Потеря вещества на колонке
- Алексей Хрущёв
- Сообщения: 284
- Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm
Потеря вещества на колонке
Добрый день, коллеги!
Существует проблема практически необратимой сорбции вещества на фазу С18 во время препаративной хроматографии, как с набивными колонками так и с заводскими Phenomenex 20х250мм и со многими другими. В случае сильно основных соединений - аргинин-богатых пептидов потери иногда составляют 50%, были случаи когда вещество садилось на 100% и вышибали его буферными растворами с рН=6. Особо остро стоит проблема при использовании безбуферных систем - вода-ацетонитрил, или изопропанол. Подвижная фаза обычно, 0,1% уксусная кислота или безбуферная. Встречался ли кто-нибудь с подобной проблемой?
Существует проблема практически необратимой сорбции вещества на фазу С18 во время препаративной хроматографии, как с набивными колонками так и с заводскими Phenomenex 20х250мм и со многими другими. В случае сильно основных соединений - аргинин-богатых пептидов потери иногда составляют 50%, были случаи когда вещество садилось на 100% и вышибали его буферными растворами с рН=6. Особо остро стоит проблема при использовании безбуферных систем - вода-ацетонитрил, или изопропанол. Подвижная фаза обычно, 0,1% уксусная кислота или безбуферная. Встречался ли кто-нибудь с подобной проблемой?
Re: Потеря вещества на колонке
Что сказать... Учите матчасть.
- Алексей Хрущёв
- Сообщения: 284
- Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm
Re: Потеря вещества на колонке
Интересно, а поумней ответы будут?
Re: Потеря вещества на колонке
Аргинил сильно полярный, вряд ли он захочет десорбироваться не сильно полярным элюентом, против природы не порёшь, какие ещё нужны аргументы?
I D E A = A u
- Алексей Хрущёв
- Сообщения: 284
- Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm
Re: Потеря вещества на колонке
Ну там кроме аргиника куча всего еще есть. Пептид в целом нормально подходит для обращенки - выходит в 25-30% ацетонитрила, проблема в очень прочном взаимодействии с силанольными группами неподвижной фазы, может есть какой-нибудь модификатор который легко удаляется при упаривании?
Re: Потеря вещества на колонке
Сорбент эндкеппирован?
25-30% по объему ацетонитрила - элюент не очень сильный. Если Вас интересует только один компонент - то зачем городить огород?
25-30% по объему ацетонитрила - элюент не очень сильный. Если Вас интересует только один компонент - то зачем городить огород?
В некоторые головы мысли приходят умирать...
Здравствуйте, мои любимые, до боли знакомые грабли... Давно я на вас не наступал...
Здравствуйте, мои любимые, до боли знакомые грабли... Давно я на вас не наступал...
- Любитель_Манниха
- флудомастер
- Сообщения: 15138
- Зарегистрирован: Вт июл 15, 2008 11:55 pm
Re: Потеря вещества на колонке
Непонятна проблема. pH = 6 и ниже - вещество разваливается? 0.1% трифторуксусной кислоты в элюенте - адЪ и погибель?были случаи когда вещество садилось на 100% и вышибали его буферными растворами с рН=6
Я лично правами человека накушалась досыта. Некогда и мы,и ЦРУ,и США использовали эту идею как таран для уничтожения коммунистического режима и развала СССР. Эта идея отслужила свое,и хватит врать про права человека и про правозащитников. © Новодворская
- Алексей Хрущёв
- Сообщения: 284
- Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm
Re: Потеря вещества на колонке
Нужно избавться от близко идущих примесей. Проблема в том что севший на колонку продукт потом ничем не смывается...Deminolog писал(а):Сорбент эндкеппирован?
25-30% по объему ацетонитрила - элюент не очень сильный. Если Вас интересует только один компонент - то зачем городить огород?
