Нумерация атомов в различных структурных файлах

[lobovan]

Помогите разобраться.

Задача: Существует необходимость сравнения длин связей и валентных углов для структур полученных в результате QM расчетов и данными РСА.
В программах которые выдают таблицы с длинами связей и валентными углами (Mercury, Chemcraft) эти сообщения привязаны к внутренней нумерации, которая тянется со времен создания структуры и, естественно, отличается для различных источников. Подскажите программы с помощью которых (возможно через конвертации между раличными форматами файлов) можно перенумеровать атомы и для нескольких файлов с одной и той же структурой, получить единую нумерацию.

Или может быть существует более простой путь рещения этой задачи.


Заранее спасибо.

[Marxist]

Бабель?

[ИСН]

"Это смотря какая бабель".
По-моему, никак; но мои сведения не из самых свежих.

[VTur]

В ГаусВью, МолДене и ЧемОфисе это делается руками.

[Marxist]

"Это смотря какая бабель".

Ну опенбабель, естественно. Надо смотреть, правда.

[amge]

Подскажите программы с помощью которых (возможно через конвертации между раличными форматами файлов) можно перенумеровать атомы и для нескольких файлов с одной и той же структурой, получить единую нумерацию.

У меня есть парочка самописных программ для этого: для перенумерациии почти вручную и для автоматической перенумерации (последняя может глючить на высокосимметричных структурах). Программы используют формат xyz, который легко получить из любого другого тем же бабелем.