Помогите со статьями по мд моделированию

как найти книгу или статью? не поделится ли кто-нибудь программой? если у вас такой вопрос - значит, вам сюда!
Ответить
Аватара пользователя
ShakaronMakaron
Сообщения: 90
Зарегистрирован: Чт янв 26, 2012 10:58 pm

Помогите со статьями по мд моделированию

Сообщение ShakaronMakaron » Ср апр 25, 2012 8:15 am

Здравствуйте,коллеги.Нет ли у кого-нибудь статей по МД моделированию воды в разных моделях потенциального поля или хотя бы в разных ансамблях?Буду благодарна за любую помощь.

[ Post made via Mobile Device ] Изображение
Don't waste your time or time will waste you

starless

Re: Помогите со статьями по мд моделированию

Сообщение starless » Ср апр 25, 2012 3:21 pm

Вам повезло, что такая статья валяется у меня на диске и что я сегодня добрый. А вообще гуглите.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
ShakaronMakaron
Сообщения: 90
Зарегистрирован: Чт янв 26, 2012 10:58 pm

Re: Помогите со статьями по мд моделированию

Сообщение ShakaronMakaron » Ср апр 25, 2012 11:50 pm

Спасибо огромное.Очень нужная вещь.Гугл не помогает совсем.А нет ли у кого статей,чтоб моделировали именно в NVT ансамбле?
Don't waste your time or time will waste you

starless

Re: Помогите со статьями по мд моделированию

Сообщение starless » Чт апр 26, 2012 12:55 am

А вы посмотрели статьи, цитированные в приведённой? В основном по моделям воды работы достаточно старые.

Аватара пользователя
ShakaronMakaron
Сообщения: 90
Зарегистрирован: Чт янв 26, 2012 10:58 pm

Re: Помогите со статьями по мд моделированию

Сообщение ShakaronMakaron » Пт апр 27, 2012 10:34 pm

Смотрела. Но никто не хочет моделировать водицу в NVT:(
Don't waste your time or time will waste you

starless

Re: Помогите со статьями по мд моделированию

Сообщение starless » Сб апр 28, 2012 12:38 am

А что вы хотите вынести из такого моделирования? Вы хотите моделировать газ? Жидкая вода соответствует NPT же.

Кстати, можно эту тему в физхимию перенести, потому что я позорник и сто лет не перечитывал термодинамику.

Аватара пользователя
ShakaronMakaron
Сообщения: 90
Зарегистрирован: Чт янв 26, 2012 10:58 pm

Re: Помогите со статьями по мд моделированию

Сообщение ShakaronMakaron » Сб апр 28, 2012 12:48 am

Мне тоже интересно,что я хочу оттуда вынести.Но тема звучит так"Сравнительное МД моделирование воды в NPT и NVT ансамблях".В вашей статье очень хорошо о моделях воды,это тоже мне нужно.Но поскольку все моделируют(и совершенно правильно делают) в NPT,то сравнивать мне не с чем.
Don't waste your time or time will waste you

starless

Re: Помогите со статьями по мд моделированию

Сообщение starless » Сб апр 28, 2012 1:10 am

А в чём проблема? Берёте TIP3P, TIP4P и TIP5P и динамите в обоих ансамблях при одинаковых N и T (точек по 100-200 на каждую, по 50 нс), изучаете плотность, однородность, распределение водородных связей, ближний/дальний порядок, температуры плавления и кипения. И пишете статью сами. Если так звучит тема, то не надо думать, надо делать.

Аватара пользователя
ShakaronMakaron
Сообщения: 90
Зарегистрирован: Чт янв 26, 2012 10:58 pm

Re: Помогите со статьями по мд моделированию

Сообщение ShakaronMakaron » Пт май 04, 2012 10:02 pm

В том-то и фишка была,что надо было не моделировать,а найти...Ну да чёрт с ним((
Don't waste your time or time will waste you

Ответить

Вернуться в «обмен книгами, статьями, программами»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 18 гостей