- Алексей Хрущёв
- Сообщения: 284
- Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm
Re: Потеря вещества на колонке
Я же написал, что обычно используется 0,1% уксусная кислота, рН там около 3, но при этом рН, а еще сильнее в бузбуферной системе вещество садится на колонку, повышение рН снижает в некоторых случаях потери, но не всегда и работать с такими буферами не удобно в случае серьезного препаратива по ряду причин. ТФУ использовать нельзя, поскольку токсична для клеток.Любитель_Манниха писал(а):Непонятна проблема. pH = 6 и ниже - вещество разваливается? 0.1% трифторуксусной кислоты в элюенте - адЪ и погибель?были случаи когда вещество садилось на 100% и вышибали его буферными растворами с рН=6
Насколько я знаю все колонки Phenomenex серии Jupiter энд-кэпированы, но это не помогает увы...
Re: Потеря вещества на колонке
Я не случайно задал этот вопрос. Вы же прекрасно понимаете, что эндкеппинг призван закрыть остаточные силанольные группы. Ведь степень сшивки (или загрузки углеродом, если дословно переводить Carbon loading) достаточно мала. Но даже без эндкеппинга они достаточно труднодоступны (стерический фактор), хотя будучи открытыми играют довольно серьезную роль.
Вы используете изократику или градиентный режим элюирования?
Вы используете изократику или градиентный режим элюирования?
В некоторые головы мысли приходят умирать...
Здравствуйте, мои любимые, до боли знакомые грабли... Давно я на вас не наступал...
Здравствуйте, мои любимые, до боли знакомые грабли... Давно я на вас не наступал...
- Алексей Хрущёв
- Сообщения: 284
- Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm
Re: Потеря вещества на колонке
Есть энд-кеппинг, про силанольные группы я знаю
Используем градиентный режим.
Re: Потеря вещества на колонке
Эт хорошо
Вы уж простите за лекции 
А подробнее? От какого соотношения вода:ацетонитрил до какого? Сколько объемов колонки закладываются на промывку и установление равновесия перед следующим вколом?
А подробнее? От какого соотношения вода:ацетонитрил до какого? Сколько объемов колонки закладываются на промывку и установление равновесия перед следующим вколом?
В некоторые головы мысли приходят умирать...
Здравствуйте, мои любимые, до боли знакомые грабли... Давно я на вас не наступал...
Здравствуйте, мои любимые, до боли знакомые грабли... Давно я на вас не наступал...
- Алексей Хрущёв
- Сообщения: 284
- Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm
Re: Потеря вещества на колонке
От 10% B до 40% В за 40мин.
А- 0,1% уксус в воде
В -ацетонитрил
Уравновешивание до выравнивания базовой линии, от 5 до 10 объемов.
А- 0,1% уксус в воде
В -ацетонитрил
Уравновешивание до выравнивания базовой линии, от 5 до 10 объемов.
Re: Потеря вещества на колонке
Попробуйте увеличить долю ацетонитрила. Мне кажется, это может помочь 
В некоторые головы мысли приходят умирать...
Здравствуйте, мои любимые, до боли знакомые грабли... Давно я на вас не наступал...
Здравствуйте, мои любимые, до боли знакомые грабли... Давно я на вас не наступал...
- Алексей Хрущёв
- Сообщения: 284
- Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm
Re: Потеря вещества на колонке
Так естественно пробовал не помогает...
- Любитель_Манниха
- флудомастер
- Сообщения: 15138
- Зарегистрирован: Вт июл 15, 2008 11:55 pm
Re: Потеря вещества на колонке
А какие загрузки? Если колоть меньшие концентрации снижать - та же история? И сколько там, на вскидку, собственно примесей?
Если ли стандартные образцы, если есть, как они себя ведут? Если примеси полимерного характера, то надо как-то от них предварительно чиститься, ИМХО.
PS: Мне как-то кажется, что тут дело не во взаимодействии с силанольными группами (если колонка нормальная). Наверняка есть жЫрные фрагменты в молекулах?
PPS: а TFA потом проблема убрать?
Если ли стандартные образцы, если есть, как они себя ведут? Если примеси полимерного характера, то надо как-то от них предварительно чиститься, ИМХО.
