Метаболизм сульфаниламидов в микробной клетке

[A_D]

Уважаемые химики!
Возник такой вопрос: каким ферментом расщепляется молекула сульфаниламида? Мне интересно не столько его название (по идее, это какая-нибудь дегидрофолиаза ), сколько ее аминокислотная последовательность.
Заранее очень благодарен!!!

[Marxist]

Возник такой вопрос: каким ферментом расщепляется молекула сульфаниламида? Мне интересно не столько его название (по идее, это какая-нибудь дегидрофолиаза ), сколько ее аминокислотная последовательность.

Вот как раз Вам надо найти название, а дальше SWISS-PROT к Вашим услугам.

[МЕН]

Механизм д-я сульфаниламида согласно "Вики" таков:
"...Механизм действия связан с конкурентным антагонизмом с ПАБК и конкурентным угнетением фермента дигидроптероатсинтетазы. Это приводит к нарушению синтеза дигидрофолиевой, а затем тетрагидрофолиевой кислоты и в результате — к нарушению синтеза нуклеиновых кислот."

...и в результате микроб гибнет!

То есть, это сульфаниламид является разрушителем ферментов!

[Marxist]

Механизм д-я сульфаниламида согласно "Вики" таков:
"...Механизм действия связан с конкурентным антагонизмом с ПАБК и конкурентным угнетением фермента дигидроптероатсинтетазы. Это приводит к нарушению синтеза дигидрофолиевой, а затем тетрагидрофолиевой кислоты и в результате — к нарушению синтеза нуклеиновых кислот."

...и в результате микроб гибнет!

То есть, это сульфаниламид является разрушителем ферментов!

Батенька, вопрос-то не про механизм действия, а про метаболизм!

[A_D]

A что есть SWISS-PROT и как им пользоваться?

[Myrsten]

То есть, это сульфаниламид является разрушителем ферментов!

Дык... речь идет о конкурентном ингибировании, обратимом процессе, а не об уничтожении фермента, синетзирующего фолиевую кислоту. В результате просто получается "неправильная фолиевая" кислота, в которую вместо ПАБК включается сульфаниламид. Введение ПАБК снимает действие сульфаниламидов, поэтому они несовместимы с новокаином, анестезином.

[МЕН]

... Вот!!! Я и говорю, возможно разрушающий фермент один и его следует искать среди ферментов, расщепляющих местніе анестетики!?

[Myrsten]

... Вот!!! Я и говорю, возможно разрушающий фермент один и его следует искать среди ферментов, расщепляющих местніе анестетики!?

Вряд ли - названные ЛС - сложные эфиры ПАБК (соотв. N,N -диэтиламиноэтиловый и этиловый), и они гидролизуются с образованием ПАБК.

Что касается сульфаниламидов, то надо конкретизировать вопрос :
В сложных структурах вроде сульфадиметоксина каким-либо превращениям может подвергаться гетероциклическая часть. А она в разных ЛС разная.
Ацетилирование по аминогруппе, как пишут в
http://www.antibiotic.ru/ab/056-60.shtml.
Кроме того, бывают и замещенные по аминогруппе, вроде фталозола. Он расщепляется, давая активное вещество по месту применения.

[A_D]

Тем не менее! Как пользоваться SWISS-PROT?
Название тнтересующего меня фермента - дигидроптероатсинтетаза.

[Marxist]

http://cn.expasy.org/sprot/
набираете название в поиске -- он выдаёт информацию об имеющихся последовательностях.

[A_D]

К сожалению, я ничего не нашел. А Вы не подскажите, где можно поискать еще? Как я упоминал выше, меня интересует дигидроптероатсинтетаза...

[Marxist]

К сожалению, я ничего не нашел. А Вы не подскажите, где можно поискать еще? Как я упоминал выше, меня интересует дигидроптероатсинтетаза...

Единственное, что могу посоветовать -- искать синонимы названия. Очень может быть полезен код ЕС. Вообще Свисс-прот -- практически безальтернативный вариант для поиска первичных последовательностей белков. Так же, как, например, ПДБ -- для поиска структур белков.

[pH<7]

Кто бы мог подумать?
http://en.wikipedia.org/wiki/Dihydropteroate_synthetase
ЕС 2.5.1.15

[A_D]

Я извиняюсь за темноту беспросветную, но как найти соединение по ЕС?

[A_D]

Вроде нашел че-то, но кто мне объяснит, что енто значит?
http://cn.expasy.org/cgi-bin/enzyme-sea ... 20Synthase

[Marxist]

http://cn.expasy.org/cgi-bin/get-entrie ... ll&num=100
Вот. Куча последовательностей из разных видов. Из Вашей ссылки находится в два клика. Дальше открываете конкретную последовательность и читаете. Там все заголовки кликабельны и хелп хороший.

[A_D]

Если я правильно понял, это и есть целевая последовательность:
10 20 30 40 50 60
MNKSLIIFGI VNITSDSFSD GGRYLAPDAA IAQARKLMAE GADVIDLGPA SSNPDAAPVS

70 80 90 100 110 120
SDTEIARIAP VLDALKADGI PVSLDSYQPA TQAYALSRGV AYLNDIRGFP DAAFYPQLAK

130 140 150 160 170 180
SSAKLVVMHS VQDGQADRRE APAGDIMDHI AAFFDARIAA LTGAGIKRNR LVLDPGMGFF

190 200 210 220 230 240
LGAAPETSLS VLARFDELRL RFDLPVLLSV SRKSFLRALT GRGPGDVGAA TLAAELAAAA

250 260 270
GGADFIRTHE PRPLRDGLAV LAALKETARI R

Но как ее перевести в набор аминокислот?

[Schlenk]

это и есть "целевая последовательность", она же "набор аминокислот"

http://www.fao.org/DOCREP/004/Y2775E/y2775e0e.htm

[МЕН]

... как это приготовить (в домашних условиях)?

[Schlenk]

никак