Фиксация двухгранных углов через ModRedun

вопросы строения молекул и квантовой химии
Ответить
Аватара пользователя
shvalbe
Сообщения: 243
Зарегистрирован: Пт фев 26, 2010 1:39 am

Фиксация двухгранных углов через ModRedun

Сообщение shvalbe » Вс фев 10, 2013 1:02 pm

Всем доброго дня. Есть необходимость зафиксировать в молекуле три двухгранных угла перед ее оптимизацией (расчет в Гауссиан); должно быть решение через ModRedun, но в просмотренных примерах с этой функцией двухгранних углов я не нашел. Наиболее близкий пример в приложении - как зафиксировать в нем любой двухгранный угол, какую строчку добавить?
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: Фиксация двухгранных углов через ModRedun

Сообщение Гесс » Вс фев 10, 2013 3:09 pm

Не "связи атомов Н", а "hydrogen bond" - водородную связь. Между атомом водорода 8 и кислородом 3.
Соответственно диедральник должен задаваться через номера 4 атомов в правильном порядке.
Фиксируется ли он при этом или нужны дополнительные опции надо читать описание синтаксиса этой функции.

Аватара пользователя
shvalbe
Сообщения: 243
Зарегистрирован: Пт фев 26, 2010 1:39 am

Re: Фиксация двухгранных углов через ModRedun

Сообщение shvalbe » Вс фев 10, 2013 3:25 pm

Поразбирался, нашел.

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 82 гостя