PS: Мне как-то кажется, что тут дело не во взаимодействии с силанольными группами (если колонка нормальная). Наверняка есть жЫрные фрагменты в молекулах?
PPS: а TFA потом проблема убрать?
Я лично правами человека накушалась досыта. Некогда и мы,и ЦРУ,и США использовали эту идею как таран для уничтожения коммунистического режима и развала СССР. Эта идея отслужила свое,и хватит врать про права человека и про правозащитников. © Новодворская
- Алексей Хрущёв
- Сообщения: 284
- Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm
Re: Потеря вещества на колонке
На 20мм колонку грузили от 50 до 150 мг результат тот же. Примесей бывает по-разному от 20 до 50%, примеси имеют родственную природу, т.е. пептиды с пропуском аминокислотных остатков, с недоснятыми защитами и т.д. C ТФУ тоже не все однозначно для некоторых соединений и она не помогает, а избавляться от нее придется на той же колонке но в безбуферной среде с большими потерями.Любитель_Манниха писал(а):А какие загрузки? Если колоть меньшие концентрации снижать - та же история? И сколько там, на вскидку, собственно примесей?
Если ли стандартные образцы, если есть, как они себя ведут? Если примеси полимерного характера, то надо как-то от них предварительно чиститься, ИМХО.
PS: Мне как-то кажется, что тут дело не во взаимодействии с силанольными группами (если колонка нормальная). Наверняка есть жЫрные фрагменты в молекулах?
PPS: а TFA потом проблема убрать?
- Алексей Хрущёв
- Сообщения: 284
- Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm
Re: Потеря вещества на колонке
Препаративщики, ау!
Как же бороться с силанольными группами? Пробовал модифицировать сорбент раствором триметилхлорсилана в хлористом метилене, но безуспешно - сорбция в модельных экспериментах составляет около 40%.
Как же бороться с силанольными группами? Пробовал модифицировать сорбент раствором триметилхлорсилана в хлористом метилене, но безуспешно - сорбция в модельных экспериментах составляет около 40%.
- Любитель_Манниха
- флудомастер
- Сообщения: 15138
- Зарегистрирован: Вт июл 15, 2008 11:55 pm
Re: Потеря вещества на колонке
Фирменный эндкепированный сорбент C-18 модифицировать TMSCl?Алексей Хрущёв писал(а): Пробовал модифицировать сорбент раствором триметилхлорсилана в хлористом метилене
А что говорит литература по поводу хроматографии подобных веществ? Обычно от этого и пляшут.
Может там вообще нужен сорбент не на основе силикагеля.
Да, и - колонка нормальная, тестируете?
PS: позовите в тему Upstream, чтоле, не знаю, заглядывает ли он в аналитику
Да и вообще, раз тема про препаратив, имеет смысл попросить модераторов перенести в органику.
Я лично правами человека накушалась досыта. Некогда и мы,и ЦРУ,и США использовали эту идею как таран для уничтожения коммунистического режима и развала СССР. Эта идея отслужила свое,и хватит врать про права человека и про правозащитников. © Новодворская
- Алексей Хрущёв
- Сообщения: 284
- Зарегистрирован: Чт окт 06, 2005 5:21 pm
Re: Потеря вещества на колонке
Нет, для модификации я взял дешевый не энд-кэпированный сорбент.
Да вещество то собственно обычное - пептид как пептид по большому счету, нигде не удалось найти особых указаний по данному вопросу. Я так понимаю люди просто забивают на эту проблему, ну потерялось 30%-50% да и ладно, издержки производства, так сказать...
Сорбенты на основе полимерной матрицы наверно были бы решением проблемы, но стоят они огого (надо набить колонку 150х500мм)
Да вещество то собственно обычное - пептид как пептид по большому счету, нигде не удалось найти особых указаний по данному вопросу. Я так понимаю люди просто забивают на эту проблему, ну потерялось 30%-50% да и ладно, издержки производства, так сказать...
Сорбенты на основе полимерной матрицы наверно были бы решением проблемы, но стоят они огого (надо набить колонку 150х500мм)
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 9 гостей