383 estimate D2E/DX2 !
! A35 A(12,17,18) 126.4668 estimate D2E/DX2 !
! A36 A(16,18,17) 94.3902 estimate D2E/DX2 !
! A37 A(20,19,23) 107.377 estimate D2E/DX2 !
! A38 A(20,19,24) 133.1817 estimate D2E/DX2 !
! A39 A(23,19,24) 119.4318 estimate D2E/DX2 !
! A40 A(19,20,21) 106.701 estimate D2E/DX2 !
! A41 A(19,20,38) 157.4072 estimate D2E/DX2 !
! A42 A(21,20,38) 95.1956 estimate D2E/DX2 !
! A43 A(20,21,22) 111.8452 estimate D2E/DX2 !
! A44 A(21,22,23) 106.7012 estimate D2E/DX2 !
! A45 A(21,22,40) 106.3289 estimate D2E/DX2 !
! A46 A(23,22,40) 136.7431 estimate D2E/DX2 !
! A47 A(19,23,22) 107.3755 estimate D2E/DX2 !
! A48 A(19,23,25) 119.426 estimate D2E/DX2 !
! A49 A(22,23,25) 133.1889 estimate D2E/DX2 !
! A50 A(19,24,27) 120.6388 estimate D2E/DX2 !
! A51 A(19,24,28) 120.6953 estimate D2E/DX2 !
! A52 A(27,24,28) 118.6573 estimate D2E/DX2 !
! A53 A(23,25,26) 120.6385 estimate D2E/DX2 !
! A54 A(23,25,29) 120.687 estimate D2E/DX2 !
! A55 A(26,25,29) 118.666 estimate D2E/DX2 !
! A56 A(25,26,27) 119.8907 estimate D2E/DX2 !
! A57 A(25,26,31) 112.5478 estimate D2E/DX2 !
! A58 A(27,26,31) 127.4293 estimate D2E/DX2 !
! A59 A(24,27,26) 119.8922 estimate D2E/DX2 !
! A60 A(24,27,30) 112.5598 estimate D2E/DX2 !
! A61 A(26,27,30) 127.4186 estimate D2E/DX2 !
! A62 A(27,30,33) 121.8469 estimate D2E/DX2 !
! A63 A(27,30,35) 121.4064 estimate D2E/DX2 !
! A64 A(33,30,35) 116.51 estimate D2E/DX2 !
! A65 A(26,31,32) 121.8502 estimate D2E/DX2 !
! A66 A(26,31,34) 121.422 estimate D2E/DX2 !
! A67 A(32,31,34) 116.4874 estimate D2E/DX2 !
! A68 A(31,34,36) 126.4383 estimate D2E/DX2 !
! A69 A(30,35,36) 126.4668 estimate D2E/DX2 !
! A70 A(34,36,35) 94.3902 estimate D2E/DX2 !
! A71 A(3,37,43) 170.1116 estimate D2E/DX2 !
! A72 A(3,37,61) 84.987 estimate D2E/DX2 !
! A73 A(43,37,61) 104.4912 estimate D2E/DX2 !
! A74 A(20,38,44) 130.4642 estimate D2E/DX2 !
! A75 A(4,39,60) 133.1724 estimate D2E/DX2 !
! A76 A(2,40,22) 161.8111 estimate D2E/DX2 !
! A77 A(42,41,45) 107.377 estimate D2E/DX2 !
! A78 A(42,41,46) 133.1817 estimate D2E/DX2 !
! A79 A(45,41,46) 119.4318 estimate D2E/DX2 !
! A80 A(41,42,43) 106.701 estimate D2E/DX2 !
! A81 A(41,42,77) 137.5465 estimate D2E/DX2 !
! A82 A(43,42,77) 112.7416 estimate D2E/DX2 !
! A83 A(37,43,42) 110.8379 estimate D2E/DX2 !
! A84 A(37,43,44) 133.3308 estimate D2E/DX2 !
! A85 A(42,43,44) 113.9864 estimate D2E/DX2 !
! A86 A(38,44,43) 108.2101 estimate D2E/DX2 !
! A87 A(38,44,45) 142.4448 estimate D2E/DX2 !
! A88 A(43,44,45) 103.3379 estimate D2E/DX2 !
! A89 A(41,45,44) 108.5773 estimate D2E/DX2 !
! A90 A(41,45,47) 119.426 estimate D2E/DX2 !
! A91 A(44,45,47) 131.9633 estimate D2E/DX2 !
! A92 A(41,46,49) 120.6388 estimate D2E/DX2 !
! A93 A(41,46,50) 120.6953 estimate D2E/DX2 !
! A94 A(49,46,50) 118.6573 estimate D2E/DX2 !
! A95 A(45,47,48) 120.6385 estimate D2E/DX2 !
! A96 A(45,47,51) 120.687 estimate D2E/DX2 !
! A97 A(48,47,51) 118.666 estimate D2E/DX2 !
! A98 A(47,48,49) 119.8907 estimate D2E/DX2 !
! A99 A(47,48,53) 112.5478 estimate D2E/DX2 !
! A100 A(49,48,53) 127.4293 estimate D2E/DX2 !
! A101 A(46,49,48) 119.8922 estimate D2E/DX2 !
! A102 A(46,49,52) 112.5598 estimate D2E/DX2 !
! A103 A(48,49,52) 127.4186 estimate D2E/DX2 !
! A104 A(49,52,55) 121.8469 estimate D2E/DX2 !
! A105 A(49,52,57) 121.4064 estimate D2E/DX2 !
! A106 A(55,52,57) 116.51 estimate D2E/DX2 !
! A107 A(48,53,54) 121.8502 estimate D2E/DX2 !
! A108 A(48,53,56) 121.422 estimate D2E/DX2 !
