водородные связи и гауссиан

[*xxx*]

Такой вопрос(возможно правда совсем глупый, я только начал разбиратся с гауссианом): каким образом можно провести расчеты частот колебаний не учитывая водородные связи?

[Darth Vasya]

Вы сперва не с гауссианом разберитесь, а с формулировкой вопроса Что такое означает ваше "не учитывая водородные связи"?

[Rusia]

вы не хотите учитывать межмолекулярные взаимодействия?

[*xxx*]

вы не хотите учитывать межмолекулярные взаимодействия?

точнее, я не хочу учитывать внутримолекулярные водородные связи

[N_A_B]

А что значит учитывать?

Можно узнать- как родилась такая задача?

[*xxx*]

А что значит учитывать?

Можно узнать- как родилась такая задача?

при замещении в иследуемой молекуле водорода на дейтерий, в спектре КРС некоторые линие сдвинулись не в низкочастотную область, как обычно происходит при изотопическом сдвиге, а в высокочастотную. Вот и хотелось узнать причиной этому являются водородные связи в недейтерированой молекуле или что-то другое

[VTur]

при замещении в иследуемой молекуле водорода на дейтерий, в спектре КРС некоторые линие сдвинулись не в низкочастотную область, как обычно происходит при изотопическом сдвиге, а в высокочастотную. Вот и хотелось узнать причиной этому являются водородные связи в недейтерированой молекуле или что-то другое

Определение частот состоит из двух задач.
1. Квантами находят валентно-силовое поле (гессиан) в масс-взвешенных координатах.
2. Решают классическую прямую спектральную задачу.
В квантах масс молекул или ядер не существует - это приближение Борна-Оппенгеймера, ядра покоятся.
В классической задаче при увеличении массы частота уменьшается как корень квадратный из отношения масс.
В Гауссиане есть опция Opt=HBond. Но думаю, что относится к межмолекулярному взаимодействию.
Отсюда вывод, синий сдвиг при замещении водорода на дейтерий получит мудрено.

[Lantano]

Если бы водородные связи были какие-то особые, физически отличные от остальных взаимодействий в молекуле, тогда задача была бы решаемой. Но принципиального различия между химической и водородной связью нет. Отсюда "выключить" последние будет весьма проблематично.
Возможно, стоит проанализировать формы интересующих Вас колебаний. Может тогда что-то интересное увидите.

[*xxx*]

В Гауссиане есть опция Opt=HBond.

А не подскажите как ее использовать? В книжке ничего не нашел о ней и Гауссиан ругается, если просто дописать Opt=HBond во входном файле

[*xxx*]

Возможно, стоит проанализировать формы интересующих Вас колебаний. Может тогда что-то интересное увидите.

Молекула довольно большая, поэтому тяжело что-то проанализировать. И хотелось облегчить работу используя гауссиан

[VTur]

В книжке ничего не нашел о ней и Гауссиан ругается, если просто дописать Opt=HBond во входном файле

Что пишет Гауссиан?

[VTur]

Внутренние водородные связи возникают при перераспределении эл. плотности и они значительно длиннее валентных, поэтому для их описания нужно использовать много диффузных функций и желательно поляризованных. Т.е. в базисе должно быть "++". Какой у Вас базис?

Анализ можно провести из сравнения эл. плотностей. Сдвигаются частоты валентных или деформационных частот?

[Lantano]

Возможно, стоит проанализировать формы интересующих Вас колебаний. Может тогда что-то интересное увидите.

Молекула довольно большая, поэтому тяжело что-то проанализировать. И хотелось облегчить работу используя гауссиан

У Вас наблюдается обратный изотопный эффект, причем, как я понимаю, Вы сами не знаете, для каких колебаний (их формы Вы не смотрели). Вы надеетесь всё свалить на водородные связи. А может в этих колебаниях ядра водорода почти не участвуют?
IMHO надо сначала анализировать колебательную задачу, а потом уже думать, какие структурные особенности молекулы (водородная связь или что-то другое) могли так сказаться на величинах частот. И неплохо бы узнать, что за молекула.

[Rusia]

я также занимаюсь изотопными эффектами. Только метод исследований- ЯМР (С-13) спектроскопия. И обычно дейтерий сдвигает химические сдвиги в сильнопольную сторону (за исключением 3-2х атомов)

[VTur]

я также занимаюсь изотопными эффектами. Только метод исследований- ЯМР (С-13) спектроскопия. И обычно дейтерий сдвигает химические сдвиги в сильнопольную сторону (за исключением 3-2х атомов)

Как это сказывается на частотах (силовых постоянных)?

[Rusia]

я также занимаюсь изотопными эффектами. Только метод исследований- ЯМР (С-13) спектроскопия. И обычно дейтерий сдвигает химические сдвиги в сильнопольную сторону (за исключением 3-2х атомов)

Как это сказывается на частотах (силовых постоянных)?

ууу...

только сейчас узнал что это такое. Не подскажите, как рассчитать? Я только рассчитывал оптимизированые геометрии. И барьер перехода протона по водородной связи...

[Yurii]

я также занимаюсь изотопными эффектами. Только метод исследований- ЯМР (С-13) спектроскопия. И обычно дейтерий сдвигает химические сдвиги в сильнопольную сторону (за исключением 3-2х атомов)

Как это сказывается на частотах (силовых постоянных)?

ууу...

только сейчас узнал что это такое. Не подскажите, как рассчитать? Я только рассчитывал оптимизированые геометрии. И барьер перехода протона по водородной связи...

Для водородной связи при расчете необходимо учитывать ангармонизм. Но расчеты, учитывающие ангармонизм, весьма трудоемки.

[VTur]

я также занимаюсь изотопными эффектами. Только метод исследований- ЯМР (С-13) спектроскопия. И обычно дейтерий сдвигает химические сдвиги в сильнопольную сторону (за исключением 3-2х атомов)

Как это сказывается на частотах (силовых постоянных)?

ууу...
только сейчас узнал что это такое. Не подскажите, как рассчитать? Я только рассчитывал оптимизированые геометрии. И барьер перехода протона по водородной связи...

Для водородной связи при расчете необходимо учитывать ангармонизм. Но расчеты, учитывающие ангармонизм, весьма трудоемки.

Если внешние водородные связи, то да, встанет вопрос на чем считать. Я до сих пор не могу здесь подойти к эксперименту, кишка у арифмометров слаба. Если Вы считаете, что это внутренняя водородная связь, хорошего мало, но всё полегче. Сколько атомов в молекуле?

[Yurii]

Сколько атомов в молекуле?

Около 20 и базис приличный (водородная связь между молекулами - скоро статья, а может и не одна, появится на свет божий).

[o-oxhem]

Около 20 и базис приличный (водородная связь между молекулами - скоро статья, а может и не одна, появится на свет божий).

А в каком журнале планируете опубликовать? Очень почитать хочется.