Ещё не один вопрос по "светлячку" :)

вопросы строения молекул и квантовой химии
LKalvin
Сообщения: 393
Зарегистрирован: Ср ноя 17, 2010 10:01 pm

Ещё не один вопрос по "светлячку" :)

Сообщение LKalvin » Сб янв 14, 2012 6:16 pm

Доброго времени суток уважаемые форумчане!

Значит такой вопрос:

Насколько я понял если у меня машина с 2-мя ядрами то для того чтобы в расчёт с "светлячком" у меня участвовали они оба должен быть установлен WMPI
Так вот сам вопрос: мне нужно перед началом расчётов каждый раз его как-то подключать или он сам включается при начале расчётов?

Заранее премного Вам признателен и благодарен!
Последний раз редактировалось LKalvin Вт фев 07, 2012 11:31 pm, всего редактировалось 3 раза.

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Вопрос по "светлячку"

Сообщение sanya1024 » Сб янв 14, 2012 10:29 pm

По-моему, его специально включать не надо.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

Shadin
Сообщения: 490
Зарегистрирован: Вт фев 05, 2008 3:16 pm

Re: Вопрос по "светлячку"

Сообщение Shadin » Вс янв 15, 2012 9:46 am

LKalvin писал(а):нужно перед началом расчётов каждый раз его как-то подключать или он сам включается при начале расчётов?
смотрите сообщение №4 в теме viewtopic.php?t=43874

LKalvin
Сообщения: 393
Зарегистрирован: Ср ноя 17, 2010 10:01 pm

Re: Вопрос по "светлячку"

Сообщение LKalvin » Вс янв 15, 2012 11:42 am

Спасибо Вам большое за советы однако при проведении указанных манипуляций : зайти в папку WMPI1.3 в корне диске C - там войти в папку System, далее в папку serviceNT там запустить файл install_service.bat (появилось окно в котором для запуска данного сервиса попросили нажать любую клавишу, ну я соответственно нажал и окно пропало), а потом запустить файл start_serviсe.bat (также появилось окно в котором для запуска данного сервиса попросили нажать любую клавишу, ну я и здесь соответственно нажал и окно пропало). Однако после выполненных манипуляций служба в списке служб не появилась (да кстати а какое у неё должно быть имя ? [имеется в ввиду если смотреть через Диспетчер задач Windows-Службы]). Также вошёл в список служб через Администрирование - … - Службы (локальные) - сервис WMPI NT Service найден не был (кстати название у него в этой службе должно быть именно : WMPI NT Service или какое нибудь другое?). От чего данное событие могло произойти? У меня стоит 32-х разрядная Windows7 Максимальная. Антивирус : Emisoft Anti-MaleWare.

Shadin
Сообщения: 490
Зарегистрирован: Вт фев 05, 2008 3:16 pm

Re: Вопрос по "светлячку"

Сообщение Shadin » Чт янв 26, 2012 2:33 pm

Кажется в W7 эта служба называется wmi performance adapter

LKalvin
Сообщения: 393
Зарегистрирован: Ср ноя 17, 2010 10:01 pm

Re: Вопрос по "светлячку"

Сообщение LKalvin » Пн янв 30, 2012 1:26 pm

Спасибо за ответ такая служба у меня действительно имеется, будем пробовать ... :beer:

LKalvin
Сообщения: 393
Зарегистрирован: Ср ноя 17, 2010 10:01 pm

Re: Вопрос по "светлячку"

Сообщение LKalvin » Сб фев 04, 2012 9:35 pm

Доброго времени суток уважаемые форумчане!

Заранее прошу простить т.к. знаю что :"Один дурак может задать столько вопросов что и 100 мудрецов не ответят" и всё же из цитированного выше топика

Код: Выделить всё

http://www.chemport.ru/forum/viewtopic.php?t=43874
мне как-то не совсем всё понятно а именно зачем при расчёте одного задания на 2-х ядрах:
5) Создать на диске (напр., на D) две папки с копиями содержимого рабочей папки Гамесс (т.е. со всеми рабочими файлами Гамесс) для счета на двух ядрах. Напр., папки D:\gamess\:work1 и D:\gamess\work2.
ведь как мне кажется два ядра обрабатывая одно задание должны в конце выдать результат в одном файле

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Вопрос по "светлячку"

Сообщение sanya1024 » Сб фев 04, 2012 9:51 pm

Каждому ядру "в зубы" дается папка, куда оно, это ядро, будет складывать временные файлы. Они не дублируются, а скорее суммируются: часть матрицы, обрабатываемая одним ядром, в одной папке, другая -- в другой. Существенный прирост скорости получается, когда эти папки находятся на разных физических дисках -- ядра не конфликтуют за доступ к диску. Но если нет такой возможности -- то нет. А экзешник в каждую папку дублировать не надо. Выдача же создается одна -- в файле *.out
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

LKalvin
Сообщения: 393
Зарегистрирован: Ср ноя 17, 2010 10:01 pm

Re: Вопрос по "светлячку"

Сообщение LKalvin » Сб фев 04, 2012 9:55 pm

Спасибо, понятно

LKalvin
Сообщения: 393
Зарегистрирован: Ср ноя 17, 2010 10:01 pm

Re: Вопрос по "светлячку"

Сообщение LKalvin » Сб фев 04, 2012 10:30 pm

Можно ли мне в таком случае в папке GAMESS иметь экзешник и все остальные файлы библиотек, которые с ним связаны, а также test.inp плюс можно создать в данном каталоге ещё две папки допустим work1 (и скопировать туда test.inp) и work2 (и туда тоже скопировать test.inp) и тогда в строке выполнить вбить следующее:

Код: Выделить всё

[code]C:\GAMESS\pcgamess.exe -i test.inp -o test.out C:\GAMESS\work1 C:\GAMESS\work2 -inp2
[/code]

всё ли я правильно понял или надо как то иначе :shuffle:

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Ещё один вопрос по "светлячку" :)

Сообщение sanya1024 » Вс фев 05, 2012 12:07 am

Если у Вас один физ. и логический диск, то да, можно и так. Но лучше разбивать физ. диск (раз уж он один) на 2 раздела, один из к-рых делать большим -- на нем и считать (т.е., держать временные файлы). А на другом пусть живут все программы (в т.ч. и Гамесс), и инпут с аутпутом. Кстати, не забывайте удалять временные файлы после расчета. Текстовые (PUNCH или *.dat, IRCDATA или *.irc и т.п.) сохраняйте в безопасном месте под внятным именем, а бинарники удаляйте, они могут мешать при последующих расчетах.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

LKalvin
Сообщения: 393
Зарегистрирован: Ср ноя 17, 2010 10:01 pm

Re: Ещё один вопрос по "светлячку" :)

Сообщение LKalvin » Вс фев 05, 2012 12:37 am

Спасибо за ответ, и так сказать вдогонку, извините не удержался, значит начал я расчёт по приведенному выше алгоритму и получается в результате что в одной папке, папке work1 появились файлы :
PUNCH, test.inp, test.out, input, DICTNRY, DFTGRID, DASORT, AOINTS а во второй папке, папке work2 кроме изначально в ней существовавшего test.inp так ничего и не появилось. Это норамльно? Оговорюсь однако заранее что расчёты ещё ведутся.

P.S. простите за навязчивость, просто очень хотелось бы во всём сразу по возможности разобраться

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Ещё один вопрос по "светлячку" :) (и ещё один)

Сообщение sanya1024 » Вс фев 05, 2012 12:41 am

Покажите, плз, начала файла test.out до ECHO OF THE FIRST FEW INPUT CARDS -
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

LKalvin
Сообщения: 393
Зарегистрирован: Ср ноя 17, 2010 10:01 pm

Re: Ещё один вопрос по "светлячку" :) (и ещё один)

Сообщение LKalvin » Вс фев 05, 2012 1:26 am

Вот собственно то о чём Вы говорили
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Ещё один вопрос по "светлячку" :) (и ещё один)

Сообщение sanya1024 » Вс фев 05, 2012 5:28 pm

PARALLEL VERSION (UNIFIED) RUNNING IN SERIAL MODE USING SINGLE PROCESS

У Вас счет идет на 1 ядре. А я еще удивлялась, что за опция -inp2. Действительно, это неправильная опция. Надо -np 2
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

LKalvin
Сообщения: 393
Зарегистрирован: Ср ноя 17, 2010 10:01 pm

Re: Ещё один вопрос по "светлячку" :) (и ещё один)

Сообщение LKalvin » Вс фев 05, 2012 5:50 pm

Спасибо Вам, значит остановил я процесс, в строке выполнить вбил следующее:

Код: Выделить всё

C:\GAMESS\firefly.exe -i test.inp -o test.out C:\GAMESS\work1 C:\GAMESS\work2 -np 2
в итоге программа запустилась, в папке work1 кроме записанного там изначально test.inp создались следующие файлы : PUNCH, test.out, test, DICTNRY, DFTGRID, DASORT, AOINTS в папке же work2 кроме записанного там изначально test.inp создались следующие файлы : DFTGRID, AOINTS

при открытии test.out было следуущее: (прикрепил 2.txt)

Всё ли теперь правильно, как думаете? :shuffle: :shuffle:
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
sanya1024
Сообщения: 1672
Зарегистрирован: Чт янв 20, 2011 3:24 pm

Re: Ещё один вопрос по "светлячку" :) (и ещё один)

Сообщение sanya1024 » Вс фев 05, 2012 7:05 pm

Ага, теперь порядок. Идет на 2 ядрах, файлы кладет куда надо.
Вот и вся моя работа. Стеречь ребят над пропастью во ржи. (Дж. Д. Сэлинджер)

LKalvin
Сообщения: 393
Зарегистрирован: Ср ноя 17, 2010 10:01 pm

Re: Ещё один вопрос по "светлячку" :) (и ещё один)

Сообщение LKalvin » Вс фев 05, 2012 7:29 pm

Спасибо Вам sanya1024 огромное :deal: ! Также хотелось бы узнать в каких единицах программа выдаёт TOTAL ENERGY?

P.S. Спасибо огромное надеюсь я ещё не очень задолбал Вас своими дилетантскими вопросами.

Аватара пользователя
Lantano
Сообщения: 189
Зарегистрирован: Чт окт 09, 2008 10:35 pm

Re: Ещё один вопрос по "светлячку" :) (и ещё один)

Сообщение Lantano » Вс фев 05, 2012 10:16 pm

LKalvin писал(а):в каких единицах программа выдаёт TOTAL ENERGY?
В хартри. 1 Eh = 4.359 743 94(22)×10−18 J = 27.211 383 86(68) eV.
"Если миру не нужен свет - Не беда, проживёт и так.
Если стал не нужен поэт - Не беда, он наймётся в кабак..."

LKalvin
Сообщения: 393
Зарегистрирован: Ср ноя 17, 2010 10:01 pm

Re: Ещё один вопрос по "светлячку" :) (и ещё один)

Сообщение LKalvin » Вс фев 05, 2012 10:29 pm

Спасибо Вам Lantano и sanya1024 огромное :congratulations: ! Фух ну вроде бы со всеми вопросами разобрался. Доволен как слон :D .

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 48 гостей