! A109 A(54,53,56) 116.4874 estimate D2E/DX2 !
! A110 A(53,56,58) 126.4383 estimate D2E/DX2 !
! A111 A(52,57,58) 126.4668 estimate D2E/DX2 !
! A112 A(56,58,57) 94.3902 estimate D2E/DX2 !
! A113 A(60,59,63) 107.377 estimate D2E/DX2 !
! A114 A(60,59,64) 133.1817 estimate D2E/DX2 !
! A115 A(63,59,64) 119.4318 estimate D2E/DX2 !
! A116 A(39,60,59) 139.6377 estimate D2E/DX2 !
! A117 A(39,60,61) 106.7351 estimate D2E/DX2 !
! A118 A(59,60,61) 106.701 estimate D2E/DX2 !
! A119 A(37,61,60) 128.0251 estimate D2E/DX2 !
! A120 A(37,61,62) 115.5265 estimate D2E/DX2 !
! A121 A(60,61,62) 111.8452 estimate D2E/DX2 !
! A122 A(61,62,63) 106.7012 estimate D2E/DX2 !
! A123 A(61,62,77) 106.3289 estimate D2E/DX2 !
! A124 A(63,62,77) 136.7431 estimate D2E/DX2 !
! A125 A(59,63,62) 107.3755 estimate D2E/DX2 !
! A126 A(59,63,65) 119.426 estimate D2E/DX2 !
! A127 A(62,63,65) 133.1889 estimate D2E/DX2 !
! A128 A(59,64,67) 120.6388 estimate D2E/DX2 !
! A129 A(59,64,68) 120.6953 estimate D2E/DX2 !
! A130 A(67,64,68) 118.6573 estimate D2E/DX2 !
! A131 A(63,65,66) 120.6385 estimate D2E/DX2 !
! A132 A(63,65,69) 120.687 estimate D2E/DX2 !
! A133 A(66,65,69) 118.666 estimate D2E/DX2 !
! A134 A(65,66,67) 119.8907 estimate D2E/DX2 !
! A135 A(65,66,71) 112.5478 estimate D2E/DX2 !
! A136 A(67,66,71) 127.4293 estimate D2E/DX2 !
! A137 A(64,67,66) 119.8922 estimate D2E/DX2 !
! A138 A(64,67,70) 112.5598 estimate D2E/DX2 !
! A139 A(66,67,70) 127.4186 estimate D2E/DX2 !
! A140 A(67,70,73) 121.8469 estimate D2E/DX2 !
! A141 A(67,70,75) 121.4064 estimate D2E/DX2 !
! A142 A(73,70,75) 116.51 estimate D2E/DX2 !
! A143 A(66,71,72) 121.8502 estimate D2E/DX2 !
! A144 A(66,71,74) 121.422 estimate D2E/DX2 !
! A145 A(72,71,74) 116.4874 estimate D2E/DX2 !
! A146 A(71,74,76) 126.4383 estimate D2E/DX2 !
! A147 A(70,75,76) 126.4668 estimate D2E/DX2 !
! A148 A(74,76,75) 94.3902 estimate D2E/DX2 !
! A149 A(42,77,62) 161.8111 estimate D2E/DX2 !
! D1 D(5,1,2,3) -0.0084 estimate D2E/DX2 !
! D2 D(5,1,2,40) 157.7956 estimate D2E/DX2 !
! D3 D(6,1,2,3) -178.84 estimate D2E/DX2 !
! D4 D(6,1,2,40) -21.0359 estimate D2E/DX2 !
! D5 D(2,1,5,4) 0.0101 estimate D2E/DX2 !
! D6 D(2,1,5,7) -179.0032 estimate D2E/DX2 !
! D7 D(6,1,5,4) 179.0318 estimate D2E/DX2 !
! D8 D(6,1,5,7) 0.0185 estimate D2E/DX2 !
! D9 D(2,1,6,9) -178.963 estimate D2E/DX2 !
! D10 D(2,1,6,10) 2.1147 estimate D2E/DX2 !
! D11 D(5,1,6,9) 2.3174 estimate D2E/DX2 !
! D12 D(5,1,6,10) -176.6049 estimate D2E/DX2 !
! D13 D(1,2,3,4) 0.0039 estimate D2E/DX2 !
! D14 D(1,2,3,37) -179.0551 estimate D2E/DX2 !
! D15 D(40,2,3,4) -163.9453 estimate D2E/DX2 !
! D16 D(40,2,3,37) 16.9957 estimate D2E/DX2 !
! D17 D(1,2,40,22) -107.3968 estimate D2E/DX2 !
! D18 D(3,2,40,22) 49.5029 estimate D2E/DX2 !
! D19 D(2,3,4,5) 0.0025 estimate D2E/DX2 !
! D20 D(2,3,4,39) -136.9751 estimate D2E/DX2 !
! D21 D(37,3,4,5) 178.9315 estimate D2E/DX2 !
! D22 D(37,3,4,39) 41.9539 estimate D2E/DX2 !
! D23 D(2,3,37,43) 5.4802 estimate D2E/DX2 !
! D24 D(2,3,37,61) 169.1219 estimate D2E/DX2 !
! D25 D(4,3,37,43) -173.3874 estimate D2E/DX2 !
! D26 D(4,3,37,61) -9.7457 estimate D2E/DX2 !
! D27 D(3,4,5,1) -0.0077 estimate D2E/DX2 !
! D28 D(3,4,5,7) 178.8136 estimate D2E/DX2 !
! D29 D(39,4,5,1) 118.6418 estimate D2E/DX2 !
! D30 D(39,4,5,7) -62.537 estimate D2E/DX2 !
! D31 D(3,4,39,60) -84.2639 estimate D2E/DX2 !
! D32 D(5,4,39,60) 154.23 estimate D2E/DX2 !
! D33 D(1,5,7,8) -2.3461 estimate D2E/DX2 !
! D34 D(1,5,7,11) 176.5787 estimate D2E/DX2 !
