Здравствуйте, товарищи.
Допустим, есть SMILES для какого-то органического соединения.
Я правильно понимаю, что чтобы найти, есть ли в этом соединении какая-то функциональная группа (или подструктура), достаточно проверить, является ли SMILES этой группы подстрокой SMILES исходного соединения?
SMILES, поиск функциональных групп
-
allchemist
- Сообщения: 8
- Зарегистрирован: Вс мар 14, 2010 9:09 pm
-
Marxist
Re: SMILES, поиск функциональных групп
Нет. Надо составить запрос SMARTS и проверять SMILES на его наличие.
-
allchemist
- Сообщения: 8
- Зарегистрирован: Вс мар 14, 2010 9:09 pm
Re: SMILES, поиск функциональных групп
Спасибо. 
И openbabel с этим, оказывается, отлично справляется.
И openbabel с этим, оказывается, отлично справляется.
Кто сейчас на конференции
Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 6 гостей