SMILES, поиск функциональных групп

форум для специалистов в области органической химии
organic chemistry issues discussion for professional scientists
Ответить
allchemist
Сообщения: 8
Зарегистрирован: Вс мар 14, 2010 9:09 pm

SMILES, поиск функциональных групп

Сообщение allchemist » Пн дек 27, 2010 9:17 pm

Здравствуйте, товарищи.

Допустим, есть SMILES для какого-то органического соединения.
Я правильно понимаю, что чтобы найти, есть ли в этом соединении какая-то функциональная группа (или подструктура), достаточно проверить, является ли SMILES этой группы подстрокой SMILES исходного соединения?

Marxist

Re: SMILES, поиск функциональных групп

Сообщение Marxist » Пн дек 27, 2010 9:32 pm

Нет. Надо составить запрос SMARTS и проверять SMILES на его наличие.

allchemist
Сообщения: 8
Зарегистрирован: Вс мар 14, 2010 9:09 pm

Re: SMILES, поиск функциональных групп

Сообщение allchemist » Пн дек 27, 2010 10:21 pm

Спасибо. :)

И openbabel с этим, оказывается, отлично справляется.

Ответить

Вернуться в «органическая химия / organic chemistry»

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и 6 гостей