! D35 D(4,5,7,8) 178.9455 estimate D2E/DX2 !
! D36 D(4,5,7,11) -2.1297 estimate D2E/DX2 !
! D37 D(1,6,9,8) -2.3366 estimate D2E/DX2 !
! D38 D(1,6,9,12) -178.502 estimate D2E/DX2 !
! D39 D(10,6,9,8) 176.6074 estimate D2E/DX2 !
! D40 D(10,6,9,12) 0.442 estimate D2E/DX2 !
! D41 D(5,7,8,9) 2.3484 estimate D2E/DX2 !
! D42 D(5,7,8,13) 178.4735 estimate D2E/DX2 !
! D43 D(11,7,8,9) -176.5978 estimate D2E/DX2 !
! D44 D(11,7,8,13) -0.4728 estimate D2E/DX2 !
! D45 D(7,8,9,6) -0.0015 estimate D2E/DX2 !
! D46 D(7,8,9,12) 175.5386 estimate D2E/DX2 !
! D47 D(13,8,9,6) -175.4936 estimate D2E/DX2 !
! D48 D(13,8,9,12) 0.0465 estimate D2E/DX2 !
! D49 D(7,8,13,14) -35.9518 estimate D2E/DX2 !
! D50 D(7,8,13,16) 138.2165 estimate D2E/DX2 !
! D51 D(9,8,13,14) 139.817 estimate D2E/DX2 !
! D52 D(9,8,13,16) -46.0147 estimate D2E/DX2 !
! D53 D(6,9,12,15) 35.8156 estimate D2E/DX2 !
! D54 D(6,9,12,17) -138.3989 estimate D2E/DX2 !
! D55 D(8,9,12,15) -139.9979 estimate D2E/DX2 !
! D56 D(8,9,12,17) 45.7876 estimate D2E/DX2 !
! D57 D(9,12,17,18) 1.0393 estimate D2E/DX2 !
! D58 D(15,12,17,18) -173.4696 estimate D2E/DX2 !
! D59 D(8,13,16,18) -0.7444 estimate D2E/DX2 !
! D60 D(14,13,16,18) 173.7219 estimate D2E/DX2 !
! D61 D(13,16,18,17) 58.9597 estimate D2E/DX2 !
! D62 D(12,17,18,16) -59.1572 estimate D2E/DX2 !
! D63 D(23,19,20,21) -0.0084 estimate D2E/DX2 !
! D64 D(23,19,20,38) 165.2609 estimate D2E/DX2 !
! D65 D(24,19,20,21) -178.84 estimate D2E/DX2 !
! D66 D(24,19,20,38) -13.5706 estimate D2E/DX2 !
! D67 D(20,19,23,22) 0.0101 estimate D2E/DX2 !
! D68 D(20,19,23,25) -179.0032 estimate D2E/DX2 !
! D69 D(24,19,23,22) 179.0318 estimate D2E/DX2 !
! D70 D(24,19,23,25) 0.0185 estimate D2E/DX2 !
! D71 D(20,19,24,27) -178.963 estimate D2E/DX2 !
! D72 D(20,19,24,28) 2.1147 estimate D2E/DX2 !
! D73 D(23,19,24,27) 2.3174 estimate D2E/DX2 !
! D74 D(23,19,24,28) -176.6049 estimate D2E/DX2 !
! D75 D(19,20,21,22) 0.0039 estimate D2E/DX2 !
! D76 D(38,20,21,22) -174.3669 estimate D2E/DX2 !
! D77 D(19,20,38,44) 99.93 estimate D2E/DX2 !
! D78 D(21,20,38,44) -94.2255 estimate D2E/DX2 !
! D79 D(20,21,22,23) 0.0025 estimate D2E/DX2 !
! D80 D(20,21,22,40) -151.6668 estimate D2E/DX2 !
! D81 D(21,22,23,19) -0.0077 estimate D2E/DX2 !
! D82 D(21,22,23,25) 178.8136 estimate D2E/DX2 !
! D83 D(40,22,23,19) 138.3423 estimate D2E/DX2 !
! D84 D(40,22,23,25) -42.8364 estimate D2E/DX2 !
! D85 D(21,22,40,2) -56.0455 estimate D2E/DX2 !
! D86 D(23,22,40,2) 165.5065 estimate D2E/DX2 !
! D87 D(19,23,25,26) -2.3461 estimate D2E/DX2 !
! D88 D(19,23,25,29) 176.5787 estimate D2E/DX2 !
! D89 D(22,23,25,26) 178.9455 estimate D2E/DX2 !
! D90 D(22,23,25,29) -2.1297 estimate D2E/DX2 !
! D91 D(19,24,27,26) -2.3366 estimate D2E/DX2 !
! D92 D(19,24,27,30) -178.502 estimate D2E/DX2 !
! D93 D(28,24,27,26) 176.6074 estimate D2E/DX2 !
! D94 D(28,24,27,30) 0.442 estimate D2E/DX2 !
! D95 D(23,25,26,27) 2.3484 estimate D2E/DX2 !
! D96 D(23,25,26,31) 178.4735 estimate D2E/DX2 !
! D97 D(29,25,26,27) -176.5978 estimate D2E/DX2 !
! D98 D(29,25,26,31) -0.4728 estimate D2E/DX2 !
! D99 D(25,26,27,24) -0.0015 estimate D2E/DX2 !
! D100 D(25,26,27,30) 175.5386 estimate D2E/DX2 !
! D101 D(31,26,27,24) -175.4936 estimate D2E/DX2 !
! D102 D(31,26,27,30) 0.0465 estimate D2E/DX2 !
! D103 D(25,26,31,32) -35.9518 estimate D2E/DX2 !
! D104 D(25,26,31,34) 138.2165 estimate D2E/DX2 !
! D105 D(27,26,31,32) 139.817 estimate D2E/DX2 !
! D106 D(27,26,31,34) -46.0147 estimate D2E/DX2 !
