Потеря вещества на колонке

форум для специалистов в области органической химии
organic chemistry issues discussion for professional scientists
Аватара пользователя
Алексей Хрущёв
Сообщения: 284
Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm

Потеря вещества на колонке

Сообщение Алексей Хрущёв » Пт ноя 30, 2012 2:20 pm

Добрый день, коллеги!
Существует проблема практически необратимой сорбции вещества на фазу С18 во время препаративной хроматографии, как с набивными колонками так и с заводскими Phenomenex 20х250мм и со многими другими. В случае сильно основных соединений - аргинин-богатых пептидов потери иногда составляют 50%, были случаи когда вещество садилось на 100% и вышибали его буферными растворами с рН=6. Особо остро стоит проблема при использовании безбуферных систем - вода-ацетонитрил, или изопропанол. Подвижная фаза обычно, 0,1% уксусная кислота или безбуферная. Встречался ли кто-нибудь с подобной проблемой?

sav
Сообщения: 109
Зарегистрирован: Пт окт 15, 2010 4:24 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение sav » Пт ноя 30, 2012 2:25 pm

Что сказать... Учите матчасть.

Аватара пользователя
Алексей Хрущёв
Сообщения: 284
Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Алексей Хрущёв » Пт ноя 30, 2012 2:28 pm

Интересно, а поумней ответы будут?

Аватара пользователя
chemist
Сообщения: 10369
Зарегистрирован: Пн июл 26, 2004 2:14 am

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение chemist » Пт ноя 30, 2012 3:11 pm

Аргинил сильно полярный, вряд ли он захочет десорбироваться не сильно полярным элюентом, против природы не порёшь, какие ещё нужны аргументы?
I D E A = A u

Аватара пользователя
Алексей Хрущёв
Сообщения: 284
Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Алексей Хрущёв » Пт ноя 30, 2012 3:20 pm

Ну там кроме аргиника куча всего еще есть. Пептид в целом нормально подходит для обращенки - выходит в 25-30% ацетонитрила, проблема в очень прочном взаимодействии с силанольными группами неподвижной фазы, может есть какой-нибудь модификатор который легко удаляется при упаривании?

Аватара пользователя
Deminolog
Сообщения: 1711
Зарегистрирован: Пт ноя 12, 2010 7:23 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Deminolog » Пт ноя 30, 2012 5:01 pm

Сорбент эндкеппирован?
25-30% по объему ацетонитрила - элюент не очень сильный. Если Вас интересует только один компонент - то зачем городить огород?
В некоторые головы мысли приходят умирать...
Здравствуйте, мои любимые, до боли знакомые грабли... Давно я на вас не наступал...

Аватара пользователя
Любитель_Манниха
флудомастер
Сообщения: 15138
Зарегистрирован: Вт июл 15, 2008 11:55 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Любитель_Манниха » Пт ноя 30, 2012 6:31 pm

были случаи когда вещество садилось на 100% и вышибали его буферными растворами с рН=6
Непонятна проблема. pH = 6 и ниже - вещество разваливается? 0.1% трифторуксусной кислоты в элюенте - адЪ и погибель?
Я лично правами человека накушалась досыта. Некогда и мы,и ЦРУ,и США использовали эту идею как таран для уничтожения коммунистического режима и развала СССР. Эта идея отслужила свое,и хватит врать про права человека и про правозащитников. © Новодворская

Аватара пользователя
Алексей Хрущёв
Сообщения: 284
Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Алексей Хрущёв » Пт ноя 30, 2012 6:41 pm

Deminolog писал(а):Сорбент эндкеппирован?
25-30% по объему ацетонитрила - элюент не очень сильный. Если Вас интересует только один компонент - то зачем городить огород?
Нужно избавться от близко идущих примесей. Проблема в том что севший на колонку продукт потом ничем не смывается...

Аватара пользователя
Алексей Хрущёв
Сообщения: 284
Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Алексей Хрущёв » Пт ноя 30, 2012 7:02 pm

Любитель_Манниха писал(а):
были случаи когда вещество садилось на 100% и вышибали его буферными растворами с рН=6
Непонятна проблема. pH = 6 и ниже - вещество разваливается? 0.1% трифторуксусной кислоты в элюенте - адЪ и погибель?
Я же написал, что обычно используется 0,1% уксусная кислота, рН там около 3, но при этом рН, а еще сильнее в бузбуферной системе вещество садится на колонку, повышение рН снижает в некоторых случаях потери, но не всегда и работать с такими буферами не удобно в случае серьезного препаратива по ряду причин. ТФУ использовать нельзя, поскольку токсична для клеток.
Насколько я знаю все колонки Phenomenex серии Jupiter энд-кэпированы, но это не помогает увы...

Аватара пользователя
Deminolog
Сообщения: 1711
Зарегистрирован: Пт ноя 12, 2010 7:23 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Deminolog » Пт ноя 30, 2012 7:18 pm

Я не случайно задал этот вопрос. Вы же прекрасно понимаете, что эндкеппинг призван закрыть остаточные силанольные группы. Ведь степень сшивки (или загрузки углеродом, если дословно переводить Carbon loading) достаточно мала. Но даже без эндкеппинга они достаточно труднодоступны (стерический фактор), хотя будучи открытыми играют довольно серьезную роль.
Вы используете изократику или градиентный режим элюирования?
В некоторые головы мысли приходят умирать...
Здравствуйте, мои любимые, до боли знакомые грабли... Давно я на вас не наступал...

Аватара пользователя
Алексей Хрущёв
Сообщения: 284
Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Алексей Хрущёв » Пт ноя 30, 2012 7:34 pm

Есть энд-кеппинг, про силанольные группы я знаю :) Используем градиентный режим.

