PC GAMESS вопрос новичка

[Aeon9537]

Здравствуйте уважаемые пользователи форума. У меня возникли проблемы при использовании PC GAMESS. Как вводить данные? И как получить результат?

[Reizen]

У PC GAMESS, ныне Firefly - очень хорошо написанный и толковый мануал (потому что это фактически мануал к оригинальному, американскому GAMESS-у, с некоторыми добавлениями). В отличие, например, от Gaussian-а.

Если вы действительно изучали курс квантовой химии и строения вещества - то проблем с пониманием написанного у вас почти никаких не будет. Берите и читайте - сначала о группе $CONTRL, а затем уже по принципу гипертекстов - читайте обо всех вопросах, которые нужны именно вам.

[Гесс]

У PC GAMESS, ныне Firefly - очень хорошо написанный и толковый мануал. В отличие, например, от Gaussian-а.

Вот непонимаю, почему все ругают мануал гауссиана? Имхо единственный нормальный мануал который я читал.

[Shorku]

Имхо единственный нормальный мануал который я читал.

Вы просто не читали мануал к ORCA, например)

[Aeon9537]

Извините, но я только приступил к изучению квантовой химии. Проблема у меня была и с GAMESS: я не мог ее запустить.

[Shorku]

Извините, но я только приступил к изучению квантовой химии. Проблема у меня была и с GAMESS: я не мог ее запустить.

ну Вы бы для начала поведали, что делаете, и что не получается.
-не получается установить?
-или вы не знаете что делать, чтобы установленная программа что-то посчитала?
-или программу Вы запускаете, но она ругается на инпут или еще что-нибудь?
-...
м?

[Aeon9537]

Я установил GAMESS, как требовалось в установке. В результате не запущу exe-файл. Молекулу рисовал через Avogadro. Там и оптимизацию сделав. Вопрос №1: так и должно быть с GAMESS? Вопрос №2: как задавать параметры в этом случае?

[VTur]

На Ваши вопросы ответ дать невозможно. Напишите подробно, что происходит.

[Aeon9537]

Запускаю файл - пишет, что прекращена работа. GAMESS-ом считаю с помощью командной строки: даю ссылку на файл и дает какой-то файл с результатом. НО:
1. Это так и должно быть?
2. Как задавать параметры молекулы?

[VTur]

У Вас файл создан в Виндовском формате? Какой конец строки?

[Aeon9537]

Да. EXE-файл

[Aeon9537]

Извините, но я немножко ошибся. Если речь шла об созданном файле, то у него формат .log. Я так понял это для MacMolPlt.

[Shorku]

Нет, речь о файле .inp

[Aeon9537]

Значит я ошибся. Ну так оно и должно быть?

[Shorku]

Значит я ошибся. Ну так оно и должно быть?

должно быть что? формализуйте пожалуйста свой поток сознания.

В Авогадро наверняка есть функция (не работал с авогадро, но в других рисовалках есть) создания файла .inp с Вашей нарисованной структурой. Потом получивший инпут и скармливается гамессу

[Aeon9537]

Спасибо). Можете ещё помочь?

[Aeon9537]

Странно, что GAMESS у меня работает с командной строки. Или так и должно быть?

[Shorku]

У большинства кв-хим программ нет графического интерфейса.

Упреждая возможные вопросы про инпут, почитайте для начала здесь
http://molecularmodelingbasics.blogspot ... cs_24.html
и здесь
http://www.qchem.ru/d/lect/khsl_qchem/21Lecture-20.pdf

а потом мануал.

[Aeon9537]

Спасибо. А что значит это?

RHF geometry optimization using GAMESS, the optimization is done in Cartesian space (NZVAR=0), this run uses a criterion (OPTTOL) on the gradient, which is tighter than default, but very safe
INPUT CARD>! This job tests the sp integral module, the RHF module,
INPUT CARD>! and the geometry optimization module.
INPUT CARD>!
INPUT CARD>! Using the default search METHOD=STANDARD,
INPUT CARD>! FINAL E= -37.2322678015, 8 iters, RMS grad= .0264308
INPUT CARD>! FINAL E= -37.2351919062, 7 iters, RMS grad= .0202617
INPUT CARD>! FINAL E= -37.2380037239, 7 iters, RMS grad= .0013100
INPUT CARD>! FINAL E= -37.2380352917, 8 iters, RMS grad= .0007519
INPUT CARD>! FINAL E= -37.2380396312, 5 iters, RMS grad= .0001615
INPUT CARD>! FINAL E= -37.2380397693, 5 iters, RMS grad= .0000067
INPUT CARD>! FINAL E= -37.2380397698, 3 iters, RMS grad= .0000004
INPUT CARD>!

[VTur]

Послушайте, мы поможем, как можем, главное понять, что нужно.
Выложитк inp и log (out) файл. Будет немного понятнее

[ Post made via Android ]