! D107 D(24,27,30,33) 35.8156 estimate D2E/DX2 !
! D108 D(24,27,30,35) -138.3989 estimate D2E/DX2 !
! D109 D(26,27,30,33) -139.9979 estimate D2E/DX2 !
! D110 D(26,27,30,35) 45.7876 estimate D2E/DX2 !
! D111 D(27,30,35,36) 1.0393 estimate D2E/DX2 !
! D112 D(33,30,35,36) -173.4696 estimate D2E/DX2 !
! D113 D(26,31,34,36) -0.7444 estimate D2E/DX2 !
! D114 D(32,31,34,36) 173.7219 estimate D2E/DX2 !
! D115 D(31,34,36,35) 58.9597 estimate D2E/DX2 !
! D116 D(30,35,36,34) -59.1572 estimate D2E/DX2 !
! D117 D(3,37,43,42) 150.803 estimate D2E/DX2 !
! D118 D(3,37,43,44) -46.0517 estimate D2E/DX2 !
! D119 D(61,37,43,42) -12.3519 estimate D2E/DX2 !
! D120 D(61,37,43,44) 150.7934 estimate D2E/DX2 !
! D121 D(3,37,61,60) -16.5687 estimate D2E/DX2 !
! D122 D(3,37,61,62) -170.3217 estimate D2E/DX2 !
! D123 D(43,37,61,60) 160.5679 estimate D2E/DX2 !
! D124 D(43,37,61,62) 6.8149 estimate D2E/DX2 !
! D125 D(20,38,44,43) 77.927 estimate D2E/DX2 !
! D126 D(20,38,44,45) -136.3512 estimate D2E/DX2 !
! D127 D(4,39,60,59) -153.6812 estimate D2E/DX2 !
! D128 D(4,39,60,61) 61.5189 estimate D2E/DX2 !
! D129 D(45,41,42,43) -0.0084 estimate D2E/DX2 !
! D130 D(45,41,42,77) 157.7956 estimate D2E/DX2 !
! D131 D(46,41,42,43) -178.84 estimate D2E/DX2 !
! D132 D(46,41,42,77) -21.0359 estimate D2E/DX2 !
! D133 D(42,41,45,44) -0.8604 estimate D2E/DX2 !
! D134 D(42,41,45,47) -179.0032 estimate D2E/DX2 !
! D135 D(46,41,45,44) 178.1614 estimate D2E/DX2 !
! D136 D(46,41,45,47) 0.0185 estimate D2E/DX2 !
! D137 D(42,41,46,49) -178.963 estimate D2E/DX2 !
! D138 D(42,41,46,50) 2.1147 estimate D2E/DX2 !
! D139 D(45,41,46,49) 2.3174 estimate D2E/DX2 !
! D140 D(45,41,46,50) -176.6049 estimate D2E/DX2 !
! D141 D(41,42,43,37) 167.5919 estimate D2E/DX2 !
! D142 D(41,42,43,44) 0.9386 estimate D2E/DX2 !
! D143 D(77,42,43,37) 3.6427 estimate D2E/DX2 !
! D144 D(77,42,43,44) -163.0106 estimate D2E/DX2 !
! D145 D(41,42,77,62) -107.3968 estimate D2E/DX2 !
! D146 D(43,42,77,62) 49.5029 estimate D2E/DX2 !
! D147 D(37,43,44,38) -4.8343 estimate D2E/DX2 !
! D148 D(37,43,44,45) -164.1752 estimate D2E/DX2 !
! D149 D(42,43,44,38) 157.9126 estimate D2E/DX2 !
! D150 D(42,43,44,45) -1.4283 estimate D2E/DX2 !
! D151 D(38,44,45,41) -145.3011 estimate D2E/DX2 !
! D152 D(38,44,45,47) 32.5234 estimate D2E/DX2 !
! D153 D(43,44,45,41) 1.3432 estimate D2E/DX2 !
! D154 D(43,44,45,47) 179.1677 estimate D2E/DX2 !
! D155 D(41,45,47,48) -2.3461 estimate D2E/DX2 !
! D156 D(41,45,47,51) 176.5787 estimate D2E/DX2 !
! D157 D(44,45,47,48) -179.9784 estimate D2E/DX2 !
! D158 D(44,45,47,51) -1.0536 estimate D2E/DX2 !
! D159 D(41,46,49,48) -2.3366 estimate D2E/DX2 !
! D160 D(41,46,49,52) -178.502 estimate D2E/DX2 !
! D161 D(50,46,49,48) 176.6074 estimate D2E/DX2 !
! D162 D(50,46,49,52) 0.442 estimate D2E/DX2 !
! D163 D(45,47,48,49) 2.3484 estimate D2E/DX2 !
! D164 D(45,47,48,53) 178.4735 estimate D2E/DX2 !
! D165 D(51,47,48,49) -176.5978 estimate D2E/DX2 !
! D166 D(51,47,48,53) -0.4728 estimate D2E/DX2 !
! D167 D(47,48,49,46) -0.0015 estimate D2E/DX2 !
! D168 D(47,48,49,52) 175.5386 estimate D2E/DX2 !
! D169 D(53,48,49,46) -175.4936 estimate D2E/DX2 !
! D170 D(53,48,49,52) 0.0465 estimate D2E/DX2 !
! D171 D(47,48,53,54) -35.9518 estimate D2E/DX2 !
! D172 D(47,48,53,56) 138.2165 estimate D2E/DX2 !
! D173 D(49,48,53,54) 139.817 estimate D2E/DX2 !
! D174 D(49,48,53,56) -46.0147 estimate D2E/DX2 !
! D175 D(46,49,52,55) 35.8156 estimate D2E/DX2 !