Аватара пользователя
Deminolog
Сообщения: 1711
Зарегистрирован: Пт ноя 12, 2010 7:23 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Deminolog » Пт ноя 30, 2012 8:46 pm

Эт хорошо :) Вы уж простите за лекции ;)
А подробнее? От какого соотношения вода:ацетонитрил до какого? Сколько объемов колонки закладываются на промывку и установление равновесия перед следующим вколом?
В некоторые головы мысли приходят умирать...
Здравствуйте, мои любимые, до боли знакомые грабли... Давно я на вас не наступал...

Аватара пользователя
Алексей Хрущёв
Сообщения: 284
Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Алексей Хрущёв » Пт ноя 30, 2012 9:29 pm

От 10% B до 40% В за 40мин.
А- 0,1% уксус в воде
В -ацетонитрил

Уравновешивание до выравнивания базовой линии, от 5 до 10 объемов.

Аватара пользователя
Deminolog
Сообщения: 1711
Зарегистрирован: Пт ноя 12, 2010 7:23 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Deminolog » Пт ноя 30, 2012 11:05 pm

Попробуйте увеличить долю ацетонитрила. Мне кажется, это может помочь ;)
В некоторые головы мысли приходят умирать...
Здравствуйте, мои любимые, до боли знакомые грабли... Давно я на вас не наступал...

Аватара пользователя
Алексей Хрущёв
Сообщения: 284
Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Алексей Хрущёв » Пт ноя 30, 2012 11:20 pm

Так естественно пробовал не помогает...

Аватара пользователя
Любитель_Манниха
флудомастер
Сообщения: 15138
Зарегистрирован: Вт июл 15, 2008 11:55 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Любитель_Манниха » Сб дек 01, 2012 12:34 am

А какие загрузки? Если колоть меньшие концентрации снижать - та же история? И сколько там, на вскидку, собственно примесей?
Если ли стандартные образцы, если есть, как они себя ведут? Если примеси полимерного характера, то надо как-то от них предварительно чиститься, ИМХО.

PS: Мне как-то кажется, что тут дело не во взаимодействии с силанольными группами (если колонка нормальная). Наверняка есть жЫрные фрагменты в молекулах?

PPS: а TFA потом проблема убрать? :issue:
Я лично правами человека накушалась досыта. Некогда и мы,и ЦРУ,и США использовали эту идею как таран для уничтожения коммунистического режима и развала СССР. Эта идея отслужила свое,и хватит врать про права человека и про правозащитников. © Новодворская

Аватара пользователя
Алексей Хрущёв
Сообщения: 284
Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Алексей Хрущёв » Сб дек 01, 2012 12:31 pm

Любитель_Манниха писал(а):А какие загрузки? Если колоть меньшие концентрации снижать - та же история? И сколько там, на вскидку, собственно примесей?
Если ли стандартные образцы, если есть, как они себя ведут? Если примеси полимерного характера, то надо как-то от них предварительно чиститься, ИМХО.

PS: Мне как-то кажется, что тут дело не во взаимодействии с силанольными группами (если колонка нормальная). Наверняка есть жЫрные фрагменты в молекулах?

PPS: а TFA потом проблема убрать?
На 20мм колонку грузили от 50 до 150 мг результат тот же. Примесей бывает по-разному от 20 до 50%, примеси имеют родственную природу, т.е. пептиды с пропуском аминокислотных остатков, с недоснятыми защитами и т.д. C ТФУ тоже не все однозначно для некоторых соединений и она не помогает, а избавляться от нее придется на той же колонке но в безбуферной среде с большими потерями.

Аватара пользователя
Алексей Хрущёв
Сообщения: 284
Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Алексей Хрущёв » Вс дек 02, 2012 8:22 pm

Препаративщики, ау!
Как же бороться с силанольными группами? Пробовал модифицировать сорбент раствором триметилхлорсилана в хлористом метилене, но безуспешно - сорбция в модельных экспериментах составляет около 40%.

Аватара пользователя
Любитель_Манниха
флудомастер
Сообщения: 15138
Зарегистрирован: Вт июл 15, 2008 11:55 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Любитель_Манниха » Вс дек 02, 2012 9:03 pm

Алексей Хрущёв писал(а): Пробовал модифицировать сорбент раствором триметилхлорсилана в хлористом метилене
Фирменный эндкепированный сорбент C-18 модифицировать TMSCl?
А что говорит литература по поводу хроматографии подобных веществ? Обычно от этого и пляшут.
Может там вообще нужен сорбент не на основе силикагеля.
Да, и - колонка нормальная, тестируете?

PS: позовите в тему Upstream, чтоле, не знаю, заглядывает ли он в аналитику :roll:
Да и вообще, раз тема про препаратив, имеет смысл попросить модераторов перенести в органику.
Я лично правами человека накушалась досыта. Некогда и мы,и ЦРУ,и США использовали эту идею как таран для уничтожения коммунистического режима и развала СССР. Эта идея отслужила свое,и хватит врать про права человека и про правозащитников. © Новодворская

Аватара пользователя
Алексей Хрущёв
Сообщения: 284
Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm

Re: Потеря вещества на колонке

Сообщение Алексей Хрущёв » Вс дек 02, 2012 10:19 pm

Нет, для модификации я взял дешевый не энд-кэпированный сорбент.
Да вещество то собственно обычное - пептид как пептид по большому счету, нигде не удалось найти особых указаний по данному вопросу. Я так понимаю люди просто забивают на эту проблему, ну потерялось 30%-50% да и ладно, издержки производства, так сказать...
Сорбенты на основе полимерной матрицы наверно были бы решением проблемы, но стоят они огого (надо набить колонку 150х500мм)

Ответить

Вернуться в «органическая химия / organic chemistry»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 9 гостей