! D176 D(46,49,52,57) -138.3989 estimate D2E/DX2 !
! D177 D(48,49,52,55) -139.9979 estimate D2E/DX2 !
! D178 D(48,49,52,57) 45.7876 estimate D2E/DX2 !
! D179 D(49,52,57,58) 1.0393 estimate D2E/DX2 !
! D180 D(55,52,57,58) -173.4696 estimate D2E/DX2 !
! D181 D(48,53,56,58) -0.7444 estimate D2E/DX2 !
! D182 D(54,53,56,58) 173.7219 estimate D2E/DX2 !
! D183 D(53,56,58,57) 58.9597 estimate D2E/DX2 !
! D184 D(52,57,58,56) -59.1572 estimate D2E/DX2 !
! D185 D(63,59,60,39) -144.8156 estimate D2E/DX2 !
! D186 D(63,59,60,61) -0.0084 estimate D2E/DX2 !
! D187 D(64,59,60,39) 36.3529 estimate D2E/DX2 !
! D188 D(64,59,60,61) -178.84 estimate D2E/DX2 !
! D189 D(60,59,63,62) 0.0101 estimate D2E/DX2 !
! D190 D(60,59,63,65) -179.0032 estimate D2E/DX2 !
! D191 D(64,59,63,62) 179.0318 estimate D2E/DX2 !
! D192 D(64,59,63,65) 0.0185 estimate D2E/DX2 !
! D193 D(60,59,64,67) -178.963 estimate D2E/DX2 !
! D194 D(60,59,64,68) 2.1147 estimate D2E/DX2 !
! D195 D(63,59,64,67) 2.3174 estimate D2E/DX2 !
! D196 D(63,59,64,68) -176.6049 estimate D2E/DX2 !
! D197 D(39,60,61,37) 2.5291 estimate D2E/DX2 !
! D198 D(39,60,61,62) 157.065 estimate D2E/DX2 !
! D199 D(59,60,61,37) -154.532 estimate D2E/DX2 !
! D200 D(59,60,61,62) 0.0039 estimate D2E/DX2 !
! D201 D(37,61,62,63) 157.9582 estimate D2E/DX2 !
! D202 D(37,61,62,77) 6.2889 estimate D2E/DX2 !
! D203 D(60,61,62,63) 0.0025 estimate D2E/DX2 !
! D204 D(60,61,62,77) -151.6668 estimate D2E/DX2 !
! D205 D(61,62,63,59) -0.0077 estimate D2E/DX2 !
! D206 D(61,62,63,65) 178.8136 estimate D2E/DX2 !
! D207 D(77,62,63,59) 138.3423 estimate D2E/DX2 !
! D208 D(77,62,63,65) -42.8364 estimate D2E/DX2 !
! D209 D(61,62,77,42) -56.0455 estimate D2E/DX2 !
! D210 D(63,62,77,42) 165.5065 estimate D2E/DX2 !
! D211 D(59,63,65,66) -2.3461 estimate D2E/DX2 !
! D212 D(59,63,65,69) 176.5787 estimate D2E/DX2 !
! D213 D(62,63,65,66) 178.9455 estimate D2E/DX2 !
! D214 D(62,63,65,69) -2.1297 estimate D2E/DX2 !
! D215 D(59,64,67,66) -2.3366 estimate D2E/DX2 !
! D216 D(59,64,67,70) -178.502 estimate D2E/DX2 !
! D217 D(68,64,67,66) 176.6074 estimate D2E/DX2 !
! D218 D(68,64,67,70) 0.442 estimate D2E/DX2 !
! D219 D(63,65,66,67) 2.3484 estimate D2E/DX2 !
! D220 D(63,65,66,71) 178.4735 estimate D2E/DX2 !
! D221 D(69,65,66,67) -176.5978 estimate D2E/DX2 !
! D222 D(69,65,66,71) -0.4728 estimate D2E/DX2 !
! D223 D(65,66,67,64) -0.0015 estimate D2E/DX2 !
! D224 D(65,66,67,70) 175.5386 estimate D2E/DX2 !
! D225 D(71,66,67,64) -175.4936 estimate D2E/DX2 !
! D226 D(71,66,67,70) 0.0465 estimate D2E/DX2 !
! D227 D(65,66,71,72) -35.9518 estimate D2E/DX2 !
! D228 D(65,66,71,74) 138.2165 estimate D2E/DX2 !
! D229 D(67,66,71,72) 139.817 estimate D2E/DX2 !
! D230 D(67,66,71,74) -46.0147 estimate D2E/DX2 !
! D231 D(64,67,70,73) 35.8156 estimate D2E/DX2 !
! D232 D(64,67,70,75) -138.3989 estimate D2E/DX2 !
! D233 D(66,67,70,73) -139.9979 estimate D2E/DX2 !
! D234 D(66,67,70,75) 45.7876 estimate D2E/DX2 !
! D235 D(67,70,75,76) 1.0393 estimate D2E/DX2 !
! D236 D(73,70,75,76) -173.4696 estimate D2E/DX2 !
! D237 D(66,71,74,76) -0.7444 estimate D2E/DX2 !
! D238 D(72,71,74,76) 173.7219 estimate D2E/DX2 !
! D239 D(71,74,76,75) 58.9597 estimate D2E/DX2 !
! D240 D(70,75,76,74) -59.1572 estimate D2E/DX2 !
--------------------------------------------------------------------------------
Number of steps in this run= 462 maximum allowed number of steps= 462.
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad

Framework group C1[X(C40H8CoN8O16Pd4)]
Deg. of freedom 225
Standard orientation:
---------------------------------------------------------------------
Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms)
Number Number Type X Y Z
---------------------------------------------------------------------
1 6 0 -4.185115 -0.329074 -0.860616
2 6 0 -2.932064 0.296824 -0.748731
3 7 0 -1.980539 -0.657400 -1.068602
4 6 0 -2.558418 -1.876084 -1.383675
5 6 0 -3.948151 -1.707114 -1.263448
6 6 0 -5.518354 0.126822 -0.683772
7 6 0 -5.054262 -2.572713 -1.473319
8 6 0 -6.357879 -2.127790 -1.249899
9 6 0 -6.595507 -0.745355 -0.845591
10 1 0 -5.721124 1.164495 -0.437133
11 1 0 -4.903950 -3.588007 -1.827266
12 6 0 -7.925800 -0.063748 -0.650965
13 6 0 -7.389842 -3.180915 -1.563626
14 8 0 -7.247140 -3.981734 -2.511026
15 8 0 -8.122634 1.113641 -1.017099
16 8 0 -8.472297 -3.382110 -0.752841
17 8 0 -8.940381 -0.665612 0.040299
18 46 0 -8.879823 -2.420765 0.899413
19 6 0 -0.360933 4.512651 -0.868467
20 6 0 0.406018 3.410557 -1.282685
21 7 0 -0.476033 2.358953 -1.468088
22 6 0 -1.782534 2.727540 -1.193123
23 6 0 -1.748954 4.079514 -0.811809
24 6 0 -0.036038 5.857621 -0.548875
25 6 0 -2.755296 5.009301 -0.438231
26 6 0 -2.419085 6.315311 -0.079637
27 6 0 -1.026553 6.749708 -0.136324
28 1 0 0.984549 6.217230 -0.637170
29 1 0 -3.802714 4.723657 -0.442549
30 6 0 -0.487714 8.133880 0.120326
31 6 0 -3.628017 7.154424 0.247193
32 8 0 -4.706724 7.023724 -0.368072
33 8 0 0.427335 8.623822 -0.573710
34 8 0 -3.632614 8.014357 1.310233
35 8 0 -0.896921 8.869286 1.197910
36 46 0 -2.169237 8.308079 2.572161
37 27 0 0.027808 -0.125884 -0.991529
38 7 0 1.539507 2.715410 -1.773542
39 7 0 -1.705784 -2.719482 -0.700962
40 7 0 -2.429570 1.581770 -0.777243
41 6 0 4.178324 0.375631 -0.709215
42 6 0 2.924328 -0.238012 -0.550040
43 7 0 1.970725 0.740621 -0.776267
44 6 0 2.506988 1.994170 -1.104070
45 6 0 3.939746 1.771808 -1.042668
46 6 0 5.512389 -0.104273 -0.627943
47 6 0 5.045110 2.630806 -1.281584
48 6 0 6.352437 2.160362 -1.151703
49 6 0 6.591696 0.759725 -0.816990
50 1 0 5.713087 -1.153622 -0.434813
51 1 0 4.890296 3.661463 -1.585677
52 6 0 7.920394 0.053632 -0.726768
53 6 0 7.380702 3.211882 -1.482491
54 8 0 7.196255 4.052196 -2.387530
55 8 0 8.077974 -1.110411 -1.150106
56 8 0 8.510718 3.366045 -0.728265
57 8 0 8.981929 0.613821 -0.071944
58 46 0 8.997406 2.333375 0.858219
59 6 0 0.286553 -4.411895 -0.688236
60 6 0 -0.485943 -3.284093 -1.013374
61 7 0 0.399992 -2.237348 -1.207552
62 6 0 1.714311 -2.633651 -1.023390
63 6 0 1.681987 -3.999411 -0.694734
64 6 0 -0.040001 -5.764387 -0.404040
65 6 0 2.693757 -4.956515 -0.417130
66 6 0 2.358733 -6.271516 -0.091826
67 6 0 0.958775 -6.685198 -0.085147
68 1 0 -1.069333 -6.106883 -0.447415
69 1 0 3.743446 -4.684513 -0.470625
70 6 0 0.414454 -8.071538 0.147069
71 6 0 3.571445 -7.138757 0.131036
72 8 0 4.615047 -6.997218 -0.539860
73 8 0 -0.546174 -8.521082 -0.511829
74 8 0 3.623744 -8.041027 1.157065
75 8 0 0.873384 -8.855221 1.169167
76 46 0 2.230661 -8.366651 2.488791
77 7 0 2.401485 -1.514137 -0.600446
---------------------------------------------------------------------
Rotational constants (GHZ): 0.0137955 0.0130194 0.0071627
962 basis functions, 1380 primitive gaussians, 962 cartesian basis functions
197 alpha electrons 196 beta electrons
nuclear repulsion energy 6124.9250864404 Hartrees.
NAtoms= 77 NActive= 77 NUniq= 77 SFac= 7.50D-01 NAtFMM= 80 NAOKFM=F Big=T
1 Symmetry operations used in ECPInt.
ECPInt: NShTT= 31626 NPrTT= 65844 LenC2= 19899 LenP2D= 33024.
LDataN: DoStor=T MaxTD1= 5 Len= 102
Defaulting to unpruned grid for atomic number 46.
Defaulting to unpruned grid for atomic number 46.
Defaulting to unpruned grid for atomic number 46.
Defaulting to unpruned grid for atomic number 46.
Harris functional with IExCor= 1009 diagonalized for initial guess.
ExpMin= 4.22D-02 ExpMax= 7.57D+01 ExpMxC= 5.17D+01 IAcc=2 IRadAn= 0 AccDes= 0.00D+00
HarFok: IExCor= 1009 AccDes= 0.00D+00 IRadAn= 0 IDoV= 1
ScaDFX= 1.000000 1.000000 1.000000 1.000000
Defaulting to unpruned grid for atomic number 46.
Defaulting to unpruned grid for atomic number 46.
Defaulting to unpruned grid for atomic number 46.
Defaulting to unpruned grid for atomic number 46.
FoFCou: FMM=F IPFlag= 0 FMFlag= 100000 FMFlg1= 1
NFxFlg= 0 DoJE=T BraDBF=F KetDBF=T FulRan=T
Omega= 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 ICntrl= 500 IOpCl= 0
NMat0= 1 NMatS0= 1 NMatT0= 0 NMatD0= 1 NMtDS0= 0 NMtDT0= 0
I1Cent= 4 NGrid= 0.
Petite list used in FoFCou.
Initial guess orbital symmetries:
Alpha Orbitals:
Occupied (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A)
Virtual (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
Beta Orbitals:
Occupied (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A)
Virtual (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
(A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
The electronic state of the initial guess is 2-A.
Initial guess <Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 0.5000 <S**2>= 0.7500 S= 0.5000
Defaulting to unpruned grid for atomic number 46.
Defaulting to unpruned grid for atomic number 46.
Defaulting to unpruned grid for atomic number 46.
Defaulting to unpruned grid for atomic number 46.
Note: rotation exceeds Pi/2.

Sokolik93
Сообщения: 14
Зарегистрирован: Чт окт 17, 2013 4:58 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение Sokolik93 » Чт окт 17, 2013 6:45 pm

Вот так вот висит при задании команды SCF=QC, если ее убрать и оптимизировать по умолчанию то вылезает сообщение: problems with inexpensive integrals и начинаются циклы:EnCoef did 100 forward-backward iterations, затем спустя пару часов пишет что нет сходимости.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение Гесс » Чт окт 17, 2013 8:29 pm

На форуме есть замечательная фича - возможность приложить файлы.
Отредактируйте пожалуйста свое сообщение с аутпутом (это начало аутпута на мой взгляд весьма мало информативно), удалив весь этот текст, и просто приложите файл. Весь целиком.
Если будет ругаться на расширение - поменяйте ему расширение на txt или заархивируйте.
Раз вы пробовали и с scf=qc и без этой опции - приложите оба аутпута.

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение VTur » Чт окт 17, 2013 8:31 pm

При следующем расчете букву Т в #T уберите, а то ничего непонятно
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение Гесс » Чт окт 17, 2013 9:04 pm

Я обычно считаю с #P

Sokolik93
Сообщения: 14
Зарегистрирован: Чт окт 17, 2013 4:58 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение Sokolik93 » Чт окт 17, 2013 10:56 pm

хорошо,я просто пытался и постоянно стирал предыдущий out.,завтра все выложу

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение sanya1024 » Пт окт 18, 2013 4:28 am

Все очень плохо. На картинке показано, что коорд. сферы всех атомов Pd заткнуты DMSO. Значит, они там нужны! "Оголенный" атом металла -- это всегда источник проблем с геометрией. Дальше: разберитесь с зарядом и мультиплетностью Вашей системы. Неправильная мультиплетность -- это гарантированная плохая сходимость ССП. Открытая оболочка -- это гарантированная проблема для чистого GGA функционала, каковым является PBE. Ну, и на десерт -- размер системы, неподъемный для Гауссиана (если у Вас не кластер и Гауссиан не параллельный с Линдой). Особенно если, как это требуется, прикроете голые атомы Pd DMSO.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение Гесс » Пт окт 18, 2013 12:27 pm

Кстати да, у меня было вчера несколько мыслей но я их забыл написать, спасибо sanya1024 что напомнили:
1) Я не работал с этим базисом, может он и очень дешевый, но меньше 2 гигов памяти на такую молекулу мне показалось мало.
2) Даже при закрытии атомов ДМСО или чем либо еще, я бы все равно боялся высокоспиновых состояний.
3) Может имеет смысл усложнять задачу постепенно: сначала посчитать только фталоцианиновое ядро, потом с карбоксилами, а там глядишь и металлы довешивать.
При ограниченности ресурсов может имеет смысл уйти куда то типа AM1*, PM6 ?

endlesslake
Сообщения: 209
Зарегистрирован: Чт авг 09, 2012 9:13 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение endlesslake » Пт окт 18, 2013 1:45 pm

sanya1024 писал(а): Открытая оболочка -- это гарантированная проблема для чистого GGA функционала, каковым является PBE.
А можно поподробнее о гарантированных проблемах ?

Sokolik93
Сообщения: 14
Зарегистрирован: Чт окт 17, 2013 4:58 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение Sokolik93 » Пт окт 18, 2013 2:51 pm

Гесс писал(а):Кстати да, у меня было вчера несколько мыслей но я их забыл написать, спасибо sanya1024 что напомнили:
1) Я не работал с этим базисом, может он и очень дешевый, но меньше 2 гигов памяти на такую молекулу мне показалось мало.
2) Даже при закрытии атомов ДМСО или чем либо еще, я бы все равно боялся высокоспиновых состояний.
3) Может имеет смысл усложнять задачу постепенно: сначала посчитать только фталоцианиновое ядро, потом с карбоксилами, а там глядишь и металлы довешивать.
При ограниченности ресурсов может имеет смысл уйти куда то типа AM1*, PM6 ?
Дело все в том,что как только я пытаюсь соединить все с Co у меня нет сходимости, у меня на d орбитали неспаренный электрон, получается мультиплетность точно не 1, я думаю что я что то не дописываю в командной строке, чего то там не хватает, я только начал и естественно всего не знаю

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение Гесс » Пт окт 18, 2013 4:03 pm

Я ни разу не специалист, но помоему фталоцианиновое кольцо очень перекошено. Может вы попробуете сначала довести до ума чисто фталоцианин кобальта без всей этой карбокси-палладиевой обвязки? Системе должно полегчать и она, даст бог, даст нормальную геометрию хотя бы центра. А палладиевые хвосты тоже выглядят довольно пессиместично. Я бы попробовал после выравнивания фталоцианина довесить один палладий с карбоксилами и ДМСО и оптимизировать это.
А из текущей геометрии я опасаюсь что даже если вылечить, оптимизация может затянуться или прийти к странному минимуму (еще дай бог минимуму).

Sokolik93
Сообщения: 14
Зарегистрирован: Чт окт 17, 2013 4:58 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение Sokolik93 » Пт окт 18, 2013 6:33 pm

Сейчас перебираю всевозможные базисы и модели,вроде что то оптимизируется,буду сообщать если что то сдвинется с места

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение sanya1024 » Пт окт 18, 2013 7:04 pm

Какой заряд у Co? почему на d оболочке у него 1 неспаренный электрон? А какой заряд у фталоцианина? Полный заряд системы 0? Фталоцианиновый лиганд обычно имеет заряд 2-, если комплекс фталоцианин-Co нейтральный, то Co должен быть 2+. Это конфигурация d7. Формально -- 3 неспаренных d электрона, mult=4. Но в поле сильного лиганда (а фталоцианин таким является) скорее всего 2 из 3 электронов спарятся, и действительно останется 1 неспаренный, mult=2. Можно проверить простым расчетом комплекса фталоцианин-Co с mult=2 и mult=4 (если спаривание электронов выгодно, то структура с mult=2 будет иметь более низкую энергию, чем с mult=4).
Какой заряд у Pd? по всей вероятности 2+ (конфигурация d8). Пара карбоксилов его компенсирует. Но достаточно ли их силы поля лигандов, чтобы неспаренные d электроны спарились? наверное, да -- можно проверить простым расчетом комплекса Pd с бензолдикарбоновой кислотой и 2-мя DMSO (аналогичная проверка с mult=1 и mult=3).

Если неспаренный электрон только один и понятно где он должен быть локализован -- проблем особых не будет. RO-DFT (Restricted Open-shell DFT) -- и никаких проблем. Если окажется, что есть неспаренные электроны и на кобальте, и на палладии -- Вам крышка. В DFT вся эта спиновая плотность будет гулять почти как попало. Собс-но, и так один неспаренный электрон может оказаться более делокализованным, чем ему положено, и гулять по всей молекуле, приводя к проблемам со сходимостью.

В общем, правильно Вам советуют соптимизировать сначала куски: CoPc (без бензольных колец) и Pd(Bz)(DMSO)2. А потом из них уже склеите молекулу и останется только слегка дооптимизировать.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение VTur » Сб окт 19, 2013 9:31 pm

Хорошая у Вас молекула, внушает.

Так как нисколько не специалист, то моим советом можете пренебречь, но я бы сначала посоветовал для начинающего изучать квантовую химию и для такой молекулы сделать следующие действия
1. Провести конформационный анализ молмеханикой - сгенерировать все возможные структуры.
2. Выкинуть все оптические изомеры (если получиться)
3. Соптимизировать структуры полуэмпирикой. Выбрать из них несколько самых низких по энергии
4. Почитать литературу, какой функционал применяют для таких молекул и соптимизировать структуры в этом функционале со средним базисом.
5. Выбрать пару-тройку самых низких по энергии структур и соптимизировать структуры в выбранном функционале с наибольшим базисом, который можно запихнуть в компьютер, + частоты.
6. Сравнить полученные данные с экспериментом.

Но можете моим советом пренебречь.
После отстоя требуйте долива

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение sanya1024 » Вс окт 20, 2013 12:49 am

У этой молекулы с конформерами все однозначно, как нарисовано на картинке -- так и будет (возможны небольшие неоднозначности с DMSO, но это лучше глянуть в Кембриджской базе данных, если есть такая возможность). Но в ММ соптимизировать для начала вполне можно. Стадию полуэмпирики можно пропустить, тем более тут переходные металлы, для к-рых полуэмп. параметров может не быть (да и ММ параметров может тоже не найтись). Про применение функционалов для комплексов переходных металлов можно прочитать, как ни странно, в мануале Орки, где приведено множество ссылок на соотв. статьи. Кстати, если задача не влезет, советую переходить на Орку -- формат инпута тоже довольно простой и понятный, но неплохо параллелится, быстро считает и непрожорлива.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение Гесс » Вс окт 20, 2013 1:37 am

У меня почему-то предположение, что вместо того что ему тут насоветовали, ТС как написал в последнем посте перебирает базисы.

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение sanya1024 » Вс окт 20, 2013 3:57 am

Ну, как дойдет до triple-zeta -- сам придет :)
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

VTur
Сообщения: 7357
Зарегистрирован: Пт авг 31, 2007 1:36 pm

Re: Создание Input-файла в программе Gaussian

Сообщение VTur » Вс окт 20, 2013 10:51 am

Если молекула не плоская и нет неконцевых одинарных связей, отделяющих один волчек от другого, то при N прирамидальных узлов в ней будет 2 в степени N минус число оптических измомеров конформаций.. И почти все они будут разными по энергии. И как ему выбрать глобальный минимум?
Если молекула плоскач - тут без вариантов, нужно сразу рисовать плоскую.

[ Post made via Android ] Изображение
После отстоя требуйте долива

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 5 гостей